hsa -GCCCUGUCCCCUGUGCCUUGGGCGGGCGGCUGUU-AAGACUUGCAGUGAUGUUUAA-CUCCUCUCCA-CGUGAACAUCACAGCAAGUCUGUGCUGCUUCCCGUCCCUACGCUGCCUGGGCAGGGU miRbase UCSC ENSEMBL 20:33578179-33578300(+) -62.32 (((((((((.....((...(((((((.(((.((..((((((((.((((((((((.............)))))))))).))))))))..)).))).)))).)))...)).....))))))))) ptr --CCCUGUCCCCUGUGCCUUGGGCGGGCAGCUGUU-AAGACUUGCAGUGAUGUUUAA-CUCCUCUCCA-CGUGAACAUCACAGCAAGUCUGUGCUGCUUCCCGUCCCUACGCUGCCUGGGCAGGGU miRbase UCSC ENSEMBL 20:32071340-32071460(+) -60.92 ((((((((.....((...(((((((.(((.((..((((((((.((((((((((.............)))))))))).))))))))..)).))).)))).)))...)).....)))))))). ggo -GCCCUGUCCCCUGUGCCUUGGGCGGGCGGCUGUU-AAGACUUGCAGUGAUGUUUAA-CUCCUCUCCA-CGUGAACAUCACAGCAAGUCUGUGCUGCUUCCCGUCCCUACGCUGCCUGGGCAGGGU ENSEMBL 20:32425321-32425443(+) -62.32 (((((((((.....((...(((((((.(((.((..((((((((.((((((((((.............)))))))))).))))))))..)).))).)))).)))...)).....))))))))) ppy -GCCCUGUCCCCUGUGCCUUGGGCGGGCGGCCGUU-AAGACUUGCAGUGAUGUUUAA-CUCCUCUCCA-CGUGAACAUCACAGCAAGUCUGUGCUGCUUCCCGUCCCUACGCUGCUUGGGCAGGGU miRbase UCSC ENSEMBL 20:32202566-32202687(+) -62.62 (((((((((...((((...(((((((.(((.((..((((((((.((((((((((.............)))))))))).))))))))..)).))).)))).)))...)).))..))))))))) mml --GCCCUGUCCCCGUGUCUUGGGCGGGCAGCUGUU-AAGACUUGCAGUGAUGUUUAA-CUCCUCUCCA-CGUGAACAUCACAGCAAGUCUGUGCUGCUUCCCGUCCCUACGCUGCCUGGGCAGGGU miRbase UCSC ENSEMBL 10:29569163-29569283(-) -62.52 (((((((((..((((...(((((((.(((.((..((((((((.((((((((((.............)))))))))).))))))))..)).))).)))))))..)))).....))))))))) cja ----------------------------GGCCGUU-AAGACUUGCAGUGAUGUUUAA-CUCCUCUCCA-CGUGAACAUCACAGCAAGUCUGUGCUGCUUC-------------------------- ENSEMBL Contig222:1371688-1371757(-) -27.42 (((.((..((((((((.((((((((((.............)))))))))).))))))))..)).))).. tsy ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ mmr ------------------------GGGCGGCUGUU-AAGACUUGCAGUGAUGUUUAA-CUCCUCUCCA-CGUGAACAUCACAGCAAGUCUGUGCUGCU---------------------------- ENSEMBL GeneScaffold_1783:141522-141593(+) -32.62 .((((((.....((((((((.((((((((((.............)))))))))).))))))))..)))))) oga ---------CCCUGUUCCCUGGGCGGGCGGCUGUU-AAGACUUGCAGUGAUGUUUAA-CUCCUCUC-G-CGUGAACAUCACGGCAAGUCUGUGCUGCUUCCCGUCC-------------------- ENSEMBL GeneScaffold_2076:160033-160126(+) -43.8 ...........(((((((.(((.((..((((((((.((((((((((............)))))))))).))))))))..)).))).))))))) tbe ------------------------GGGCGGCUGUU-AAGACUUGCAGUGAUGUUUAA-CUCCUCUCCA-CGUGAACAUCACAGCAAGUCUGUGCUGC----------------------------- ENSEMBL GeneScaffold_541:18603-18673(+) -30.62 ..(((((.....((((((((.((((((((((.............)))))))))).))))))))..))))) cpo ------------------------GGGCGGCUGUU-AAGACUUGCAGUGAUGUUUAA-UUCCUCUCCA-CGUGAACAUCACAGCAAGUCUGUGCUGCU---------------------------- UCSC ENSEMBL scaffold_45:1799349-1799420(+) -32.62 .((((((.....((((((((.((((((((((.............)))))))))).))))))))..)))))) dor ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ mmu --------------------GGGUGGGCAGCUGUU-AAGACUUGCAGUGAUGUUUAG-CUCCUCUGCA-UGUGAACAUCACAGCAAGUCUGUGCUGCUGCCU------------------------ miRbase UCSC ENSEMBL 2:155448616-155448694(+) -41.2 ....(((((((.((..((((((((.((((((((((((......))...)))))))))).))))))))..)).))))))) rno -----------------------------GCUGUU-AAGACUUGCAGUGAUGUUUAG-CUCCUCUCCA-UGUGAACAUCACAGCAAGUCUGUGCUGC----------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 3:146127959-146128023(+) -25.62 ((.((..((((((((.((((((((((.............)))))))))).))))))))