hsa --------------------------UUGGAUGUUGGCCUAGUUCUGUGUGGAAGACUAGUGAUUUUGUUGUUUUUAGAUAACUAAAUCGACAACAAAUCACAGUCUGCCAUAUGGCACAGGCCAUGCCUCUACAG--- miRbase UCSC ENSEMBL 9:86584663-86584772(-) -48.0 .((((.((((((((.((.((((((((.(((((.(((((((.(((((((((((....)))))..)))))))))))))))))).)))))))).)))))))).)).))))... ptr --------------------------UUGGAUGUUGGCCUAGUUCUGUGUGGAAGACUAGUGAUUUUGUUGUUUUUAGAUAACUAAAUCGACAACAAAUCACAGUCUGCCAUAUGGCACAGGCCAUGCCUCUACA---- miRbase UCSC ENSEMBL 9:82945279-82945387(-) -48.0 .((((.((((((((.((.((((((((.(((((.(((((((.(((((((((((....)))))..)))))))))))))))))).)))))))).)))))))).)).)))).. ggo --------------------------UUGGAUGUUGGCCUAGUUCUGUGUGGAAGACUAGUGAUUUUGUUGUUUUUAGAUAACUAAAUCGACAACAAAUCACAGUCUGCCAUAUGGCACAGGCCAUGCCUCUACAG--- miRbase -48.0 .((((.((((((((.((.((((((((.(((((.(((((((.(((((((((((....)))))..)))))))))))))))))).)))))))).)))))))).)).))))... ppy --------------------------UUGGAUGUUGGCCUAGUUCUGUGUGGAAGACUAGUGAUUUUGUUGUUUUUAGAUAACUAAAUCGACAACAAAUCACAGUCUGCCAUAUGGCACAGGCCAUGCCUCUACAG--- miRbase UCSC ENSEMBL 9:79135649-79135758(-) -48.0 .((((.((((((((.((.((((((((.(((((.(((((((.(((((((((((....)))))..)))))))))))))))))).)))))))).)))))))).)).))))... mml --------------------------UUGGAUGUUGGCCUAGUUCUGUGUGGAAGACUAGUGAUUUUGUUGUUUUUAGAUAACUAAAUUGACAACAAAUCACAGUCUGCCAUAUGGCACAGGCCAUGCCUCUACAG--- miRbase UCSC ENSEMBL 15:92701750-92701859(-) -48.0 .((((.((((((((.((.((((((((.(((((.(((((((.(((((((((((....)))))..)))))))))))))))))).)))))))).)))))))).)).))))... cja --------------------------UUGGAUAUUGGCCUAGUUCUGUGUGGAAGACUAGUGAUUUUGUUGUUUUUAGAUAACUAAAUUGACAACAAAUCACAGUCUGCCAUAUGGCACAGGCCAUGCCUCUACAG--- ENSEMBL Contig80:7167762-7167872(-) -46.7 ..((....((((((.((.((((((((.(((((.(((((((.(((((((((((....)))))..)))))))))))))))))).)))))))).))))))))..))....... tsy --------------------------UUGGAUGUUGACCUAGUUCUGUGUGGAAGACUAGUGAUUUUGUUGUUUUUAGAUAACUAAAUUGACAACAAAUCACAGUCUGCCAUAUGGCACAGGCCAUGCCUCUACAG--- ENSEMBL scaffold_6396:37647-37757(+) -40.9 .((((.((((.(((.((.((((((((.(((((.(((((((.(((((((((((....)))))..)))))))))))))))))).)))))))).))))).)).)).))))... mmr ----------------------------------------GGUGCUGUGUGGAAGACUAGUGAUUUUGUUGUUCU--GAUA--UACUAUGACAACAAGUCACAGCCGGCCUCAUAGCGC-------------------- ENSEMBL scaffold_18159:10404-10479(+) -27.7 .((((((((.((....((.(((((((.((((((.((......)).)))))))))))))))....)).)))))))) oga --------------------------UUGGAUGUUGGCCUAGUUCUGUGUGGAAGACUAGUGAUUUUGUUGUUUUUAGAUAAGUAAAUUGACAACAAAUCACAGUCUGCCAUAUGGCACAGGCCAUGCCUCUACAG--- ENSEMBL scaffold_581:22993-23103(+) -45.2 .