hsa CUGGCCUCCAGGGCUUUGUACAUGGUAGGCUUUCAUUCAUUCGUUUGCACAUUCGGUGAAGGUC-UACUGUGUGCCAGGCCCUGUGCCAG miRbase UCSC ENSEMBL 14:101335397-101335485(+)        -47.7 (((((...((((((((.((((((((((((((((((((.....((....))....)))))))))))))))))))).)))))))).)))))
ptr ------------------------------------------------------------------------------------------                      
ggo CUGGCCUCCAGGGCUUUGUACAUGGUAGGCUUUCAUUCAUUCGUUUGCACAUUCGGUGAAGGUC-UACUGUGUGCCAGGCCCUGUGCCAG              ENSEMBL 14:83009674-83009763(+)          -47.7 (((((...((((((((.((((((((((((((((((((.....((....))....)))))))))))))))))))).)))))))).)))))
ppy CUGGCCUCCAGGGCUUUGUACAUGGUAGGCUUUCAUUCAUUCGUUUGCACAUUCGGUGAAGGUC-UACUGUGUGCCAGGCCCUGUGCCAG miRbase UCSC ENSEMBL 14:102415715-102415803(+)        -47.7 (((((...((((((((.((((((((((((((((((((.....((....))....)))))))))))))))))))).)))))))).)))))
mml CUGGCCUCCAGGGCUUUGUACAUGGUAGGCUUUCAUUCAUUCGUUUGCACAUUCGGUGAAGGUC-UACUGUGUGCCAGGCCCUGUGCCAG miRbase UCSC ENSEMBL 7:164153015-164153103(+)         -47.7 (((((...((((((((.((((((((((((((((((((.....((....))....)))))))))))))))))))).)))))))).)))))
cja CUGGCCUCCAGGGCUUUGUACAUGGUAGGCUUUCAUUCAUUCGUUUGCACAUUCGGUGAAGGUC-UACUGUGUGCCAGGCCCUGUGCCAG              ENSEMBL Contig371:938261-938350(+)       -47.7 (((((...((((((((.((((((((((((((((((((.....((....))....)))))))))))))))))))).)))))))).)))))
tsy ------------------------------------------------------------------------------------------                      
mmr ------------------------------------------------------------------------------------------                      
oga ------------------------------------------------------------------------------------------                      
tbe CUGGCCUCCAGGGCCUUGUACAUGGUAGGCUUUCAUUCAUUCGUUUGCACAUUCGGUGAAGGUC-UACUGUGUGCCAGGCCCUGUACCAG              ENSEMBL scaffold_146320:80336-80425(+)   -46.7 ((((....((((((((.((((((((((((((((((((.....((....))....)))))))))))))))))))).))))))))..))))
cpo ------------------------------------------------------------------------------------------                      
dor CUGGCCCCCAGGGCCUUGUACAUGGUAGGCUUUCAUUCAUUCGGUUGCACACGUGGUGAAGGUC-UACUGUGUGCCAGGUCCUGUGCCAG              ENSEMBL scaffold_5495:63915-64004(+)     -50.5 (((((...((((((((.((((((((((((((((((((....((........)).)))))))))))))))))))).)))))))).)))))
mmu -----CGCCAGGGCCUUGUACAUGGUAGGCUUUCAUUCAUUU-UUUGCACAUUCGGUGAAGGUCCUACUGUGUGCCAGGCCCUGUGCCA- miRbase UCSC ENSEMBL 12:110818443-110818525(+)        -45.09    .((((((((((.((((((((((((((((((((................)))))))).)))))))))))).)))))))).))..   
rno --GGCCUCCAGGGCCUUGUACAUGGUAGGCUUUCAUUCAUU-GUUUGCACAUUCGGUGAAGGUC-UACUGUGUGCCAGGCCCUGUGCC-- miRbase UCSC ENSEMBL 6:134170340-134170423(+)         -49.2   (((...((((((((.((((((((((((((((((((...(((....)))...)))))))))))))))))))).)))))))).)))   
str ------------------------------------------------------------------------------------------                      
opr CUGGCCUCCAGGGCCUUGUACAUGGUAGGCUUUCAUUCCUUCGUCUGCACGUCCGGUGAAGGUC-UACCGUGUGCCAGGCCCUGCGCCAG              ENSEMBL GeneScaffold_5253:22926-23015(+) -56.6 (((((...((((((((.((((((((((((((((((((....(((....)))...)))))))))))))))))))).)))))))).)))))
ocu ------------------------------------------------------------------------------------------                      
bta CUGGCCCCCAGGGCCUUGUACAUGGUAGGCUUUCAUUCAUUCGUUUGCACAUUCGGUGAAGGUC-UACUGUGUGCCAGGCCCUGUGCCAG miRbase UCSC ENSEMBL 21:65852824-65852912(+)          -50.4 (((((...((((((((.((((((((((((((((((((.....((....))....)))))))))))))))))))).)))))))).)))))
