hsa ----------------------UGUUGUCGGGUGGAUCACGAUGCAA-UUU-----UGAUGAGUAUCAUAGGAGAAAAA-UUGCACGGUAUCCAUCUGUAAACC------------------------ miRbase UCSC ENSEMBL X:133303408-133303482(-) -25.4 .(((..(((((((((..((.(((((((((.(((.....)))......)))))))))))..)))))))))..))).
ptr --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
ggo ----------------UUUUGCUGUUGUCGGGUGGAUCACGAUGCAA-UUU-----UGAUGAGUAUCAUAGGAGAAAAA-UUGCACGGUAUCCAUCUGUAAACCGCAGGA------------------ ENSEMBL X:132087019-132087106(-) -31.6 ((((((.(((..(((((((((..((.(((((((((.(((.....)))......)))))))))))..)))))))))..))).))))))
ppy ----------------------UGUUGUCGGGUGGAUCACGAUGCAA-UUU-----UGAUUAGUAUCAUAGGAGAAAAA-UUGCACGGUAUCCAUCUGUAAACC------------------------ miRbase UCSC ENSEMBL X:133612303-133612377(-) -25.0 .(((..(((((((((..((.(((((((((..(((......)))....)))))))))))..)))))))))..))).
mml ----------------------UGUUGUCGGGUGGAUCACGAUGCAA-UUU-----UGAUUAGUAUCAUAGGAGAAAAA-UUGCACGGUAUCCAUCUGUAAACC------------------------ miRbase UCSC ENSEMBL X:132386867-132386941(-) -25.0 .(((..(((((((((..((.(((((((((..(((......)))....)))))))))))..)))))))))..))).
cja ----------------UUUUGCUGUUGUCGGGUGGAUCACGAUGCAA-UUU-----UGAUUAGUAUCAUAGGAGAAAAA-UUGCACGGUAUCCAUCUGUAAACCGCAGGA------------------ ENSEMBL Contig251:2019123-2019210(-) -31.2 ((((((.(((..(((((((((..((.(((((((((..(((......)))....)))))))))))..)))))))))..))).))))))
tsy --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
mmr ----------------UUUUGCUGUUGUCGGGUGGAUCACGAUGCAA-UUU-----UGACUAGUAUAAUAGGAGAAAAA-UUGCACGGUAUCCAUCUGUAAACCGCAGGA------------------ ENSEMBL scaffold_4914:55147-55234(-) -33.4 ((((((.(((..(((((((((..((.(((((((((..(((......)))....)))))))))))..)))))))))..))).))))))
oga ----------------UUUUGCUGUUGUCGGGUGGAUCACGAUGCAA-UUU-----UGAUUAGCAUAAUAGGAGAAAAA-UUGCACGGUAUCCAUCUGUAAACCGCAGGA------------------ ENSEMBL scaffold_118956:87430-87517(-) -31.2 ((((((.(((..(((((((((..((.(((((((((..(((......)))....)))))))))))..)))))))))..))).))))))
tbe ----------------UUUUGCUGUUGUCGGGUGGAUCACGAUGCAA-UUU-----UGAUUAGUAUAAUAGGAGAAAAA-UUGCACGGUAUCCAUCUGUAAACCGCAGGA------------------ ENSEMBL scaffold_149063:60869-60956(-) -31.2 ((((((.(((..(((((((((..((.(((((((((..(((......)))....)))))))))))..)))))))))..))).))))))
cpo ----------------UUUUGCUGUUGUCGGGUGGAUCACGAUGCAA-UUU-----UGAUUAGACUAAUAGGAGAAAAA-UUGCACGGUAUCCAUCUGUAAACCGCAGGA------------------ UCSC ENSEMBL scaffold_128:2512241-2512328(-) -31.2 ((((((.(((..(((((((((..((.(((((((((..(((......)))....)))))))))))..)))))))))..))).))))))
