hsa ------------AUAAAGGAAGUUAGGCUGAGGGGCAGAGAGCGAGACUUUUCUAUUUUCCAAAAGCUCGGUCUGAGGCCCCUCAGUCUUGCUUCCUAACCCGCGC--- miRbase UCSC ENSEMBL 17:28444097-28444190(+) -48.8 ....(((((((.((((((((((((..(((.((((.(((((.........))))))))).)))...)))))))))))).)))))))......... ptr ------------AUAAAGGAAGUUAGGCUGAGGGGCAGAGAGCGAGACUUUUCUAUUUUCCAAAAGCUCGGUCUGAGGCCCCUCAGUCUUGCUUCCUACCCCGCG---- miRbase UCSC ENSEMBL 17:27182168-27182260(-) -48.8 ....(((((((.((((((((((((..(((.((((.(((((.........))))))))).)))...)))))))))))).)))))))........ ggo ------------AUAAAGGAAGUUAGGCUGAGGGGCAGAGAGCGAGACUUUUCUAUUUUCCAAAAGCUCGGUCUGAGGCCCCUCAGUCUUGCUUCCUACCCCGCGC--- ENSEMBL 5:54291850-54291944(-) -48.8 ....(((((((.((((((((((((..(((.((((.(((((.........))))))))).)))...)))))))))))).)))))))......... ppy ----------------AGGAAGUUAGGCUGAGGGGCAGAGAGCGAGACUUUUCUAUUUUCCAAAAGCUCGGUCUGAGGCCCCUCAGUCUUGCUUCCUACCCCGCGC--- miRbase UCSC ENSEMBL 17:24902242-24902331(+) -48.5 (((((((.((((((((((((..(((.((((.(((((.........))))))))).)))...)))))))))))).)))))))......... mml ------------AUAAAGGAAGUUAGGCUGAGGGGCAGAGAGCGAGACUUUUCUAUUUUCCAAAAGCUCGGUCUGAGGCCCCUCAGUCUUGCUUCCUACCCCGCGC--- miRbase UCSC ENSEMBL 16:25356203-25356296(+) -48.8 ....(((((((.((((((((((((..(((.((((.(((((.........))))))))).)))...)))))))))))).)))))))......... cja ------------AUAAAGGAAGUUAGGCUGAGGGGCAGAGAGCGAGACUUUUCUAUUUUCCAAAAGCUCGGUCUGAGGCCCCUCAGUCUUGCUUCCUACCCCGCGC--- ENSEMBL Contig57:4943928-4944022(+) -48.8 ....(((((((.((((((((((((..(((.((((.(((((.........))))))))).)))...)))))))))))).)))))))......... tsy ------------AUAAAGGAAGUUAGGCUGAGGGGCAGAGAGCGAGACUUUUCUAUUUUCCAAAAGCUCGGUCUGAGGCCCCUCAGUCUUGCUUCCUACCCCGCGC--- ENSEMBL GeneScaffold_3133:1476-1570(+) -48.8 ....(((((((.((((((((((((..(((.((((.(((((.........))))))))).)))...)))))))))))).)))))))......... mmr ------------------------------------------------------------------------------------------------------------- oga ------------AUAAAGGAAGUUAGGCUGAGGGGCAGAGAGCGAGACUUUUCUAUUUUCCAAAAGCUCGGUCUGAGGCCCCUCAGUCUUGCUUCCUACCCCGCGC--- ENSEMBL GeneScaffold_4598:685837-685931(+) -48.8 ....(((((((.((((((((((((..(((.((((.(((((.........))))))))).)))...)))))))))))).)))))))......... tbe ------------AUAAAGGAAGUUAGGCUGAGGGGCAGAGAGCGAGACUUUUCUAUUUUCCAAAAGCUCGGUCUGAGGCCCCUCAGUCUUGCUUCCUA----------- ENSEMBL GeneScaffold_4695:230499-230585(+) -48.8 ....(((((((.((((((((((((..(((.((((.(((((.........))))))))).)))...)))))))))))).))))))). cpo ------------AUAAAGGAAGUUAGGCUGAGGGGCAGAGAGCGAGACUUUUCUAUUUUCCAAAAGCUCGGUCUGAGGCCCCUCAGUCUUGCUUCCUACCCCGCGC--- UCSC ENSEMBL scaffold_32:22509122-22509216(-) -48.8 ....(((((((.((((((((((((..(((.((((.(((((.........))))))))).)))...)))))))))))).)))))))......... dor --------------AAAGGAAGUUAGGCUGAGGGGCAGAGAGCGAGACUUUUCUAUUUUCCAAAAGCUCGGUCUGAGGCCCCUCAGUCUUGCUUCCUACCCCGCGC--- ENSEMBL GeneScaffold_2490:6170-6262(+) -48.8 ..(((((((.((((((((((((..(((.((((.(((((.........))))))))).)))...)))))))))))).)))))))......... mmu ACUUGUGAGGAAAUAAAGGAAGUUAGGCUGAGGGGCAGAGAGCGAGACUUUUCUAUUUUCCAAAAGCUCGGUCUGAGGCCCCUCAGUCUUGCUUCCUACCCCGCGCUUG miRbase UCSC ENSEMBL 11:76891566-76891674(-) -52.2 ....(((.((......(((((((.((((((((((((..(((.((((.(((((.........))))))))).)))...)))))))))))).)))))))...)).)))... rno ------------------GAAGUUAGGCUGAGGGGCAGAGAGCGAGACUUUUCUAUUUUCCAAAAGCUCGGUCUGAGGCCCCUCAGUCUUGCUUCCU------------ miRbase UCSC ENSEMBL 10:67078729-67078807(+) -43.7 (((((.((((((((((((..(((.((((.(((((.........))))))))).)))...)))))))))))).))))).. str ------------------------------------------------------------------------------------------------------------- opr ----------------AGGAAGUGAGGCUGAGGGGCAGAGAGCGAGACUUUUCUAUUUUCCCAAAGCUCGGUCUGAGGCCCCUCAGUCUUGCUUCCUACCCCGCGC--- ENSEMBL scaffold_97409:1699-1789(+) -50.5 ((((((..((((((((((((..(((.((((.((((...........)))))))).)))...))))))))))))..))))))......... ocu ------------AUAAAGGAAGUUAGGCUGAGGGGCAGAGAGCGAGACUUUUCUAUUUUCCAAAAGCUCGGUCUGAGGCCCCUCAGUCUUGCUUCCUACCCCGCGC--- ENSEMBL scaffold_36:15146083-15146177(-) -48.8 ....