..)).)) str ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ opr ---CCUGUCCCCUGCACCCUGGGCGGGCGGCUGUU-AAGACUUGCAGUGAUGUUUAA-UUCCUGUCCG-CGUGAACAUCACAGCAAGUCUGUGCUGCCUCCCGUCCCCAUGCC------------- ENSEMBL scaffold_1065:231429-231536(+) -48.22 ..........(((....(((((((.(((.((..((((((((.((((((((((.............)))))))))).))))))))..)).))).)))))))...))). ocu -------UCCCCUGCGCCCUGGGCGGGCAGCCGUU-AAGACUUGCAGUGAUGUUUAA-UUCCUCUCCA-CGUGAACAUCACAGCAAGUCUGUGCUGCUUCCCGUUCCC------------------ ENSEMBL scaffold_65:4775711-4775809(-) -41.02 .............(((((((.(((.((..((((((((.((((((((((.............)))))))))).))))))))..)).))).))))))).. bta --------------------GGGCGGGCGGCCGUU-AAGACUUGCAGUGAUGUUUAA-CUCCUCUCCA-CGUGAACAUCACAGCAAGUCUGUGCUGCUUCCCGUCCCCACGCUGCCUGGGCAGGGU miRbase UCSC ENSEMBL 13:64874840-64874942(+) -52.42 (((((((.(((.((..((((((((.((((((((((.............)))))))))).))))))))..)).))).)))))))..((.((((....)))).)) ttr ----------------------------GGCCGUU-AAGACUUGCAGUGAUGUUUAA-UUCCUCUCCA-CGUGAACAUCACAGCAAGUCUGUGCUGCUUC-------------------------- ENSEMBL GeneScaffold_1251:182956-183025(+) -27.42 (((.((..((((((((.((((((((((.............)))))))))).))))))))..)).))).. vpa ----------------------------GGCCGUU-AAGACUUGCAGUGAUGUUUAA-CUCCUCUCCA-CGUGAACAUCACAGCAAGUCUGUGCUGCUUC-------------------------- ENSEMBL GeneScaffold_575:777908-777977(+) -27.42 (((.((..((((((((.((((((((((.............)))))))))).))))))))..)).))).. ssc -------------------UGGGCGGGCGGCCGUU-AAGACUUGCAGUGAUGUUUAA-CUCCUCUCCA-CGUGAACAUCACAGCAAGUCUGUGCUGCUUCCC------------------------ miRbase ENSEMBL 17:40405262-40405341(-) -36.82 .(((.(((((((.....((((((((.((((((((((.............)))))))))).))))))))..)))))))))) cfa ----------------------------------UUAAGACUUGCAGUGAUGUUUAA-CUCCUCUCCA-CGUGAACAUCACAGCAAGUCUGUGCU------------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 24:27001150-27001208(+) -23.42 ...((((((((.((((((((((.............)))))))))).))))))))..... fca ------------------------GGGCGGCUGUU-AAGACUUGCAGUGAUGUUUAA-CUCCUCUCU--UGUGAACAUCACAGCAAGUCUGUGCUGCU---------------------------- ENSEMBL GeneScaffold_796:677295-677365(+) -33.1 .((((((.....((((((((.(((((((((.((.........))))))))))).))))))))..)))))) eca UGUUCUGUCCCCUGCACCCUGGGCGGGCGGCUGUU-AAGACUUGCAGUGAUGUUUAA-CUCCUCUCCA-CGUGAACAUCACAGCAAGUCUGUGCUGCUUCCCGUCCCCAUGCUGCCUGGGCAGGGU miRbase UCSC ENSEMBL 22:25813224-25813346(+) -57.42 .........((((((.....(((((((.(((.((..((((((((.((((((((((.............)))))))))).))))))))..)).))).)))))))(((.......))))))))). mlu ----------------------------GGCCGUU-AAGACUUGCAGUGAUGUUUAA-CUCCUCUCCA-CGUGAACAUCACAGCAAGUCUGUGCUGCUUC-------------------------- ENSEMBL GeneScaffold_621:36598-36667(+) -27.42 (((.((..((((((((.((((((((((.............)))))))))).))))))))..)).))).. pva ----------------------------GGCCGUU-AAGACUUGCAGUGAUGUUUAA-CUCCUCUCCA-CGUGAACAUCACAGCAAGUCUGUGCUGCUUC-------------------------- ENSEMBL GeneScaffold_403:21132-21201(+) -27.42 (((.((..((((((((.((((((((((.............)))))))))).))))))))..)).))).. eeu ------------------------GGGCAGCUGUU-AAGACUUGCAGUGAUGUUUAA-CUCCUCUCCA-CGUGAACAUCACAGCAAGUCUGUGCUGCU---------------------------- ENSEMBL GeneScaffold_884:16763-16834(+) -33.32 .((((((.....((((((((.((((((((((.............)))))))))).))))))))..)))))) sar ----------------------------GGCCGUU-AAGACUUGCAGUGAUGUUUAA-CUCCU-CACA-CGUGAACAUCACAGCAAGUCUGUGCUGCUGCCU------------------------ ENSEMBL GeneScaffold_698:23575-23645(+) -29.7 (((.((..((((((((.((((((((((............)))))))))).)))))))).....)).))). cho ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ ete ----------------------------GGCCGUUUAAGACUUGCAGUGAUGUUUAAACUUCUGUCCA-CGUGAACAUCACAGCAAGUCUGUGCUGCUUCUCGUCCC------------------- ENSEMBL GeneScaffold_3446:198846-198924(+) -29.0 (((.