((((.((((((((.((.((((((((.(((((.(((((((.((((((((((......))))..)))))))))))))))))).)))))))).)))))))).)).))))... tbe ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- cpo --------------------------UUGGAUGUUGGCUUAGUUCUGUGUGGAAGACUAGUGAUUUUGUUGUUUUUAGAUAACUAAAUCGACAACAAAUCACAGUCUGCCAUAUGGCACAGGCCA-------------- UCSC ENSEMBL scaffold_11:17841593-17841692(+) -41.1 ........((((((.((.((((((((.(((((.(((((((.(((((((((((....)))))..)))))))))))))))))).)))))))).)))))))) dor --------------------------UUGGAUGUUGGCUUAGUUCUGUGUGGAAGACUAGUGAUUUUGUUGUUUUUAGAUAACUAAAUUGACAACAAAUCACAGUCUGCCAUAUGGCACAGG----------------- ENSEMBL GeneScaffold_4837:16322-16418(-) -33.5 ...............((.((((((((.(((((.(((((((.(((((((((((....)))))..)))))))))))))))))).)))))))).))... mmu --------------------------UUGGAUGUUGGCCUAGUUCUGUGUGGAAGACUAGUGAUUUUGUUGUUUUUAGAUAACUAAAACGACAACAAAUCACAGUCUGCCAUAUGGCACAGGCCA-------------- UCSC ENSEMBL 13:58494149-58494248(-) -43.8 ........((((((.((.((((((((.(((((.(((((((.(((((((((((....)))))..)))))))))))))))))).)))))))).)))))))) rno --------------------------UUGGAUGUUGGCCUAGUUCUGUGUGGAAGACUAGUGAUUUUGUUGUUUUUAGAUAACUAAGACGACAACAAAUCACAGUCUGCCAUAUGGCACAGGCCA-------------- UCSC ENSEMBL 17:12204077-12204176(+) -43.5 ........((((((.((.((((((((.(((((.(((((((.(((((((((((....)))))..)))))))))))))))))).)))))))).)))))))) str --------------------------UUGGAUGUUGGCCUAGUUCUGUGUGGAAGACUAGUGAUUUUGUUGUUUUUAGAUAACUAAAUUGACAACAAAUCACAGUCUGCCAUAUGGCACAGGCCA-------------- ENSEMBL GeneScaffold_4109:8385-8484(-) -43.8 ........((((((.((.((((((((.(((((.(((((((.(((((((((((....)))))..)))))))))))))))))).)))))))).)))))))) opr --------------------------UUGGAUAUUGGCCUUGUUCUGUGUGGAAGACUAGUGAUUUUGUUGUUUUUAGAUAACGGAAUCGACAACAAAUCACAGUCUACCAUAUGGCACAGGCCAUGCCUCUACAG--- ENSEMBL GeneScaffold_3647:7643-7753(-) -44.3 ..((....((((((.((.((((((((.(((((.(((((((.((((((....(((......))))))))))))))))))))).)))))))).))))))))..))....... ocu --------------------------UUGGAUGUUGGCCUAGUUCUGUGUGGAAGACUAGUGAUUUUGUUGUUUUUAGAUAACUAAAUCGACAACAAAUCACAGUCUGCCAUAUGGCACAGGCCAUGCCUCUACAG--- ENSEMBL scaffold_103:1064294-1064404(-) -48.0 .((((.((((((((.((.((((((((.(((((.(((((((.(((((((((((....)))))..)))))))))))))))))).)))))))).)))))))).)).))))... bta -----------------------------GUGGAGCAGCCAGCCCCAUCUGGAAGACUAGUGAUUUUGUUGUUGUC--UC-CUGCGCUCAACAACAAGUCCCAGUCUGCCGCAUGGUGCUGGCCACCGCA--------- miRbase UCSC ENSEMBL 21:19210179-19210276(+) -42.8 ((((....