hsa -----------CGCCGGCCGAUGGGCGUCUUACCAGACAUGGUUAGACCU-GG--CCCUCUGUCUAAUACUGUCUGGUAAAACCGUCCAUCCGCUGC---------------- miRbase UCSC ENSEMBL 1:1104385-1104467(+) -40.3 ...((((.((((((((..((((((((((..(((((((..........)))))))..))))))))))...)))))))).)))). ptr ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ggo ----------------------GGGCGUCUUACCAGACAUGGUUAGACCU-GG--CCCUCUGUCUAAUACUGUCUGGUAAAACCGUCCAUCAGC------------------- ENSEMBL 1:1056764-1056833(+) -29.2 (((((..((((((((((..(((((((..........)))))))..))))))))))...)))))...... ppy -----------CGCCGGCCGAUGGGCGUCUUACCAGACAUGGUUAGACCU-GG--CCGUCUGUCUAAUACUGUCUGGUAAAACCGUCCAUCCGC------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 1:229421350-229421429(-) -36.1 .....((.((((((((..((((((((((..(((((((..........)))))))..))))))))))...)))))))).)) mml -----------CGCCGGCCGAUGAGCGUCUUACCAGACACGGUUAGACCU-GG--CUCUCUGUCUAAUACUGUCUGGUAAAACCGUCCAUCCGCGGC---------------- miRbase UCSC ENSEMBL 1:4241843-4241925(+) -36.4 .(((.((.((((..((..((((((((((..(((((((..........)))))))..))))))))))...))..)))).))))) cja -------------------GAUGAACGUCUUACCAGACACGGUUAGACCU-G---CCCUCUGUCUAAUACUGUCUGGUAAAACCGUCCAUCCGC------------------- ENSEMBL Contig573:708600-708671(-) -27.8 ((((.(((..((((((((((..(((((((.........)))))))..))))))))))...))).))))... tsy ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------- mmr ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------- oga ----------------------GGGCGUCUUACCAGACAUGGUUAGAUCU-GGA-CCCUCUGUCUAAUACUGUCUGGUAAUACCGUCCAUCC--------------------- ENSEMBL GeneScaffold_5019:11023-11091(+) -28.9 (((((..((((((((((..(((((((..((.....)))))))))..))))))))))...))))).... tbe ----------------------GGGCGUCUUACCAGACACGGUUAGAUCU-GGAUCAUUCUGUCUAAUACUGUCUGGUAAUGCCGUCCAUCC--------------------- ENSEMBL GeneScaffold_3701:77055-77124(+) -30.3 (((((..((((((((((..(((((((..(((....))))))))))..))))))))))...))))).... cpo ----------------------GGGCGUCUUACCAGACACGGUUAGAUCU-GGAUGCUUCUGUCUAAUACUGUCUGGUAAUGCCGUCCAUCC--------------------- UCSC ENSEMBL scaffold_186:1148966-1149035(-) -30.3 (((((..((((((((((..(((((((..(((....))))))))))..))))))))))...))))).... dor ----------------------GGGCGUCUUACCAGACACGGUUAGAUCU-GGAUGCCUCUGUCUAAUACUGUCUGGUAAUGCCGUCCGUCC--------------------- ENSEMBL scaffold_7421:18425-18494(-) -29.9 (((((..((((((((((..(((((((..((....))..)))))))..))))))))))...))))).... mmu -------------CCUGCUGAUGGAUGUCUUACCAGACAUGGUUAGAUCU-GGAUGCAUCUGUCUAAUACUGUCUGGUAAUGCCGUCCAUCCACGGC---------------- miRbase UCSC ENSEMBL 4:155428014-155428096(-) -35.2 .(((..((((((((..((((((((((..(((((((..(((....))))))))))..))))))))))...))))))))..))). rno -----------UGCCUGCUGAUGGAUGUCUUACCAGACAUGGUUAGAUCU-GGAUGUAUCUGUCUAAUACUGUCUGGUAAUGCCGUCCAUCCAUGGC---------------- miRbase UCSC ENSEMBL 5:172897185-172897269(-) -36.9 .(((....((((((((..((((((((((..(((((((..(((....))))))))))..))))))))))...))))))))...))) str ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------- opr -------------------GACAGGCGUCUUACCAGGCAUGGUUAGAUGU-GCGUGCUG-UGUCUAAUACUGUCUGGUAAC-CCAUCUGUCC--------------------- ENSEMBL GeneScaffold_3407:31619-31689(+) -27.5 ((((((....((((((((((..((((((..((.....))..))))))..))))))))))....)))))). ocu ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------- bta -----------AGCCUGCCGAUGGGCGUCUUACCAGACACGGUUAGAUCU-GG-UCCUUCUGUCUAAUACUGUCUGGUAAUGCCGUCCAUCCCCGGC---------------- miRbase UCSC ENSEMBL 16:48593123-48593206(-) -37.1 .(((....((((((((..((((((((((..(((((((..((....)).)))))))..))))))))))...))))))))...))) ttr -------------------GAUGGGUGUCUUACCAGACACGGUUAGAUCU-GC-UCCUUCUGUCUAAUACUGUCUGGUAAUGCCGUCCAUCC--------------------- ENSEMBL GeneScaffold_2240:52159-52230(+) -27.4 ((((((((..((((((((((..(((((((...........)))))))..))))))))))...)))))))). vpa ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ssc -----------------CCGAUGGGUGUCUUACCAGGCACGGUUAGAUCU-GG-UUCUUCUGUCUAAUACUGUCUGGUAAUGCCGUCCAUUCCCGG----------------- ENSEMBL 6:42894047-42894124(-) -27.1 ((((((((((..((((((((((..(((((((..((....)).)))))))..))))))))))...)))))))