((...((((((((.((((((((((.((....)).....)))))))))).))))))))..)).)))......... laf ------------------------GGGCAGCCGUU-AAGACUUGCAGUGAUGUUUAA-CUCCUCUCCA-CGUGAACAUCACAGCAAGUCUGUGCUGCU---------------------------- ENSEMBL scaffold_19:34242646-34242717(+) -32.62 .((((((.....((((((((.((((((((((.............)))))))))).))))))))..)))))) pca ------------------------GGGCAGCCGUU-AAGACUUGCAGUGAUGUUUAA-CUCCUCUCCA-CGUGAACAUCACAGCAAGUCUGUGCUGCU---------------------------- ENSEMBL GeneScaffold_778:15087-15158(+) -32.62 .((((((.....((((((((.((((((((((.............)))))))))).))))))))..)))))) meu ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ mdo --------------------GGGCGGGCAGCUGUU-AAGACUUGCAGUGAUGUUUAA-UUCUUCUCUA-UGUGAACAUCACAACAAGUCUAUACAGUUUCCC------------------------ miRbase UCSC ENSEMBL 1:388424206-388424284(+) -31.92 ....(((.((((((..(((((((..((((((((((.............))))))))))..)))))))..)))))).))) oan ---------------AGCCUGGGGGGGCAGCGGUU-AAGACUUGUAGUGAUGUUUAG-CUCAUCUCCA-CGUGAACAUCACUGCAAGUCUGUGCUGCUUCUCCCCUCCU----------------- miRbase UCSC ENSEMBL Contig212181:155-245(+) -49.52 .....(((((((.((((((..(((((((((((((((((((.............)))))))))))))))))))..))))))...))))))). gga -----------------UUUGAGGGAGCGGCAGUU-AAGACUUGUAGUGAUGUUUAGAUAAUGUAUUA-CAUGAACAUCACUUUAAGUCUGUGCUACUUCUCUCCUCAUU---------------- miRbase UCSC ENSEMBL 20:2599334-2599424(-) -38.0 ..((((((((.((.(((..(((((((.(((((((((((..(((....)))..))))))))))).)))))))..))).)).))).))))).. mga ------------------------GAGCGGCAGUU-AAGACUUGUAGUGAUGUUUAGAUAAUGUAUUA-CAUGAACAUCACUUUAAGUCUGUGCUACUUCUCUCCUC------------------- UCSC ENSEMBL 22:2958168-2958249(+) -29.5 (((.((.(((..(((((((.(((((((((((..(((....)))..))))))))))).)))))))..))).)).)))..... tgu ------------------------GAGCGGCAGUU-AAGACUUGUAGUGAUGUUUAGAUAAUUAAUUA-CAUGAACAUCACUUUAAGUCUGUGCUACU---------------------------- ENSEMBL 20:3206409-3206481(-) -27.5 .((..(((....(((((((.(((((((((((..(((....)))..))))))))))).))))))).)))..)) aca ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ xtr ------------------GUGAGAGCGAGGCAGUU-AAGACUUGCAGUGAUGUUUAGUUAAAAUCUUUUCAUGAACAUCACUUUAAGUCUGUACUGCUUCUCCCUC-------------------- miRbase UCSC ENSEMBL scaffold_38:3859186-3859272(-) -36.16 ((....))((((((((..(((((((.(((((((((((...............))))))))))).)))))))..))))))))...... dre -----------------ACUGAGAGGGAGGCAGUU-AAGACUUGCAGUGAUGUUUAGAGAAAUG-UCA-CAUGAACAUCACUUUAAGUCUGUGCUGGCUCCUGUUCUGAGU--------------- miRbase UCSC ENSEMBL 11:24971008-24971098(-) -42.5 (((.((((((((.((((..(((((((.(((((((((((..((....))...))))))))))).)))))))..)))).)))))..))).))) gac --------------------------GAGGCAGUU-AAGACUUGCAGUGAUGUUUAGGGCAAUGAUCA-CAUGAACAUCACUCUAAGUCUGUGCUGGCUC-------------------------- UCSC ENSEMBL groupXVII:10484784-10484856(-) -32.0 (((.((((..(((((((.(((((((((((.((......))...))))))))))).)))))))..)))).))) ola ------------------------------CAGUU-AAGACUUGCAGUGAUGUUUAGGGCAAUGAUGA-CAUGAACAUCACUUUAAGUCUGUGCUGACUC-------------------------- UCSC ENSEMBL 5:26842835-26842903(-) -27.8 ((((..(((((((.(((((((((((...((....))...))))))))))).)))))))..)))).... tru --------------------------GAGGCAGUU-AAGACUUGCAGUGAUGUUUAGGGCAAUGAUCA-CAUGAACAUCACUUUAAGUCUGUGCUGGCUC-------------------------- UCSC ENSEMBL scaffold_79:632978-633050(-) -32.0 (((.((((..(((((((.(((((((((((.((......))...))))))))))).)))))))..)))).))) tni --------------------------GAGGCAGUU-AAGACUUGCAGUGAUGUUUAGGGCAAUGAUCA-CAUGAACAUCACUUUAAGUCUGUGCUGGCUC-------------------------- UCSC ENSEMBL 11:10020013-10020085(-) -32.0 (((.