hsa AGAUGUGCUCUCCUGGCCCAUGAAAUCAAGCGUGGGUGAGACCUGGUGCAGAACGGGAA-GGCGACCCAUACUUGGUUUCAGAGGCUGUGAGAAUAA------ miRbase UCSC ENSEMBL 3:168269642-168269737(+) -39.6 ........((((.(((((..((((((((((..((((((...((((........))))....)).))))..))))))))))..))))).))))....
ptr -GAUGUGCUCUCCUGGCCCAUGAAAUCAAGCGUGGGUGAGACCUGGUGCAGAACGGGAA-GGCGACCCAUACUUGGUUUCAGAGGCUGCGAGAAUA------- miRbase UCSC ENSEMBL 3:173737675-173737768(+) -39.6 .......((((.(((((..((((((((((..((((((...((((........))))....)).))))..))))))))))..))))).))))...
ggo -------------------------------------------------------------------------------------------------------
ppy AGAUGUGCUCUCCUGGCCCAUGAAAUCAAGUGUGGGUGAGACCUGGUGCAGAACGGGAA-GGCGACCCAUACUUGGUUUCAGAGGCUGUGAGAAUA------- miRbase UCSC ENSEMBL 3:172088663-172088757(+) -43.7 ........((((.(((((..((((((((((((((((((...((((........))))....)).))))))))))))))))..))))).))))...
mml AGAUGUGCUCUCCUGGCCCAUGAAAUCAAGCGUGGGUGAGACCUGGUGCAGAACAGGAA-GGCGACCCAUACUUGGUUUCAGAGGCUGCGAGAAUA------- miRbase UCSC ENSEMBL 2:118520037-118520131(-) -40.3 ........((((.(((((..((((((((((..((((((...((((........))))....)).))))..))))))))))..))))).))))...
cja -------------------------------------------------------------------------------------------------------
tsy -GAUGUACUCUCCUGGCCGGUGAGAUCAAGCAUGGGUGAGACCUGGUGCA---CAGGAA-GGCGACCCAUACUUGGUUUCAGAGGCUGCGAGAAU-------- ENSEMBL scaffold_6426:2636-2726(+) -40.3 .......((((.(((((..((((((((((.(((((((...((((.....))))....)).))))).))))))))))..))))).))))..
mmr AGAUGUGCUCUCCUGGCCCAUGAAAUCAAGCGUGGGUGAGACCUGGUGCAGAACAGGAA-GGCGACCCAUACUUGGUUUCAGAGGCUGUGAGAAUA------- ENSEMBL scaffold_4640:34986-35081(+) -40.3 ........((((.(((((..((((((((((..((((((...((((........))))....)).))))..))))))))))..))))).))))...
oga --------------GGCCCGUGAAAUCAAGCGUGGGUGAGACCUGGUGCAGAACAGGAA-GGCGACCCACACUUGGUUUCAGGGGCUGUGAGAA--------- ENSEMBL scaffold_107994:7989-8068(+) -41.7 (((((.((((((((((.(((((((...((((........))))....)).))))).)))))))))).))))).......
tbe AGAUGUGCUCUCCUGGCCCAUGAAAUCAAGCGUGGGUGAGACCUGGUGCAGAACAGGAA-GGCGACCCAUACUUGGUUUCAGAGGCUGUGAGAAU-------- ENSEMBL GeneScaffold_5780:87700-87794(+) -40.3 ........((((.(((((..((((((((((..((((((...((((........))))....)).))))..))))))))))..))))).))))..
cpo ----GUGCUCUUGUGGCCCAGGAAAUCAAGCGUGGGUGAGACCUGGUGCGGAAGGGGAA-GGCGACCCAUACUUGGUUUCAGAGGCUGCAAGAAUACC----- UCSC ENSEMBL scaffold_100:1116222-1116315(+) -41.0 (((.(((((..(((...(((((((((..((((((...(((........)))......)).))))..)))))))))...)))..))))).))).
dor ----------------CCCAUGAAAUCAAGCGUGGGUGAGACCUGGUGCAGAACAGGAA-GGCGACCCAUACUUGGUUUCAGAGGCUG--------------- ENSEMBL scaffold_369:121630-121701(+) -29.3 ((..((((((((((..((((((...((((........))))....)).))))..))))))))))..))...
mmu ----GUGCUCUUGUGGCCCAUGAAAUCAAGCUUGGGUGAGACCUGGUGCAGAACAGGAA-GGCGACCCAUACUUGGUUUCAGUGGCUGCAAGAAUGACUGCAU miRbase UCSC ENSEMBL 3:29315745-29315842(+) -43.3 (((((((((..(((..((((((((((..((((((...((((........))))....)).))))..))))))))))..)))..)))))......))))
