hsa ------CCCAGCCUAACCAAUGUGCAGACUACUGUACACAUUGAGAGCCUCCUGAACAGGUAGUCUGAACACUGGGUUGGCGGG------ UCSC ENSEMBL 19:10928098-10928176(+) -31.4 (((.(((...(((.(((.(((((((((((.((....(((...))).)).))).)))))))).))).)))...))))))
ptr ------------------------------------------------------------------------------------------
ggo ------CCCAGCCUAACCAAUGUGCAGACUACUGUACACAUUGAGAGCCUCCUGAACAGGUAGUCUGAACACUGGGUUGGCGGG------ ENSEMBL 19:11053297-11053375(+) -31.4 (((.(((...(((.(((.(((((((((((.((....(((...))).)).))).)))))))).))).)))...))))))
ppy ------CCCAGCCUAACCAAUGUGCAGACUACUGUACACAUUGAGAGCCUCCUGAACAGGUAGUCUGAACACUGGGUUGGCGGG------ UCSC ENSEMBL 19:10962007-10962085(+) -31.4 (((.(((...(((.(((.(((((((((((.((....(((...))).)).))).)))))))).))).)))...))))))
mml ------CCCAGCCUAACCAAUGUGCAGACUACUGUACACGUUGAGAGCCUCCUGAACAGGUAGUCUGAACACUGGGUUGGCG-------- UCSC ENSEMBL 19:10626276-10626352(+) -29.2 ....(((...(((.(((.(((((((((......(((.((......)).))).))))))))).))).)))...))).
cja ------CCCAGCCUAACCAAUGUGCAGACUACUGUACACAUUGACGGCCUCCUGAACAGGUAGUCUGAACACUGGGUUGGCGGG------ ENSEMBL Contig258:2946313-2946391(-) -29.94 (((.(((...(((.(((.(((((((((((.((..............)).))).)))))))).))).)))...))))))
tsy ------------------------------------------------------------------------------------------
mmr ------CCCAGUCUAACCAAUGUGCAGACUACUGUACAA--CGGCAUUGUCCUGAACAGGUAGUCUGAACACUGGGGCGACGGA------ ENSEMBL GeneScaffold_76:347859-347935(+) -27.2 .((.(((...(((.(((.(((((((((((.((..(((...))).)).))).)))))))).))).)))...))))).
oga ------------------------------------------------------------------------------------------
tbe ------CCCAGUCUAACCAAUGUGCAGACUACUGUACAA--CGGCAUUGUCCUGAACAGGUAGUCUGAACACUGGGGCGACGGA------ ENSEMBL scaffold_14747:70048-70124(-) -27.2 .((.(((...(((.(((.(((((((((((.((..(((...))).)).))).)))))))).))).)))...))))).
cpo ------CCCAGCCUAACCAAUGUGCAGACUACUGUACACAUGCAGAGGCGCCUGAACAGGUAGUCUGAACACUGGGCCGG---------- UCSC ENSEMBL scaffold_226:180910-180984(+) -27.2 .((.(((((.....(((.(((((((((((.((..(((....)))..)).))).)))))))).))).))))).))
dor ------------------------------------------------------------------------------------------
mmu ------CCCAGCCUAACCAAUGUGCAGACUACUGUACAUGUCC-CAGCCUCCUGAACAGGUAGUCUGAACACUGGGAUGGCGGG------ UCSC ENSEMBL 9:21300935-21301012(+) -31.2 (((.(((...(((.(((.(((((((((.....(((..(((....))).)))))))))))).))).)))...))))))
rno ------CCCAGUCUAACCAAUGUGCAGACUACUGUACAA--CGGCAUUGUCCUGAACAGGUAGUCUGAACACUGGGGCGACGGA------ UCSC ENSEMBL 13:77910833-77910909(-) -27.2 .((.(((...(((.(((.(((((((((((.((..(((...))).)).))).)))))))).))).)))...))))).