dor ----------------UUUUGCUGUUGUCGGGUGGAUCACGAUGCAA-UUU-----UGAUUAGUAUCUUAGGAGAAAAA-UUGCACGGUAUCCAUCUGUAAACCGCAGGA------------------ ENSEMBL scaffold_19828:17689-17776(-) -30.8 ((((((.(((..(((((((((..((.(((((((((..((((....))))....)))))))))))..)))))))))..))).))))))
mmu ----------------------UGUUAUCAGGUGGAACACGAUGCAA-UUU-----UGGUUGGUGUAAUAGGAGGAAAA-UUGCACGGUAUCCAUCUGUAAACC------------------------ miRbase UCSC ENSEMBL X:50094870-50094944(-) -22.3 .(((..((((((((((.((.(((((((((..((..........))..))))))))))))).))))))))..))).
rno ----------------UUUUGCUGUUAUCGGGUGGAUCACGAUGCAA-UUU-----UGAUUAGAGUAAUGGGAGAGAAA-UUGCACGGUAUCCAUCUGUAAACCGCAGGA------------------ miRbase UCSC ENSEMBL X:139740651-139740737(-) -31.0 ((((((.(((..(((((((((..((.(((((((((..(((......)))....)))))))))))..)))))))))..))).))))))
str ----------------UUUUGCUGUUGUCGGGUGGAUCACGAUGCAA-UUU-----UGAUUAGUAAAAUAGGAGAAAAA-UUGCACGGUAUCCAUCUGUAAACCGCAGGA------------------ ENSEMBL GeneScaffold_5834:62126-62213(-) -31.2 ((((((.(((..(((((((((..((.(((((((((..(((......)))....)))))))))))..)))))))))..))).))))))
opr --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
ocu ----------------UUUUGCUGUUGUCGGGUGGAUCACGAUGCAA-UUU-----UGAUUAGUACAAUAGGAGAAAAA-UUGCACGGUAUCCAUCUGUAAACCGCAGGA------------------ ENSEMBL scaffold_31:22344435-22344522(-) -31.2 ((((((.(((..(((((((((..((.(((((((((..(((......)))....)))))))))))..)))))))))..))).))))))
bta ----------------------UGUUGUCGGGUGGAUCACGAUGCAA-UUU-----UGAUUAGUAUAAUAGGAGAAAAA-UUGCACGGUAUCCAUCUGCGAAC------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL Un.004.53:180833-180906(-) -25.8 ..(((.(((((((((..((.(((((((((..(((......)))....)))))))))))..))))))))))))..
ttr ----------------UUUUGCUGUUGUCGGGUGGAUCACGAUGCAA-UUU-----UGAUUAGUAUAAUAGGAGAAAAA-UUGCACGGUAUCCAUCUGUAAACCGCAGGA------------------ ENSEMBL GeneScaffold_3447:23095-23182(-) -31.2 ((((((.(((..(((((((((..((.(((((((((..(((......)))....)))))))))))..)))))))))..))).))))))
vpa --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
ssc --------------------GCUGUUGUCGGGUGGAUCACGAUGCAA-UUU-----UGAUUAGUAUCAUAGGAGAAAAA-UUGCACGGUAUCCAUCUGUAAACCGCA--------------------- miRbase ENSEMBL X:108178321-108178400(-) -28.9 ((.(((..(((((((((..((.(((((((((..(((......)))....)))))))))))..)))))))))..))).)).
cfa ---------------------------UCGGGUGGAUCACGAUGCAA-UUU-----UGAUGAGUAUAAUAGGAGAAAAA-UUGCACGGUAUCCAUCUGUAA--------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL X:107957362-107957428(-) -22.57 .(((((((((..((.(((((((((..................)))))))))))..)))))))))...
fca ----------------UUUUGCUGUUGUCGGGUGGAUCACGAUGCAA-UUU-----UGAUUAGUAUAAUAGGAGAAAAA-UUGCACGGUAUCCAUCUGUAAACCGCAGGA------------------ ENSEMBL scaffold_204821:4338-4425(-) -31.2 ((((((.(((..(((((((((..((.(((((((((..(((......)))....)))))))))))..)))))))))..))).))))))
