hsa ---------------------CCCCGCGACGAGCCCCUCGCA--CAA----ACCGGACCUGAGCGUUUUGUUCGUUCGGCUCGCGUGAGGC------------ miRbase UCSC ENSEMBL 2:219866367-219866430(-) -26.2 .((((((.((((((...((.(((((.((........)).))))).))...)))))))))).)).
ptr ---------------------CCCCGCGACGAGCCCCUCGCA--CAA----ACCGGACCUGAGCGUUUUGUUCGUUCGGCUCGCGUGAGG------------- miRbase UCSC ENSEMBL 2b:224932178-224932240(-) -25.8 .((((((.((((((...((.(((((.((........)).))))).))...)))))))))).))
ggo --------------------GCCCCGCGACGAGCCCCUCGCA--CAA----ACCGGACCUGAGCGUUUUGUUCGUUCGGCUCGCGUGAGGCAGGGGC------ ENSEMBL 2b:108174822-108174893(-) -30.8 (((.((((.((((((...((.(((((.((........)).))))).))...)))))))))).)))......
ppy ---------------------CCCCGCGACGAGCCCCUCGCA--CAA----ACCGGACCUGAGCGUUUUGUUCGUUCGGCUCGCGUGAGGC------------ miRbase UCSC ENSEMBL 2b:110853426-110853489(-) -26.2 .((((((.((((((...((.(((((.((........)).))))).))...)))))))))).)).
mml ---------------------CCCCGCGACGAGCCCCUCGCA--CAA----ACCGGACCUGAGCGUUUUGUUCGUUCGGCUCGCGUGAGGC------------ miRbase UCSC ENSEMBL 12:82853754-82853817(-) -26.2 .((((((.((((((...((.(((((.((........)).))))).))...)))))))))).)).
cja --------------------GCCCCGCGACGAGCCCCUCGCA--CAA----ACCGGACCUGAGCGUUUUGUUCGUUCGGCUCGCGUGAGGCAGGGGC------ ENSEMBL Contig23:880339-880410(-) -30.8 (((.((((.((((((...((.(((((.((........)).))))).))...)))))))))).)))......
tsy -------------------------------------------------------------------------------------------------------
mmr --------------------GCCCCGCGACGAGCCCCUCGCA--CAA----ACCGGACCUGAGCGUUUUGUUCGUUCGGCUCGCGUGAGGCAGGGGC------ ENSEMBL scaffold_1727:247221-247292(-) -30.8 (((.((((.((((((...((.(((((.((........)).))))).))...)))))))))).)))......
oga --------------------GCCCCGCGACGAGCCCCUCGCA--CAA----ACCGGACCUGAGCGUUUUGUUCGUUCGGCUCGCGUGAGGCAGGGGC------ ENSEMBL GeneScaffold_1513:140026-140097(-) -30.8 (((.((((.((((((...((.(((((.((........)).))))).))...)))))))))).)))......
tbe --------------------GCCCCGCGACGAGCCCCUCGCA--CAA----ACCGGACCUGAGCGUUUUGUUCGUUCGGCUCGCGUGAGGCAGGGGC------ ENSEMBL GeneScaffold_3782:86093-86164(-) -30.8 (((.((((.((((((...((.(((((.((........)).))))).))...)))))))))).)))......
cpo --------------------GCCCCGCGACGAGCCCCUCGCA--CAA----ACCGGACCUGAGCGUUUUGUUCGUUCGGCUCGCGUGAGGCAGGGGC------ UCSC ENSEMBL scaffold_89:6176384-6176455(+) -30.8 (((.((((.((((((...((.(((((.((........)).))))).))...)))))))))).)))......
dor --------------------GCCCCGCGACGAGCCCCUCGCA--CAA----ACCGGACCUGAGCGUUUUGUUCGUUCGGCUCGCGUGAGGCUGGGGC------ ENSEMBL GeneScaffold_5318:84215-84286(-) -30.3 (((.((((.((((((...((.(((((.((........)).))))).))...)))))))))).)))......
mmu ---------------------CCCCGCGACGAGCCCCUCGCA--CAA----ACCGGACCUGAGCGUUUUGUUCGUUCGGCUCGCGUGAGGC------------ miRbase UCSC ENSEMBL 1:74947232-74947295(-) -26.2 .((((((.((((((...((.(((((.((........)).))))).))...)))))))))).)).
rno ----------------UCCGGCCCCGCGACGAGCCCCUCGCA--CAA----ACCGGACCUGAGCGUUUUGUUCGUUCGGCUCGCGUGAGGCAGGGGC------ miRbase UCSC ENSEMBL 9:74233499-74233573(-) -33.8 (((.(((.((((.((((((...((.(((((.((........)).))))).))...)))))))))).))).)))..