str ------CCCAGCCUAACCAAUGUGCAGACUACUGUACACAUUCAGAGCCUCCUGAACAC-UAGUCUGAACACUGGGAUGGCGGG------ ENSEMBL GeneScaffold_2212:324024-324101(+) -30.7 (((.(((...(((.(((.(((((((.(((......((((......))))))).))))))).))).)))...))))))
opr ------CCCAGUCUAACCAAUGUGCAGACUACUGUACAA--CGGCAUUGUCCUGAACAGGUAGUCUGAACACUGGGGCGACGGA------ ENSEMBL scaffold_2153:77667-77743(+) -27.2 .((.(((...(((.(((.(((((((((((.((..(((...))).)).))).)))))))).))).)))...))))).
ocu ------CCCAGCCUAACCAAUGUGCAGACUACUGUACACAUCUGGAGUCCCCUGAACAGGUAGUCUGAACACUGGGCGGGCG-------- ENSEMBL scaffold_311:201980-202056(-) -30.7 ....((((..(((.(((.(((((((((((.....((.((.....)).))))).)))))))).))).)))..)))).
bta ------CCCAGCCUAACCAAUGUGCAGACUACUGUACACAUUCAGAGCCCCCUGAACAGGUAGUCUGAACACUGGGUUGGCGGG------ miRbase UCSC ENSEMBL 7:13733556-13733633(+) -33.5 (((.(((...(((.(((.(((((((((.......(((((......)))))..))))))))).))).)))...))))))
ttr ------CCCAGCCUAACCAAUGUGCAGACUACUGUACACAUUCAGAGCCCCCUGAACAGGUAGUCUGAACACUGGGUUGGCGGG------ ENSEMBL GeneScaffold_1208:179136-179214(+) -33.5 (((.(((...(((.(((.(((((((((.......(((((......)))))..))))))))).))).)))...))))))
vpa ------CCCAGUCUAACCAAUGUGCAGACUACUGUACAA--CGGCAUUGUCCUGAACAGGUAGUCUGAACACUGGGGCGACGGA------ ENSEMBL GeneScaffold_108:412238-412314(+) -27.2 .((.(((...(((.(((.(((((((((((.((..(((...))).)).))).)))))))).))).)))...))))).
ssc ------CCCAGCCUAACCAAUGUGCAGACUACUGUACACAUUCAGAGCCCCCUGAACAGGUAGUCUGAACACUGGGUUGGCGGG------ ENSEMBL 2:52684958-52685036(+) -33.5 (((.(((...(((.(((.(((((((((.......(((((......)))))..))))))))).))).)))...))))))
cfa ------CCCAGCCUAACCAAUGUGCAGACUACUGUACACAUUCAGAGCCCCCUGAACAGGUAGUCUGAACACUGGGUUGGCGGG------ UCSC ENSEMBL 20:53414679-53414757(-) -33.5 (((.(((...(((.(((.(((((((((.......(((((......)))))..))))))))).))).)))...))))))
fca ------CCCAGCCUAACCAAUGUGCAGACUACUGUACACAUUCAGAACCCCCUGAACAGGUAGUCUGAACACUGGGUGGGCGGG------ ENSEMBL GeneScaffold_4666:344127-344205(+) -35.7 (((.(((((.(((.(((.(((((((((.......(((((......)))))..))))))))).))).))).))))))))
eca ------CCCAGCCUAACCAAUGUGCAGACUACUGUACACAUUCGGAGCCCCCUGAACAGGUAGUCUGAACACUGGGCGGG---------- UCSC ENSEMBL 7:49327230-49327304(-) -27.0 (((.(((((.....(((.(((((((((.......(((((......)))))..))))))))).))).))))))))
mlu ------CCCAGCCUAACCAAUGUGCAGACUACUGUACACAUUCAGAGCCCCCUGAACAGGUAGUCUGAACACUGGGUUGGCGGG------ ENSEMBL GeneScaffold_2199:170938-171016(+) -33.5 (((.(((...(((.(((.(((((((((.......(((((......)))))..))))))))).))).)))...))))))