eca ----------------------UGUUGUCGGGUGGAUCACGAUGCAA-UUU-----UGAUUAGUAUAAUAGGAGAAAAA-UUGCACGGUAUCCAUCUGUAAACC------------------------ miRbase UCSC ENSEMBL X:106691883-106691957(-) -25.0 .(((..(((((((((..((.(((((((((..(((......)))....)))))))))))..)))))))))..))).
mlu ------------------UUGCUGUUGUCGGGUGGAUCACGAUGCAA-UUU-----UGAUUAGUAUAAUAGGUGAAAAA-UUGCACGGUAUCCAUCUGUAAACCGCAGGA------------------ ENSEMBL scaffold_192915:5404-5489(-) -30.2 ((((.(((..(((((((((..((.(((((((((..(((......)))....)))))))))))..)))))))))..))).))))..
pva ----------------UUUUGCUGUUGUCGGGUGGAUCACGAUGCAA-UUU-----UGAUUAGUAUAAUAGGAGAAAAA-UUGCACGGUAUCCAUCUGUAAACCGCAGGA------------------ ENSEMBL scaffold_9998:20490-20577(-) -31.2 ((((((.(((..(((((((((..((.(((((((((..(((......)))....)))))))))))..)))))))))..))).))))))
eeu --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
sar ----------------UUUUGCUGUUGGCGGGUGGAUCACGAUGCAA-UUU-----UGAUUAGUUUGAUAGGAGAAAAA-UUGCACGGUAUCCAUCUGUAAACCGCAGGA------------------ ENSEMBL scaffold_57083:167-254(-) -33.9 ((((((.(((.((((((((((..((.(((((((((..(((......)))....)))))))))))..)))))))))).))).))))))
cho --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
ete ----------------UUUUGUUGUUGUCGGGUGGAUCACGAUGCAA-UUU-----UGAUUAGUAAGGUAGGAGAAAAA-UUGCACGGUAUCCAUCUGGAAACCGCA--------------------- ENSEMBL scaffold_322682:40894-40978(-) -28.7 ...(((.(((..(((((((((..((.(((((((((..((..........))..)))))))))))..)))))))))..))).)))
laf ----------------UUUUGCUGUUGUCGGGUGGAUCACGAUGCAA-UUU-----UGAUUAGUAUGAUAGGAGAAAAA-UUGCACGGUAUCCAUCUGUAAACCGCAGGA------------------ ENSEMBL scaffold_100:4183619-4183706(-) -31.2 ((((((.(((..(((((((((..((.(((((((((..(((......)))....)))))))))))..)))))))))..))).))))))
pca ----------------UUUUGCUGUUGUCGGGUGGAUCACGAUGCAA-UUU-----UGAUUAGUGUUGUAGGAGAAAAA-UUGCACGGUAUCCAUCUGUAAACCGCA--------------------- ENSEMBL scaffold_27381:5048-5132(-) -28.5 ...(((.(((..(((((((((..((.(((((((((..((..........))..)))))))))))..)))))))))..))).)))
meu -----------------UUUGCUGUUGUCGGGUGGAUCACGAUGCAA-UUU-----UGAUAAGUUUAGUAGGAGAAAAA-UUGCACGGUAUCCAUCUGUAAACCGCA--------------------- ENSEMBL Scaffold109897:4389-4472(+) -27.87 ..(((.(((..(((((((((..((.(((((((((..................)))))))))))..)))))))))..))).)))
mdo ----------------UUUUGCUGU-GUCGGGUGGAUCACGAUGCAAAUUU-----UGAUAAGUUUAAUAGGAGAAAAAAUUGCACGGUAUCCAUCUGUAAACCGCAAGAC----------------- miRbase UCSC ENSEMBL X:35202082-35202170(-) -27.97 ((((((.((..(((((((((..((.(((((.((((..................)))).)))))))..)))))))))...)).)))))).
oan ---------------GUUUUGCUGUUGUCGGGUGGAUCACGAUGCAA-UUU-----UGAUUAGUUUAGUAGGAGAAAAA-UUGCACGGUAUCCAUCUGUAAACCGCAGGAC----------------- miRbase UCSC ENSEMBL 6:8561848-8561936(+) -33.4 (((((((.(((..(((((((((..((.(((((((((..((..........))..)))))))))))..)))))))))..))).)))))))
