hsa ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
ptr ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
ggo ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
ppy ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
mml ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
cja ---GGUGAUCUAGCCCUUUCGUUUUGAGGUUGGUGUAUUAUGUGUGAGUAUACAU--AUUUAUCACACACAGUCACUGUCUUAAAAAGUGAAGGUGCAUAUAUUUCUCAGCCAU ENSEMBL Contig575:56718-56827(-) -27.52 ((((((.(((((((((..(((((((...((((.(((.(((((((.............))))))).)))))))..)))))))...))))).)).)).))).....)))..
tsy GAUGGUGAUCUAGCCCUUUAGUUUUGAGGUUGGUGUACUGUGUGUGAGUAUACAU--AUUUAUCACACACAGUCACUAUCUUCGAAAGUGAGGGUGCACAUC------------ ENSEMBL scaffold_7630:33509-33609(-) -44.32 ((((.((.....(((((.((.((((((((.(((((.(((((((((((.............)))))))))))))))).)))))))).))))))).))))))
mmr GAUGGUGAUUUGGCCCUUUAGUUUUGAGGUUGGUGUACUGUGUGUGAGUACACAU--AUUUAUCACACACAGUCACUAUCCUCGAAACUAAGGGUGCACAUC------------ ENSEMBL scaffold_3543:51269-51369(-) -51.12 ((((........(((((((((((((((((.(((((.(((((((((((.............)))))))))))))))).))))))))))))))).)).))))
oga GAUGGUGAUCUUGCCCUUUAGUUUUGAGGUUGGUGUACUGUGUAUGAGUAUACAU--AUUUAUCACACACAGUCACUAUCUUCAAAAGUGAGGGUGCACAUC------------ ENSEMBL GeneScaffold_4407:95285-95385(-) -39.6 ...((((....(((((((((.((((((((.(((((.((((((((((((((....)))))))...)))))))))))).)))))))).)))))).)))))))
tbe ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
cpo ---------------CUUUAGUUUUGAGGUUGGUGUACUGUGUGUGGGUAUACAU--AUUUAUCCCACACAGCCACUAUGUUUCAAAGC------------------------- UCSC ENSEMBL scaffold_26:21954909-21954981(+) -27.4 .....((((((((..(((((..(((((((.(((((........)))))))))))).)))))...))))))))
dor GAUGGUGAUCUAGCCCUUUAGUUUUGAGGUUGGUGUACUGUGUGUGAGUAUACUU--AUUUAUCACACACAGUCACUGUCUUCGAAAGUGAGGGUGCACAUC------------ ENSEMBL scaffold_23388:19484-19584(+) -42.92 ((((.((.....(((((.((.((((((((.(((((.(((((((((((.............)))))))))))))))).)))))))).))))))).))))))
mmu GAUGGUGAUCUAGCCCUUUAGUUUUGAGGUUGGUGUACUGUGUGUGAGUAUACAU--AUUUAUCACACACAGUCACUAUCUUCGAAAGUGAGGGUGCACAUC------------ miRbase UCSC ENSEMBL X:101311514-101311613(-) -44.32 ((((.((.....(((((.((.((((((((.(((((.(((((((((((.............)))))))))))))))).)))))))).))))))).))))))
rno --------------CCUUUAGUUUUGAGGUUGGUGUACUGUGUGUGAGUAUACAU--AUUUAUCACACACAGUCGCCAUCUUCGAAAGUGAGGGUG------------------ miRbase UCSC ENSEMBL X:92107908-92107987(-) -41.82 ((((((.((((((((.(((((.(((((((((((.............)))))))))))))))).)))))))).))))))..
str GAUGGUGAUCUAGCCCUUUAGUUUUGAGGUUGGUGUACUGUGUGUGAGUAUGCAU--AGUUAUCACACACAGUCACUAUCUUCGAAAGUGAGGGUGCACAUC------------ ENSEMBL GeneScaffold_257:119127-119227(-) -44.32 ((((.((.....(((((.((.((((((((.(((((.(((((((((((.............)))))))))))))))).)))))))).))))))).))))))
opr ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
ocu GAUGGUGAUCUAGCCCUUUAGUUUUGAGGUUGGUGUACUGUGUGUGAGUAUACAU--AUUUAUCACACACAGUCACUAUCUUCGAAAGUGAGGGUGCACAUC------------ ENSEMBL scaffold_141:1030772-1030872(+) -44.32 ((((.((.....(((((.((.((((((((.(((((.(((((((((((.............)))))))))))))))).)))))))).))))))).))))))