((((..(((((((.(((((((((((.((......))...))))))))))).)))))))..)))).))) cin ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ csa ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ dme ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ cel ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ * ******** *********** ********** ****** * * * *** ******** *********** ********** ******** ** ** *** ******** *********** ********** *********** ** *** ******** *********** * ********** *********** ** *** ******************** * * * ********** ************ ** *** ******************** * * * ********** ************ ** *** ******************** * * * ********** ************ ** *** ******************** * * * ********** ************* ** *** ******************** * ** * ********** ************* ** *** ******************** * * ** ************ *************** * ** *** ******************** ** * * ** ************ **************** * * ** *** ******************** **** **** ***************************** * * *** *** ********************* ********* ******************************* * * *** *** ********************* ********* ******************************* * * *** *** ********************* ********** ******************************* * ***** *** ********************* ********** ******************************* * ***** *** ********************* ********** ******************************* ******* *** ********************* ********** ******************************* ******* *** ********************* ********** ******************************* ******* *** ********************* ********** ******************************* ******* *** ********************* ********** ******************************* ******* *** ********************* ********** ******************************* * * ******* *** ********************* ********** ******************************* * * * ******* *** ********************* ********** ******************************* * * * *********** ********************* ********** ********************************* **** *********** ********************* ********** ********************************* **** *********** ********************* ********** ********************************* *** **************** ********************* ********** ************************************** **************** ********************* ********** ************************************** * **************** ********************* ********** ************************************** *** * * **************** ********************* ********** ************************************** * ***** ** **************** ********************* ********** ************************************** * ** * ******* ** **************** ********************* ********** ************************************** * ***** ********** ******************************** ********************* ********** ************************************** ****************** ******************************** ******************************** ********************************************************* ********************************** ******************************** ********************************************************* ********************************** ******************************** ********************************************************* ******************************************************************* ********************************************************* ******************************************************************************************************************************