(((((((.((((((((((((..(((.((((.(((((.........))))))))).)))...)))))))))))).)))))))......... bta ------------AUAAAGGAAGUUAGGCUGAGGGGCAGAGAGCGAGACUUUUCUAUUUUCCAAAAGCUCGGUCUGAGGCCCCUCAGUCUUGCUUCCUACCCCGCGC--- miRbase UCSC ENSEMBL 19:21234483-21234576(+) -48.8 ....(((((((.((((((((((((..(((.((((.(((((.........))))))))).)))...)))))))))))).)))))))......... ttr ------------------------------------------------------------------------------------------------------------- vpa ------------AUAAAGGAAGUUAGGCUGAGGGGCAGAGAGCGAGACUUUUCUAUUUUCCAAAAGCUCGGUCUGAGGCCCCUCAGUCUUGCUUCCUACCCCGCGC--- ENSEMBL GeneScaffold_1223:3398-3492(+) -48.8 ....(((((((.((((((((((((..(((.((((.(((((.........))))))))).)))...)))))))))))).)))))))......... ssc -------------------AAGUUAGGCUGAGGGGCAGAGAGCGAGACUUUUCUAUUUUCCAAAAGCUCGGUCUGAGGCCCCUCAGUCUUGCUUCCUAC---------- miRbase ENSEMBL 12:44150500-44150579(+) -40.1 ((((.((((((((((((..(((.((((.(((((.........))))))))).)))...)))))))))))).))))..... cfa ------------AUAAAGGAAGUUAGGCUGAGGGGCAGAGAGCGAGACUUUUCUAUUUUCCAAAAGCUCGGUCUGAGGCCCCUCAGUCUUGCUUCCUACCCCGCGC--- UCSC ENSEMBL 9:47480932-47481026(+) -48.8 ....(((((((.((((((((((((..(((.((((.(((((.........))))))))).)))...)))))))))))).)))))))......... fca ------------------------------------------------------------------------------------------------------------- eca ------------------------AGGCUGAGGGGCAGAGAGCGAGACUUUUCUAUUUUCCAAAAGCUCGGUCUGAGGCCCCUCAGU---------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 11:43782441-43782503(+) -33.0 ..((((((((((..(((.((((.(((((.........))))))))).)))...)))))))))) mlu ------------AUAAAGGAAGUUAGGCUGAGGGGCAGAGAGCGAGACUUUUCUAUUUUCCAAAAGCUCGGUCUGAGGCCCCUCAGUCUUGCUUCCUACCCCGCGC--- ENSEMBL GeneScaffold_1302:338955-339049(+) -48.8 ....(((((((.((((((((((((..(((.((((.(((((.........))))))))).)))...)))))))))))).)))))))......... pva ------------AUAAAGGAAGUUAGGCUGAGGGGCAGAGAGCGAGACUUUUCUAUUUUCCAAAAGCUCGGUCUGAGGCCCCUCAGUCUUGCUUCCUACCCCGCGC--- ENSEMBL GeneScaffold_2524:472774-472868(+) -48.8 ....(((((((.((((((((((((..(((.((((.(((((.........))))))))).)))...)))))))))))).)))))))......... eeu ------------AUAAAGGAAGUUAGGCUGAGGGGCAGAGAGCGAGACUUUUCUAUUUUCCAAAAGCUCGGUCUGAGGCCCCUCAGUCUUGCUUCCUACCCCGCGC--- ENSEMBL GeneScaffold_3301:626-720(+) -48.8 ....(((((((.((((((((((((..(((.((((.(((((.........))))))))).)))...)))))))))))).)))))))......... sar ------------AUAAAGGAAGUUAGGCUGAGGGGCAGAGAGCGAGACUUUUCUAUUUUCCAAAAGCUCGGUCUGAGAGCCCCUUCGUGUGCUGA-------------- ENSEMBL GeneScaffold_6005:19049-19132(+) -27.6 ........((.((.((.(((((((..(((.((((.(((((.........))))))))).)))....))))))).)).)))).. cho ------------AUAAAGGAAGUUAGGAUGAGGGGCAGAGAGCGAGACUUUUCUAUCUUCCAAAAGCUCGGUCUGAGGCCCCUCAGUCUUGCUUCCUACCCCGCGC--- ENSEMBL GeneScaffold_2979:222-316(+) -42.8 ....(((((((.((..((((((((..(((.((((.(((((.........))))))))).)))...))))))))..)).)))))))......... ete ----------------AGGAAGUUAGGCUGAGGGGCAGAGAGCGAGACUUUUCUAUUUUCCAAAAGCUCGGUCUGAGGCCCCUCAGUCUUGCUUCCUA----------- ENSEMBL GeneScaffold_7251:231-313(+) -48.5 (((((((.((((((((((((..(((.((((.(((((.........))))))))).)))...)))))))))))).))))))). laf ------------AUAAAGGAAGUUAGGCUGAGGGGCAGAGAGCGAGACUUUUCUAUUUUCCAAAAGCUCGGUCUGAGGCCCCUCAGUCUUGCUUCCUACCCCGCGC--- ENSEMBL scaffold_47:2997860-2997954(+) -48.8 ....(((((((.((((((((((((..(((.((((.(((((.........))))))))).)))...)))))))))))).)))))))