str -------------------------------------------------------------------------------------------------------
opr --------------------GCCCCGCGACGAGCCCCUCGCA--CAA----ACCGGAUCUGAGCGUUUUGUUCGUUCGGCUCGCGUGAGGCAGGGGC------ ENSEMBL GeneScaffold_3486:17494-17565(-) -30.8 (((.((((.((((((...((.(((((.((........)).))))).))...)))))))))).)))......
ocu --------------------GCCCCGCGACGAGCCCCUCGCA--CAA----ACCGGACCUGAGCGUUUUGUUCGUUCGGCUCGCGUGAGGCAGGGGC------ ENSEMBL scaffold_26:19394481-19394552(-) -30.8 (((.((((.((((((...((.(((((.((........)).))))).))...)))))))))).)))......
bta ---------------------CCCCGCGACGAGCCCCUCGCA--CAA----ACCGGACCUGAGCGUUUUGUUCGUUCGGCUCGCGUGAGGC------------ miRbase UCSC ENSEMBL 2:111347583-111347646(-) -26.2 .((((((.((((((...((.(((((.((........)).))))).))...)))))))))).)).
ttr --------------------GCCCCGCGACGAGCCCCUCGCA--CAA----ACCGGACCUGAGCGUUUUGUUCGUUCGGCUCGCGUGAGGCAGGGGC------ ENSEMBL GeneScaffold_1416:170368-170439(-) -30.8 (((.((((.((((((...((.(((((.((........)).))))).))...)))))))))).)))......
vpa -------------------------------------------------------------------------------------------------------
ssc -------------------------------------------------------------------------------------------------------
cfa --------------------GCCCCGCGACGAGCCCCUCGCA--CAA----ACCGGACCUGAGCGUUUUGUUCGUUCGGCUCGCGUGAGGCAGGGG------- miRbase UCSC ENSEMBL 37:28567566-28567635(-) -30.8 (((.((((.((((((...((.(((((.((........)).))))).))...)))))))))).))).....
fca --------------------GCCCCGCGACGAGCCCCUCGCA--CAA----ACCGGACCUGAGCGUUUUGUUCGUUCGGCUCGCGUGAGGCAGGGG------- ENSEMBL GeneScaffold_3319:84508-84578(-) -30.8 (((.((((.((((((...((.(((((.((........)).))))).))...)))))))))).))).....
eca --------------------GCCCCGCGACGAGCCCCUCGCA--CAA----ACCGGACCUGAGCGUUUUGUUCGUUCGGCUCGCGUGAGGCAGGGGC------ UCSC ENSEMBL 6:8569803-8569874(-) -30.8 (((.((((.((((((...((.(((((.((........)).))))).))...)))))))))).)))......
mlu --------------------GCCCCGCGACGAGCCCCUCGCA--CAA----ACCGGACCUGAGCGUUUUGUUCGUUCGGCUCGCGUGAGGCAGGGGC------ ENSEMBL GeneScaffold_4660:52868-52939(-) -30.8 (((.((((.((((((...((.(((((.((........)).))))).))...)))))))))).)))......
pva --------------------GCCCCGCGACGAGCCCCUCGCA--CAA----ACCGGACCUGAGCGUUUUGUUCGUUCGGCUCGCGUGAGGCAGGGGC------ ENSEMBL GeneScaffold_2631:20091-20162(-) -30.8 (((.((((.((((((...((.(((((.((........)).))))).))...)))))))))).)))......
eeu --------------------GCCCCGCGACGAGCCCCUCGCA--CAA----ACCGGACCUGAGCGUUUUGUUCGUUCGGCUCGCGUGAGGCAGGGGC------ ENSEMBL scaffold_109553:420-491(-) -30.8 (((.((((.((((((...((.(((((.((........)).))))).))...)))))))))).)))......
sar -------------------------------------------------------------------------------------------------------
cho -------------------------------------------------------------------------------------------------------
ete -------------------------------------------------------------------------------------------------------
laf --------------------GCCCCGCGACGAGCCCCUCGCA--CAA----ACCGGACCUGAGCGUUUUGUUCGUUCGGCUCGCGUGAGGCAGGGGC------ ENSEMBL scaffold_3:7982296-7982367(+) -30.8 (((.((((.((((((...((.(((((.((........)).))))).))...)))))))))).)))......