pva ------CCCAGCCUAACCAAUGUGCAGACUACUGUACACAUUCAGAGCCCCCUGAACAGGUAGUCUGAACACUGGGCUGGCGGG------ ENSEMBL GeneScaffold_1402:159193-159271(+) -33.5 (((.(((...(((.(((.(((((((((.......(((((......)))))..))))))))).))).)))...))))))
eeu ------CCCAGUCUAACCAAUGUGCAGACUACUGUACAA--CGGCAUUGUCCUGAACAGGUAGUCUGAACACUGGGCCGACGGA------ ENSEMBL scaffold_371982:39901-39977(+) -27.2 .((.(((...(((.(((.(((((((((((.((..(((...))).)).))).)))))))).))).)))...))))).
sar ------------------------------------------------------------------------------------------
cho ------CCCAGUCUAACCAAUGUGCAGACUACUGUACAA--CGGCAUUGUCCUGAACAGGUAGUCUGAACACUGGGGCGACGGA------ ENSEMBL scaffold_39704:7122-7198(-) -27.2 .((.(((...(((.(((.(((((((((((.((..(((...))).)).))).)))))))).))).)))...))))).
ete ------CCCAGUCUAACCAAUGUGCAGACUACUGUACAA--CGGCAUUGUCCUGAACAGGUAGUCUGAACACUGGGGCGACGGA------ ENSEMBL scaffold_313277:38639-38715(-) -27.2 .((.(((...(((.(((.(((((((((((.((..(((...))).)).))).)))))))).))).)))...))))).
laf ------CCCAGCCUAACCAAUGUGCAGACUACUGUACACAUUCAGAACCCC-UGAACAGGUAGUCUGAACACUGGGUUGGCGGG------ ENSEMBL scaffold_26:32928972-32929049(-) -33.3 (((.(((...(((.(((.(((((((((.......(((((.....)))))..))))))))).))).)))...))))))
pca ----------GCCUAACCAAUGUGCAGACUACUGUACACAUUCAGAACCCC-UGAACAGGUAGUCUGAACACUGGGUUGGCGGG------ ENSEMBL GeneScaffold_7523:112040-112113(+) -29.8 (((...(((.(((.(((((((((.......(((((.....)))))..))))))))).))).)))...)))...
meu ------CCCAGCCUAACCAAUGUGCAGACUACUGUACACAUUUGCAAUCUCCUGGACAGGUAGUCUGAACACUGGGCUGGUG-------- ENSEMBL GeneScaffold_1068:45606-45682(+) -27.5 .((((((((.....(((.(((((((((((...((............)).))).)))))))).))).))))))))..
mdo UCCAAGCCCAGCCUAACCAAUGUGCAGACUACUGUACACCUUUGCAAUCUCCUGGACAGGUAGUCUGAACACUGGGCUGGUGGGGCUGGA UCSC ENSEMBL 3:430288127-430288217(-) -39.12 ((((.((((.(((...(((.(((.(((((((((.....((.............))...))))))))).))).)))...))).))))))))
oan ------------------------------------------------------------------------------------------
gga ----UGCCCAGUCUAACCAAUGUGCAGACUACUGUACAA--CAGCAUUGUCCUGAACAGGUAGUCUGAACACUGGGGCGACGGAGC---- UCSC ENSEMBL 8:4732835-4732915(-) -28.2 .((((.(((...(((.(((.(((((((((((.((((......))..)).))).)))))))).))).)))...))))).))
mga ----UGCCCAGUCUAACCAAUGUGCAGACUACUGUACAA--CAGCAUUGUCCUGAACAGGUAGUCUGAACACUGGGGCGACGGAGC---- UCSC ENSEMBL 10:6290427-6290507(+) -28.2 .((((.(((...(((.(((.(((((((((((.((((......))..)).))).)))))))).))).)))...))))).))