......... pca ------------------------------------------------------------------------------------------------------------- meu ------------------------------------------------------------------------------------------------------------- mdo ------------------------------------------------------------------------------------------------------------- oan ------------------------------------------------------------------------------------------------------------- gga ------------------------------------------------------------------------------------------------------------- mga ------------------------------------------------------------------------------------------------------------- tgu ------------------------------------------------------------------------------------------------------------- aca ------------------------------------------------------------------------------------------------------------- xtr ------------------------------------------------------------------------------------------------------------- dre ------------------------------------------------------------------------------------------------------------- gac ------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ola ------------------------------------------------------------------------------------------------------------- tru ------------------------------------------------------------------------------------------------------------- tni ------------------------------------------------------------------------------------------------------------- cin ------------------------------------------------------------------------------------------------------------- csa ------------------------------------------------------------------------------------------------------------- dme ------------------------------------------------------------------------------------------------------------- cel ------------------------------------------------------------------------------------------------------------- *** **************************** **** *************** *** **** *************************************************************** **** ******************************************************************************* ********************************************************************************** ********************************************************************************** ********************************************************************************** ******************************************************************************************* ********************************************************************************************** ********************************************************************************************** ********************************************************************************************** ********************************************************************************************** ********************************************************************************************** ********************************************************************************************** ********************************************************************************************** ********************************************************************************************** ********************************************************************************************** ********************************************************************************************** ********************************************************************************************** ********************************************************************************************** ********************************************************************************************** ********************************************************************************************** ********************************************************************************************** ********************************************************************************************** ********************************************************************************************** ********************************************************************************************** ********************************************************************************************** *************************************************************************************************************