gga --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
mga ----------------UUUUGCUGUUGUCGGGUGGAUCACGAUGCAA-UUU-----UGAUUAGUUUAGUAGGAGAAAAA-UUGCACGGUAUCCAUCUGUAAACCGCA--------------------- UCSC ENSEMBL 9:3728786-3728870(-) -28.5 ...(((.(((..(((((((((..((.(((((((((..((..........))..)))))))))))..)))))))))..))).)))
tgu ---------------GUUUUGCUGUUGUCGGGUGGAUCACGAUGCAA-UUU-----UGAUUAGUUUAGUAGGAGAAAAA-UUGCACGGUAUCCAUCUGUAAACCGCAAGAC----------------- miRbase ENSEMBL 4A:7274550-7274638(+) -33.8 (((((((.(((..(((((((((..((.(((((((((..((..........))..)))))))))))..)))))))))..))).)))))))
aca ----------------UUUUGCUGUUGUCGGGUGGAUCACGAUGCAA-UUU-----UGAUUAGAUUAGCAGGACGAAAA-UUGCACGGUAUCCAUCUGUAAACCGCAGGA------------------ UCSC ENSEMBL scaffold_1275:94013-94100(+) -29.37 ((((((.(((..(((((((((..((.(((((((((..................)))))))))))..)))))))))..))).))))))
xtr ----------------UUUUGUUGUUCGCGGGUGGAUCACGAUGCAA-UUU-----UAUUUAGUUUGGUAGGAGAAAAA-UUGCACGGUAUCCAUCUGUAAACCGCAGAA------------------ miRbase UCSC ENSEMBL scaffold_31:1058610-1058696(-) -32.4 .(((((.(((..(((((((((..((.(((((((((.(((..........))).)))))))))))..)))))))))..))).))))).
dre UAAAUGCAAAUAUUUGUCUUGCUGUUUUCGGGUGGAUGACUCUGCAAUUUUAUUAGUGAUGGAAAAACUUCAAUAAAAA-UUGCACGGUAUCCAUCUGUAAUCCGCUGGAUUCCAUUACCUGCGUUUG miRbase UCSC ENSEMBL 14:32739275-32739401(-) -35.6 ((((((((..((...((((.((......((((((((((.((.(((((((((.....(((..........)))...))))))))).))))))))))))......)).)))).....))..))))))))
gac --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
ola --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
tru --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
tni --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
cin --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
csa --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
dme --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
cel --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
* ****** ** ***** *** * *** ****************** *
*** ******************* *** ** * * * *** **** ****************** ** *
**** ******************** *** **** ** *********** ************************
**** ******************** *** **** ** *********** ************************
**** ******************** *** **** ** * *********** ************************
************************* *** **** *** * *********** ************************
************************* *** ******** * *********** ************************
* ************************* *** ******** * *********** **************************
*** ************************* *** ******** * *********** ***************************
***************************** *** ******** * *********** ***************************
******************************* *** ******** * ************ ***************************
******************************* *** ******** * ************ ***************************
******************************* *** *********************** *************************** *
******************************* *** *********************** *************************** **
******************************* *** *********************** ******************************
******************************* *** *********************** ******************************
******************************* *** *********************** ******************************
******************************* *** *********************** ******************************
******************************* *** *********************** ******************************
******************************* *** *********************** ******************************
******************************* *** *********************** ******************************
******************************* *** *********************** ******************************
******************************* *** *********************** ******************************
******************************* *** *********************** ******************************
******************************* *** *********************** ******************************
******************************* *** *********************** ******************************
******************************* *** *********************** ******************************
******************************* *** *********************** ******************************
******************************* *** *********************** ******************************
******************************* *** *********************** ******************************
******************************* *** *********************** ******************************
******************************** *** *********************** *******************************
******************************** *** *********************** *******************************
********************************************************************************************************************************