...))) cfa -----------AGCCUGCUGAUGGGCGUCUUACCAGACACGGUUAGAUCU-GGGUUCUGGUGUCUAAUACUGUCUGGUAAUGCCGUUCAUCCAUGGC---------------- miRbase UCSC ENSEMBL 5:59371702-59371786(+) -36.0 .(((....((((((((..((((((((((..(((((((((((...)))).)))))))..))))))))))...))))))))...))) fca ----------------------GGGCGUCUUACCAGACACGGUUAGAUCU-GGGUUCCAUUGUCUAAUACUGUCUGGUAAUGCCGUUCAUCC--------------------- ENSEMBL GeneScaffold_5080:329474-329543(+) -28.2 .(((((..(((((((((..(((((((.(((...)))..)))))))..))))))))))))))........ eca ----------------------GGGCGUCUUACCAGACACGGUUAGAUCU-GCGUCCUUCUGUCUAAUACUGUCUGGUAAUGCCGUCCAU----------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 2:48453025-48453091(-) -27.4 (((((..((((((((((..(((((((............)))))))..))))))))))...))))).. mlu ----------------------GGGCGUCUUACCAGACACGGUUAGACCU-GG--UCCUCUGUCUAAUACUGUCUGGUAAUGCCGUCCAUCCAC------------------- ENSEMBL GeneScaffold_3920:12710-12779(+) -29.6 (((((..((((((((((..(((((((..((....)))))))))..))))))))))...)))))...... pva ----------------------GGGCGUCUUACCAGACACGGUUAGACCU-GGGUCCUUCUGUCUAAUACUGUCUGGUAAUGCCGUCCAUCC--------------------- ENSEMBL GeneScaffold_2563:18114-18183(+) -30.7 (((((..((((((((((..(((((((..(((....))))))))))..))))))))))...))))).... eeu ----------------------GGGCGUCUUACCAGACAUGGUUAGAUCU-CG-UCCUGCUGUCUAAUACUGUCUGGUAAUGCCGUCCAUCC--------------------- ENSEMBL GeneScaffold_5889:41462-41530(+) -27.7 (((((..((((((((((..(((((((..((...))..)))))))..))))))))))...))))).... sar -------------------GAUGGGUGUCUUACCAGACACGGUUAGAUCU-GCGUCCUUCUGUCUAAUACUGUCUGGUAAUGCCAUCCAU----------------------- ENSEMBL scaffold_141740:125-195(-) -27.4 .(((((((..((((((((((..(((((((............)))))))..))))))))))...))))))) cho ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ete ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------- laf ----------------------GGGCGUCUUACCAGGCAAAGUUAGAUCU-GGAUCGUUCUGUCUAAUACUGUCUGGUAAUGCCGUCUGUC---------------------- ENSEMBL scaffold_26:22276923-22276991(-) -27.6 .(((((..(((((((((..(((((((..(((....))))))))))..))))))))))))))....... pca -----------------AUGACGGGUGUCUUACCAGGCAAAGUUAGAUCU-GCAUCCUUCUGUCUAAUACUGUCUGGUAAUGCCGUCUGUCAC-------------------- ENSEMBL scaffold_25591:5060-5135(-) -27.3 .(((((((((..((((((((((..(((((((............)))))))..))))))))))...))))))))). meu -------------------GAUUGGUGUCUUACCAGACAAAGUUAGAUCU-CGCUAUUUCCGUCUAAUACUGUCUGGUAAUGCCAUUGGUCA--------------------- ENSEMBL Scaffold20221:5429-5501(-) -27.8 (((..(((..((((((((((..(((((((............)))))))..))))))))))...)))..))). mdo -------------------GAUUGGUGUCUUACCAGACAAAGUUAGAUCU-CGCUAUUUCUGUCUAAUACUGUCUGGUAAUGCCAUUGGUCA--------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 4:389175425-389175496(+) -27.7 (((..(((..((((((((((..(((((((............)))))))..))))))))))...)))..))). oan CGGCGUGGAGGUGCCUGCUGAUUGGUGUCUUACCAGACAAAGUUAGAUCU-GACUAUUUUCGUCUAAUACUGUCUGGUAAUGCCGUCAAUCACAGCGGCAAGAUCUUCGUCUG miRbase UCSC ENSEMBL Ultra168:328495-328606(+) -44.0 .((((.(((..((((.(((((((((((..((((((((((..(((((((..((....))..)))))))..))))))))))...))))))))..)))))))...))).)))).. gga ------------GCCUGCUGAUUGCUGUCUUACCAGGCAAAGUUAGAUCU-AGCUAUUUCUGUCUAAUACUGUCUGGUAAUGCCGUCAAUCGCAUGG---------------- miRbase UCSC ENSEMBL 21:2580812-2580895(-) -29.2 .(((((.(((((..((.((((((((((..(((((((..((......)))))))))..)))))))))).))...)))))))).)) mga ---------------UGCUGAUUGCUGUCUUACCAGGCAAAGUUAGAUCU-AGCUAUUUCUGUCUAAUACUGUCUGGUAAUGCCGUCAAUCGCAU------------------ UCSC ENSEMBL 23:2748220-2748299(-) -27.5 (((.(((((..((.((((((((((..(((((((..((......)))))))))..)))))))))).))...)))))))). tgu ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------- aca -------------------GAUCGCUGUCUUACCAGACAAAGUUAGAUCUUAGCUAUCCCCGUCUAAUACUGUCUGGUAAUGCCGUCGAUCGC-------------------- UCSC ENSEMBL scaffold_876:294623-294697(+) -27.32 (((((..((.((((((((((..(((((((.............)))))))..)))))))))).))...))))).. xtr -----------UGCCUGUUGACCAAUGUCUUACCAGACAAGGUUAGAUCU-AGUUACUCUCGUCUAAUACUGUCUGGUAAUGCCGUUGGUCACAUUGGC-------------- miRbase UCSC ENSEMBL scaffold_985:57232-57318(+) -37.7 .(((.(((((((((((..((((((((((..(((((((..((.....)).)))))))..))))))))))