rno ----GUGCUCUUGUGGCCCAUGAAAUCAAGCUUGGGUGAGACCUGGUACAGAACAGGAA-GGCGACCCAUACUUGGUUUCAGUGGCUGCAAGAAUGGCUCUAU miRbase UCSC ENSEMBL 2:114095878-114095975(+) -42.7 ..(((((((..(((..((((((((((..((((((...((((........))))....)).))))..))))))))))..)))..)))))...)).....
str -------------------------------------------------------------------------------------------------------
opr -------CUCUCGUGGCCCGUGAAAUCAAGCGUGGGUGAGACCUGGUGCAGAA-GGGAA-GGCGACCCAUACUUGGUUUCAGAGGCUGUGAG----------- ENSEMBL scaffold_50778:3792-3875(+) -38.3 ..((((..(((..((((((((((..((((((...(((........))).....)).))))..))))))))))..)))..))))
ocu AGAUGAGCUCUCCUGGCCCAUGAAAUCAAGCGUGGGUGAGACCUGGUGCAGAACAGGAA-GGCGACCCAUACUUGGUUUCAGAGGCUGCGAGAAUA------- ENSEMBL scaffold_6:32099278-32099373(-) -40.3 ........((((.(((((..((((((((((..((((((...((((........))))....)).))))..))))))))))..))))).))))...
bta AGAGAAGUUCUCCUGGCCUAAGAAAUCAAGCGUGGGUGAGACCUGGUGCAGAACAGGAA-GGCGACCCAUACUUGGUUUCAGAGGCUGUGAGAAUA------- miRbase UCSC ENSEMBL 1:101235421-101235515(-) -42.4 ......((((((.((((((..(((((((((..((((((...((((........))))....)).))))..)))))))))..)))))).)))))).
ttr -----UGCUCUCCUGGCCUAAGAAAUCAAGCAUGGGUGAGACCUGGUGCAGAACAGGAA-GGCGACCCAUACUUGGUUUCAGAGGCUGUGAGAAUA------- ENSEMBL scaffold_110055:274922-275012(+) -39.5 ...((((.((((((..(((((((((.(((((((...((((........))))....)).))))).)))))))))..)))))).))))...
vpa -----UGCUCUCCUGGCCCAUGAAAUCAAGCGUGGGUGAGACCUGGUGCAGAACAGGAA-GGCGACCCAUACUUGGUUUCAGAGGCUGUGAGAA--------- ENSEMBL GeneScaffold_2659:1589661-1589749(+) -40.3 ...((((.(((((..((((((((((..((((((...((((........))))....)).))))..))))))))))..))))).)))).
ssc -------------------------------------------------------------------------------------------------------
cfa ----GUGCUCUCCUGGCCCAUGAAAUCAAGUGUGGGUGAGACCUGGUGCACAGCGGGAA-GGCGACCCAUACUUGGUUUCAGAGGCUGCGAGAAU-------- miRbase UCSC ENSEMBL 34:36298219-36298308(+) -42.7 ....((((.(((((..((((((((((((((((((...((((........))))....)).))))))))))))))))..))))).))))..
fca -------------------------------------------------------------------------------------------------------
eca -------------------AUGAAAUCAAGCGUGGGUGAGACCUGGUGCAGAACGGGAA-GGCGACCCAUACUUGGUUUCAG--------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 19:9177992-9178053(+) -26.2 .((((((((((..((((((...((((........))))....)).))))..)))))))))).
mlu -------------------------------------------------------------------------------------------------------
pva AGAUGUGCCCUCCUGGCCCAUGAAAUCAAGCAUGGGUGAGACCUGGUGCAGAACAGGAA-GGCGACCCAUACUUGGUUUCAGAGGCUGCGAGAAUA------- ENSEMBL scaffold_467:86033-86128(+) -38.4 .........(((.(((((..((((((((((.(((((((...((((........))))....)).))))).))))))))))..))))).)))....
eeu -------CUCUCCUGGCCCAUGAAAUCAAGCCUGGGUGAGACCUGGUACAGAACAAGAAAGGCGACCCAUACUUGGUUUCAGAGGCUAUGAG----------- ENSEMBL scaffold_214978:7759-7844(-) -32.5 ..(((.(((((..((((((((((..(((((....(((.((.....)).....)))..)))))..))))))))))..))))).)))
sar ---UGUGCUCUCUUGGUCUAUGAAAUCAAGCGUGGGUGAGACCUGGUGCAGAACAGGAA-GGCGACCCAUACUUGGUUUCAGAGGCUGAGAGAAUA------- ENSEMBL scaffold_54744:1773-1865(-) -43.6 .....(((((..((((.((((((((((..((((((...((((........))))....)).))))..)))))))))).))))..)))))...