ttr CUGGCCCCCAGGGCCUUGUACAUGGUAGGCUUUCAUUCAUUCGUUUGCACAUUCGGUGAAGGUC-UACUGUGUGCCAGGCCCUGUGCCAG              ENSEMBL scaffold_113840:62702-62791(+)   -50.4 (((((...((((((((.((((((((((((((((((((.....((....))....)))))))))))))))))))).)))))))).)))))
vpa ------------------------------------------------------------------------------------------                      
ssc CUGGCCCCCAGGGCCUUGUACAUGGUAGGCUUUCAUUCAUUCGUUUGCACAUGCGGUGAAGGUC-UACUGUGUGCCAGGCCCUGUGCCAG              ENSEMBL 7:133858662-133858751(-)         -52.4 (((((...((((((((.(((((((((((((((((((.....(((........)))))))))))))))))))))).)))))))).)))))
cfa ----------------UGUACAUGGUAGGCUUUCAUUCAUUCGUUUGCACAUUCGGUGAAGGUC-UACUGUGUGCCAG------------ miRbase UCSC ENSEMBL 8:72137085-72137145(+)           -24.5               .((((((((((((((((((((.....((....))....))))))))))))))))))))...              
fca CUGGCCGCCAGGGCCUUGUACAUGGUAGGCUUUCAUUCAUUCGUUUGCACAUUCGGUGAAGGUC-UACUGUGUGCCAGGCCCUGUGCCAG              ENSEMBL scaffold_2954:5305-5394(+)       -50.4 (((((...((((((((.((((((((((((((((((((.....((....))....)))))))))))))))))))).)))))))).)))))
eca ------------------------------------------------------------------------------------------                      
mlu CUGGCCUCUAGGGCCUUGUACAUGGUAGGCUUUCAUUCAUUCGUUUGCACAUUCGGUGAAGGUC-UACUGUGUGCCAGGCCCUGUG----              ENSEMBL scaffold_189159:7983-8068(+)     -41.3   ........((((((((.((((((((((((((((((((.....((....))....)))))))))))))))))))).))))))))..  
pva CUGGCCUCCAGGGCCUUGUACAUGGUAGGCUUUCAUUCAUUCGUUUGCACAUUCGGUGAAGGUC-UACUGUGUGCCAGGCCCUGUGCCAG              ENSEMBL scaffold_9479:39858-39947(+)     -50.4 (((((...((((((((.((((((((((((((((((((.....((....))....)))))))))))))))))))).)))))))).)))))
eeu ------------------------------------------------------------------------------------------                      
sar ------------------------------------------------------------------------------------------                      
cho CUGGCCUCCAGGGCCUUGUACAUGGUAGGCUUUCACCCCUUCGU-UGCACAGUCGGUGAAGGUC-UAUUGUGUACCAGGCCCUGCGCCAG              ENSEMBL scaffold_394515:514-602(+)       -53.3 (((((...((((((((.(((((..(((((((((((((.((.........))..)))))))))))))..))))).)))))))).))))) 
ete ------------------------------------------------------------------------------------------                      
laf ------------------------------------------------------------------------------------------                      
pca ------------------------------------------------------------------------------------------                      
meu ------------------------------------------------------------------------------------------                      
mdo ------------------------------------------------------------------------------------------                      
oan ------------------------------------------------------------------------------------------                      
gga ------------------------------------------------------------------------------------------                      
mga ------------------------------------------------------------------------------------------                      
tgu ------------------------------------------------------------------------------------------                      
aca ------------------------------------------------------------------------------------------                      
xtr ------------------------------------------------------------------------------------------                      
dre ------------------------------------------------------------------------------------------                      
gac ------------------------------------------------------------------------------------------                      
ola ------------------------------------------------------------------------------------------                      
tru ------------------------------------------------------------------------------------------                      
tni ------------------------------------------------------------------------------------------                      
cin ------------------------------------------------------------------------------------------                      
csa ------------------------------------------------------------------------------------------                      
dme ------------------------------------------------------------------------------------------                      
cel ------------------------------------------------------------------------------------------                      
                    *******************  * **    *****    ********** **  **** ****            
         * * ***** *********************** ** ** ******  *********** ************** ****      
      **** ******* ************************************* *********** ******************* ***  
    ****** ******* ************************************************* ************************ 
    ****** ******* ************************************************* *************************
    ****** ******* ************************************************* *************************
    ****** ********************************************************* *************************
    **************************************************************** *************************
    **************************************************************** *************************
    **************************************************************** *************************
    **************************************************************** *************************
    **************************************************************** *************************
    **************************************************************** *************************
    **************************************************************** *************************
    **************************************************************** *************************
    **************************************************************** *************************
    **************************************************************** *************************
    ******************************************************************************************