tgu ------------------------------------------------------------------------------------------
aca ------CCCAGUCUAACCAAUGUGCAGACUACUGUACACCUUUGUAGCUUCCUGAACAGGUAGUCUGAACACUGGGAAGGCGGG------ UCSC ENSEMBL scaffold_86:429129-429207(-) -29.44 (((.((((..(((.(((.(((((((((((.((..............)).))).)))))))).))).)))..)))))))
xtr ----UGCCCAGUCUAACCAAUGUGCAGACUACUGUACAA--CAGCAUUGUCCUGAACAGGUAGUCUGAACACUGGGGCGACGGAGC---- UCSC ENSEMBL scaffold_85:1809320-1809400(+) -28.2 .((((.(((...(((.(((.(((((((((((.((((......))..)).))).)))))))).))).)))...))))).))
dre --CUCACUCAGCCUAACCAAUGUGCAGACUACUGUACAA--UCUCUACGCCCUGAACAGGUAGUCUGAACACUGGGAAAGCAGAGCGGGC UCSC ENSEMBL 5:65584114-65584200(-) -28.7 (((.(((.((....(((.(((.(((((((((((.((............)).))).)))))))).))).)))....)).))).))).
gac -------CCAGCCUAACCAAUGUGCAGACUACUGUACAA--CCACUACUUCCUGAACAGGUAGUCUGAACACUGGGCAGGCG-------- UCSC ENSEMBL groupXIV:5349711-5349784(-) -29.3 ...((((..(((.(((.(((((((((((.((............)).))).)))))))).))).)))..)))).
ola -------CCAGCCUAACCAAUGUGCAGACUACUGUACAA--CCACUACUUCCUGAACAGGUAGUCUGAACACUGGGCAGGCG-------- UCSC ENSEMBL 12:11677504-11677577(-) -29.3 ...((((..(((.(((.(((((((((((.((............)).))).)))))))).))).)))..)))).
tru -------CCAGCCUAACCAAUGUGCAGACUACUGUACAA--CCACUACUUCCUGAACAGGUAGUCUGAACACUGGGCAGGCG-------- UCSC ENSEMBL scaffold_27:1718168-1718241(-) -29.3 ...((((..(((.(((.(((((((((((.((............)).))).)))))))).))).)))..)))).
tni -------CCAGCCUAACCAAUGUGCAGACUACUGUACAA--CCACUACUUCCUGAACAGGUAGUCUGAACACUGGGCAGGCG-------- UCSC ENSEMBL 4:2900521-2900594(+) -29.3 ...((((..(((.(((.(((((((((((.((............)).))).)))))))).))).)))..)))).
cin ------------------------------------------------------------------------------------------
csa ------------------------------------------------------------------------------------------
dme ------------------------------------------------------------------------------------------
cel ------------------------------------------------------------------------------------------
* ************************** * ** *** ****************
*** ************************** * ** ********************* *
**** ************************** ************************** *
**** ************************** ************************** * *
**** ************************** ************************** * **
***** ************************** ************************** * **
***** ************************** * ************************** * **
***** ************************** * ************************** * **
***** ************************** * ************************** * **
***** ************************** * ************************** * ***
***** ************************** * ************************** * ***
***** ************************** * ************************** *****
******************************** * ************************** *****
******************************** * *************************** *****
******************************** * *************************** *****
******************************** * * *************************** *****
******************************** * * * *************************** *****
********************************* * * ***************************** *****
********************************* ** *** ***************************** *****
********************************* ** *** ***************************** *****
**************************************** ***************************** *****
********************************************************************** *******
********************************************************************** *******
********************************************************************** *******
********************************************************************** *******
******************************************************************************
******************************************************************************
******************************************************************************
******************************************************************************
******************************************************************************
******************************************************************************
******************************************************************************
******************************************************************************
********************************************************************************
*********************************************************************************
**********************************************************************************
* ********************************************************************************** **
******************************************************************************************