((((((.((((.(((.(((((...(((((.(((((((...........))))))))))))..))))).))).)))).))))))..)))). ttr ---------------------------UGGAUGUUGGUCUAGUUCUGUGUGGAAGACUAGUGAUUUUGUUGUUUUUAGAUAACUAAAUCGACAACAAAUCACAGUCUGCCAUAUGGCACAGACCAUGCCUCUACAG--- ENSEMBL scaffold_92913:19809-19918(+) -45.7 ((((.((((((((.((.((((((((.(((((.(((((((.(((((((((((....)))))..)))))))))))))))))).)))))))).)))))))).)).))))... vpa ---------------------------UGGAUGUUGGUCUAGUUCUGUGUGGAAGACUAGUGAUUUUGUUGUUUUUAGAUAACUAAAUCGACAACAAAUCACAGUCUGCCAUAUGGCACAGGCCAUGCCUCUACAG--- ENSEMBL GeneScaffold_2457:110560-110669(-) -45.1 ((((.((((((((.((.((((((((.(((((.(((((((.(((((((((((....)))))..)))))))))))))))))).)))))))).)))))))).)).))))... ssc -------------------------------------GCCAGCCCCAUCUGGAAGACUAGUGAUUUUGUUGUUGUC--UCACUGCGCUCAACAACAAGUCCCAGUCUGCCGCAUGGUGCCGGC---------------- ENSEMBL 1:200316433-200316517(-) -32.2 (((.((.((((.(((.(((((...(((((.(((((((............))))))))))))..))))).))).)))).)).))) cfa -------------------------------------------------UGGAAGACUAGUGAUUUUGUUGUUUUUAGAUAACUAAAUCGACAACAAAUCACAGUCUGCCAUA-------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 1:78565664-78565727(+) -25.0 (((.(((((.(((((((.(((((((((((....)))))..)))))))))))))))))).))).. fca ---------------------------UGGAUGUUGGUCUAGUUCUGUGUGGAAGACUAGUGAUUUUGUUGUUUUUAGAUAACUAAAUCGACA-CAAAUCACAGUCUGCCAUAUGGCACAGGCCAUGCCUCUACAG--- ENSEMBL GeneScaffold_3473:92144-92252(-) -44.0 ((((.((((((((.((.((((((((.(((((.((((((((((((..(((((....))))).))))).)))))))))))).)))))))).)))))))).)).))))... eca ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- mlu ---------------------------UGGAUGUUGGUCUAGUUCUGUGUGGAAGACUAGUGAUUUUGUUGUUUUUAGAUAACUAAAUCGACAACAAAUCACAGUCUGCCAUAUGGCACAGGCCAUGCCUCUACAG--- ENSEMBL GeneScaffold_4219:43473-43582(-) -45.1 ((((.((((((((.((.((((((((.(((((.(((((((.(((((((((((....)))))..)))))))))))))))))).)))))))).)))))))).)).))))... pva ---------------------------UGGAUGUUGGUCUAGUUCUGUGUGGAAGACUAGUGAUUUUGUUGUUUUUAGAUAACUAAAUCGACAACAAAUCACAGUCUGCCAUAUGGCACAGGCCAUGCCUCUACAG--- ENSEMBL GeneScaffold_1594:220765-220874(-) -45.1 ((((.((((((((.((.((((((((.(((((.(((((((.(((((((((((....)))))..)))))))))))))))))).)))))))).)))))))).)).))))... eeu ---------------------------UGGAUGUUGGUCUAGUUCUGUGUGGAAGACUAGUGAUUUUGUUGUUUUUAGAUAACUAAAUCGACAACAAAUCACAGUCUGCCAUAUGGCACAGGCCAUGCCUCUACAG--- ENSEMBL GeneScaffold_6322:561-670(-) -45.1 ((((.