pca -------------------------------------------------------------------------------------------------------
meu -------------------------------------------------------------------------------------------------------
mdo ----------------------CCCGCGCCGAGCCCCUCGCA--CAA----ACCGGACCUGAGCGUUUUGUUCGUUCGGCUCGCGUGAGGC------------ miRbase UCSC ENSEMBL 7:173725890-173725952(+) -25.9 (((((((.(((((...((.(((((.((........)).))))).))...)))))))))).)).
oan -------------------------------------------------------------------------------------------------------
gga ---------------------CCUGGCGUCGAGCCCCACGUG--CAAG---ACCUGACCUGAACGUUUUGUUCGUUCGGCUCGCGUUAGGC------------ miRbase UCSC ENSEMBL 7:23901124-23901188(+) -30.6 (((((((.((((((..(((.(((((((...........))))))).)))..))))))))))))).
mga ---------------------CCUGGCGUCGAGCCCCACGUG--CAAG---ACCUGACCUGAACGUUUUGUUCGUUCGGCUCGCGUUAGGC------------ UCSC ENSEMBL Un:52935148-52935213(-) -30.6 (((((((.((((((..(((.(((((((...........))))))).)))..))))))))))))).
tgu ---------------------CCUGGCGUCGAGCCCCACGUG--CAAU---ACCUGACCUGAACGUUUUGUUCGUUCGGCUCGCGUUAGGCAGGUCCA----- miRbase ENSEMBL 7:10362273-10362344(-) -27.2 (((((((.((((((..(((.((((.((...........)).)))).)))..)))))))))))))........
aca -------------------------------------------------------------------------------------------------------
xtr ---------------------CCUGACGCCGAGCCUGACGUG--CAAU---GCUUUGUGUCAACGUUUUGUUCGUUCGGCUCGCGUUAAGCAGGUG------- miRbase UCSC ENSEMBL scaffold_77:1902363-1902432(-) -28.0 ((((((((.(((((.((((.((((.((.(((...))).)).)))).)))).)))))))))....))))..
dre -------------------------------------------------------------------------------------------------------
gac -------------------------------------------------------------------------------------------------------
ola -------------------------------------------------------------------------------------------------------
tru -------------------------------------------------------------------------------------------------------
tni -------------UGUACUUGCUUCACGUUGAGCCUCACGCA--CAAU---ACCUGAAGAUGAAGUUUUGUUCGUUCGGCUCGCGUUAUGCAGGU-------- miRbase UCSC ENSEMBL 2:17702696-17702772(-) -26.2 ...((((((...((((.(((((..(((.((((...((........))..)))).)))..)))))))))...))))))
cin ACGUUGGUCGCACGAUCAAAGCGUCAUUAUUGUUCUGGCGUCAUUAAU---UGCGUCAUAAAAUGCCUUGUUCGUUCGGCUCGCGU----------------- miRbase UCSC ENSEMBL 7q:439603-439685(+) -25.9 ((((.(((((.((((.(((.((((((....))...(((((.((.....)))))))....)))).))).)))).))))).))))
csa -------------------------------------------------------------------------------------------------------
dme -----------CCGGGCAGCGAAUUACU-UGGGCCAAGGGAAUGCAAACUGUGAUCAUCCCGAAAGUUUGUUCGUUUGGCUUAAGUUAUUUUCAUGUCCGACU miRbase UCSC ENSEMBL 2L:857542-857632(+) -36.2 .((((((..(((..((((((((((((.((..(((((((....((.....)).))))))))).))))))))))))....))).))))))...
cel -------------------------------------------------------------------------------------------------------
* * ** ********* **** **
* * *** ** *** * ******************** *
* ** ***** ** *** ** * * ********************** * *
** ** ****** * ** *** *** ** ** * *********************** * **
** *** ******** ** *** *** ** **** *********************** ****
** **** ******** ** * *** *** ******* *********************** ****
** **** ******** **** *** *********** *********************** ****
********************* *** ****************************************
********************* *** ****************************************
********************* *** ****************************************
********************* *** ****************************************
********************** *** **************************************** **
********************** *** ******************************************* *
********************** *** ******************************************* *
********************** *** *********************************************
********************** *** **********************************************
********************** *** **********************************************
********************** *** **********************************************
********************** *** **********************************************
********************** *** **********************************************
********************** *** **********************************************
********************** *** **********************************************
********************** *** **********************************************
********************** *** **********************************************
********************** *** **********************************************
********************** *** **********************************************
********************** *** **********************************************
********************** *** **********************************************
********************** **** **********************************************
********************** **** **********************************************
****** ********************** **** **********************************************
*******************************************************************************************************