bta ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
ttr GAUGGUGAUCUUGCCCUUUAGUUUUGAGGUUGGUAUACUCUGUGAGAAUAUA------UUUAUCACACACAGUCACUAUCUUCGAAAGUGAGGGUGCACAUC------------ ENSEMBL scaffold_114535:14586-14682(-) -29.9 ...((((....(((((((((.((((((((.((((..(((.((((.((.((....)))).)))).))).)))).)))))))).)))))).)))))))
vpa ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
ssc ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
cfa ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
fca ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
eca GAUGGCGAUCUAGCCCUUUAGUUUUGAGGUUGGUGUACUGUGUGUGAGUAUAUAU--AUUUAUCACACAUAGGCAAUAUCUUUGAAAGUGAGGGUGCACGUC------------ miRbase UCSC ENSEMBL X:55914662-55914761(-) -34.42 ...((((.....((((((((.(((..(((....(((.((((((((((.............)))))))))))))....)))..))).)))))).)).))))
mlu ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
pva GAUGGUGAUCUAGCCCUUUAGUUUUGAGGUUGGUGUACUGUGUGUGAGUAUAUAC--AUUUAUCACACACAGUCACUAUCUUCGAAAGUGAGGGUGCACAUC------------ ENSEMBL scaffold_18031:17546-17646(-) -44.32 ((((.((.....(((((.((.((((((((.(((((.(((((((((((.............)))))))))))))))).)))))))).))))))).))))))
eeu ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
sar ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
cho ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
ete GAUGGUGAUUUAGCCCUUUAGUUUUGAGGUUGGUGUACUGUGUGUGAGUACAUAU--AUUUAUCACACACAGUCACUAUCUUCGAAAGUGAGGGUGCACAUC------------ ENSEMBL scaffold_144896:487-587(-) -44.32 ((((.((.....(((((.((.((((((((.(((((.(((((((((((.............)))))))))))))))).)))))))).))))))).))))))
laf GAUGGUGAUCUAGCCCUUUAGUUUUGAGGUUGGUGUACUGUGUGUGAGUAUAUAU--AUUUUUCACACACAGUCACUAUCUUCGAAAGUGAGGGUGCACAUC------------ ENSEMBL scaffold_24:26676525-26676625(+) -45.1 ((((.((.....(((((.((.((((((((.(((((.((((((((((((...........))))))))))))))))).)))))))).))))))).))))))
pca GAUGGUCAUCUAGCCCUUUAGUUUUGAGGUUGGUGUACUGUGUGUGAGUAUAUAU--AUUUAUCACACACAGUCACCAUCUUCGAAAGUGAGGGUGCACAUCUU---------- ENSEMBL scaffold_17152:33746-33848(-) -47.02 ((((........((((((((.((((((((.(((((.(((((((((((.............)))))))))))))))).)))))))).)))))).)).))))..
meu ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
mdo ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
oan ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
gga ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
mga ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
tgu ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
aca ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
xtr ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
dre ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
gac ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
ola ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
tru ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
tni ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
cin -ACAUUGAUGGAGA-UAUGAGUUUGGUGUACUGUGUGUUGCAUGUCGUCAAGCAUCCAAUGGCUCGACUUGCCCGACAUCCCACAACGGGUUCAUGGUUUCAA----------- miRbase -25.9 .......(((((.((((((..((.(((...((((...(((.((((...(((........))))))).)))...))))...))).))..)))))).))))).
csa ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
dme ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
cel ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
* **** * * ** * * * * * ** * * **
********************** * ****** ** * ** ** **** ** * ** * **** **
** * ************************************ * ** *************** *** ***** ******* ****
* ****** * **************************************** ** ************************* ************** *
********* * **************************************** ** *********************************************
**************************************************** ** *********************************************
******************************************************* *********************************************
******************************************************* *********************************************
******************************************************* *********************************************
******************************************************* *********************************************
******************************************************* *********************************************
******************************************************* *********************************************
******************************************************* *********************************************
******************************************************* *********************************************
******************************************************* *********************************************
******************************************************* ***********************************************
******************************************************************************************************************