cho -------------------------------------------------------------------------------------------------------
ete --------UCUCGUGGCCCAUGAAAUCAAGCAUGGGUGAGACCUGGUGCAGAACAGGAA-GGCGACCCAUACUUGGUUUCAGAGGCUGCGAGAA--------- ENSEMBL scaffold_265869:13635-13720(-) -45.8 (((((..(((..((((((((((.(((((((...((((........))))....)).))))).))))))))))..)))..))))).
laf -------------------------------------------------------------------------------------------------------
pca -------GUCCCGUGGCCCAUGAAAUCAAGCGUGGGUGAGACCUGGUGCAAAACAGGAA-GGCGACCCAUACUUGGUUUCAGAGGCUGCGAGAAUA------- ENSEMBL scaffold_27838:14599-14687(+) -41.7 .((.((..(((..((((((((((..((((((...((((........))))....)).))))..))))))))))..)))..)).))...
meu -------------------------------------------------------------------------------------------------------
mdo ----------------CCCCAGAAAUCAAGGAUGGGUGAGACCUCGUGUGCAAACUGAAAGGCGACCCAUACUUGGUUUCAGGGGCU---------------- miRbase UCSC ENSEMBL 7:234027689-234027759(-) -29.3 ((((.(((((((((.((((((....(((...((....))....)))..)))))).))))))))).))))..
oan -------------------------------------------------------------------------------------------------------
gga -----------------UCCAGAAAUCAAGGGUGGGUAAGACCUUGUAGGAUAACUGGCAGGCGACCCAUACUUGGUUUCAGGGGCUGUG------------- UCSC ENSEMBL 9:21966420-21966493(-) -27.7 (((.(((((((((..(((((.....(((((((.....)).)))))..)))))..))))))))).)))......
mga -----------------UCCAGAAAUCAAGGGUGGGUAAGACCUCGUAGGACAACUGGCAGGCGACCCAUACUUGGUUUCAGGGGCUGUG------------- UCSC ENSEMBL 11:20975630-20975703(-) -27.6 (((.(((((((((..(((((....(((..(((.....)))..)))..)))))..))))))))).)))......
tgu -----------------UCCAGAAAUCAAGGGUGGGUAAGACCUGGUGAGCAAACUCUAAGGCGACCCAUACUUGGUUUCAGGGGCUGUG------------- ENSEMBL 9:23617026-23617099(-) -29.2 (((.(((((((((..(((((....(((...(((....)))..)))..)))))..))))))))).)))......
aca ---------------GCUCCAGAAAUCAAGGUUGGGUGAGACCUCGUGAACAGACUGGAAGGCGACCCAUACUUGGUUUCAGGAGC----------------- UCSC ENSEMBL scaffold_630:661020-661091(+) -27.8 (((((.(((((((((..((((((...((..((......)).))....)).))))..))))))))).)))))
xtr -----------------CUUAGAAAUCAAGCUUGGGUUAGACCUGGUUCUUAUACACUGAGGCGACCCAUACUUGGUUUCUGAGGCUG--------------- UCSC ENSEMBL scaffold_3:3597323-3597394(+) -29.4 (((((((((((((..((((((...((((((........))).))).))))))..)))))))))))))....
dre -------------------------------------------------------------------------------------------------------
gac -------------------------------------------------------------------------------------------------------
ola -------------------------------------------------------------------------------------------------------
tru -------------------------------------------------------------------------------------------------------
tni -------------------------------------------------------------------------------------------------------
cin -------------------------------------------------------------------------------------------------------
csa -------------------------------------------------------------------------------------------------------
dme -------------------------------------------------------------------------------------------------------
cel -------------------------------------------------------------------------------------------------------
** ****** ***** ****** ** ********* ********** *
********* ***** ****** ** ********************** **
********* ***** ****** ** * ********************** ****
********* ***** ****** ** * * * ********************** ****
********* *************** ** * * ********************** *****
* ********* ***************** ** *** ********************** *****
*** ********* ****************** ** *** ********************** *****
**** ********** ****************** ** **** ********************** *****
***** ********** ****************** *** **** ********************** ***** ***
* ****************** ********************** **** **************************** ***
*** ***************************************** **** **************************** *****
*** ***************************************** **** **************************** *****
***** ***************************************** **** **************************** *****
***** ********************************************** **************************** ******
****** ********************************************** **************************** ******
******* ********************************************** **************************** ******
******************************************************* **************************** ******
******************************************************* ***********************************
******************************************************* ************************************
******************************************************* ************************************
********************************************************** ************************************
********************************************************** ************************************
*********************************************************** ************************************
************************************************************************************************
************************************************************************************************
************************************************************************************************
************************************************************************************************
************************************************************************************************ *
*************************************************************************************************** **
*******************************************************************************************************