...))))))))).)).))) dre -------------CUUGUUGAUGGACGUCUUACCAGACAUGGUUAGAUGU-AAUAACUUGUGUCUAAUACUGUCUGGUAAUGCCGUCCAUCACAUG----------------- miRbase UCSC ENSEMBL 23:23555463-23555544(+) -38.8 ..(((.((((((((..((((((((((..((((((..(((....)))..))))))..))))))))))...))))))))))).. gac -----------------UUGAUUGGCGUCUUACCAGACAUGGUUAGAUGU-AAUUAAUGGUGUCUAAUACUGUCUGGUAAUGCCGUCCAU----------------------- UCSC ENSEMBL groupXII:5710819-5710891(+) -27.6 .((..((((((..(((((((((..(((((((............)))))))..)))))))))))))))..)). ola ------------------UGAUUGGCGUCUUACCAGACAUGGUUAGAUGU-AAUUAUCCGAGUCUAAUACUGUCUGGUAAUGCCGUCCAU----------------------- UCSC ENSEMBL 7:216443-216514(-) -27.5 ((..((((((..(((((((((..(((((((............)))))))..)))))))))))))))..)). tru -------------------GAUAGGCGUCUUACCAGACAUGGUUAGAUGU-AAUUAUUGUUGUCUAAUACUGUCUGGUAAUGCCGUCCAU----------------------- UCSC ENSEMBL scaffold_147:354619-354689(-) -27.0 (((.(((((..(((((((((..((((((((..........))))))))..)))))))))))))))))... tni -----------AGCCUGUUGAUAGGCGUCUUACCAGACAUGGUUAGAUGU-AAUUAUUGUUGUCUAAUACUGUCUGGUAAUGCCGUCCAUUAAAUGGCA-------------- miRbase UCSC ENSEMBL Un_random:2992653-2992739(+) -33.4 .(((..(((((.((((..((((((((((..((((((((..........))))))))..))))))))))...)))).)))))..))). cin ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------- csa ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------- dme ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------- cel ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ********** ** ****** * ******************* ** * * ********** ** ****** * ******************* ** * * ********** ** ****** * ******************* ** * * * ********** ** ****** * ******************* ** * * * ********** ** ****** * ******************* **** * * ********** ** ****** * ******************** ***** * * ************* ****** ** ********************* ***** * * ************* ********* *************************** *** ** ************* ********** * *************************** *** ** ************* ********** * *************************** *** ** ************* ********** * ********************************* ** ** ************* ********** * ********************************* ** *** ************* ********** ** * ********************************* ** ***************** ********** ** * ********************************** ******************** ********** ** * *********************************** ******************** ********** ** * *********************************** ******************** ********** ** * *********************************** ******************** ********** ** * ************************************ ******************** ********** ** * ************************************ ******************** ********** ** * ************************************ ******************** ********** ** * ************************************ ******************** ********** ** ************************************** ******************************* ** ************************************** * ******************************* ** ************************************** * * ******************************** ** ************************************** ** ********************************** ** ************************************** ************************************** ** ************************************** * ************************************** ** **************************************** * ************************************** ******************************************* * ************************************** ********************************************* ************************************** ********************************************** ************************************** ********************************************** ************************************** ********************************************** *************************************** ********************************************** *************************************** ************************************************ *****************************************************************************************************************