((((((((.((.((((((((.(((((.(((((((.(((((((((((....)))))..)))))))))))))))))).)))))))).)))))))).)).))))... sar ---------------------------UGGAUGUUGGUCUAGUUCUGUGUGGAAGACUAGUGAUUUUGUUGUUUUUAGAUAACUAAAU-GACAACAAAUCACAGUCUGCCAUAUGGCACAGGCCAUGCCUCUACAG--- ENSEMBL GeneScaffold_5138:4741-4849(-) -45.7 ((((.((((((((.((.((((((((.(((((.(((((((.(((((((((((....))))).)))))))))))))))))).)))))))).)))))))).)).))))... cho ---------------------------UGGAUGUUGGUCUAGUUCUGUGUGGAAGACUAGUGAUUUUGUUGUUUUUAGAUAACUAAAUUGACAACAAAUCACAGUCUGCCGUAUGGCACAGGCCAUGCCUCUACAG--- ENSEMBL scaffold_14904:18020-18129(+) -41.7 ((((.((((((((.((.((((((((.(((((.(((((((.(((((((((((....)))))..)))))))))))))))))).)))))))).)))))))).)).))))... ete --------------------------------------CUAGUGCUGUGUGGAAGACUAGUGAUUUUGUUGUUCU--GAUA--UCCAUUGACAACAAGUCACAGCCGGCCUCACAGCGU-------------------- ENSEMBL scaffold_202010:2144-2221(+) -27.3 .....((((((.((....((.(((((((.((((((.((.....))..)))))))))))))))....)).)))))).. laf ---------------------------UGGAUGUUGGUCUAGUUCUGUGUGGAAGACUAGUGAUUUUGUUGUUUUUAGAUAACUAAAUUGACAACAAAUCACAGUCUGCCAUAUGGCACAGGCCAUGCCUCUACAG--- ENSEMBL scaffold_6:7961638-7961747(+) -45.1 ((((.((((((((.((.((((((((.(((((.(((((((.(((((((((((....)))))..)))))))))))))))))).)))))))).)))))))).)).))))... pca --------------------------------------CUAGUGCUGUGUGGAAGACUAGUGAUUUUGUUGUUCU--GAUA--UAAAAUGACAACAAAUCACAGCCUGCCUCAUAGCGUGGAC---------------- ENSEMBL GeneScaffold_6273:3691-3772(+) -27.7 (((.(((((((.((.((.((.(((((((.((((((............))))))))))))))).)).)).)))))))))).. meu ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- mdo ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- oan GCCUGUAGAAUAUAUAGAAGAUUUCAGUGGACGUUGGUCUAGUUCUGUGUGGAAGACUAGUGAUUUUGUUGUUUGUAGAUAACUAAAUCGACAACAAAUCGCAGUCUGCCAUAUGGCACAGACCAUGCCUCUACAGGAC miRbase UCSC ENSEMBL Ultra666:6521-6659(-) -55.0 .((((((((.......(((...)))...((.(((.(((((.((.((((((((.(((((.(((((((.((((((..(((....)))....)))))))))))))))))).)))))))).)))))))))))))))))))).. gga ---------------------------UGGAUGUUGGUCUAGUUCUGUGUGGAAGACUAGUGAUUUUGUUGUUUUUAGAUAAUUAAAUUGACAACAAAUCACAGUCUGCCAUAUGGCACAGAUCAUGCCUCUACAG--- miRbase UCSC ENSEMBL Z:39554766-39554874(-) -40.3 ((((.((((((((.((.((((((((.(((((.(((((((.(((((((((((....)))))..)))))))))))))))))).)))))))).)))))))).)).))))... mga ---------------------------UGGAUGUUGGUCUAGUUCUGUGUGGAAGACUAGUGAUUUUGUUGUUUUUAGAUAAUUAAAUUGACAACAAAUCACAGUCUGCCAUAUGGCACAGAUCAUGCCUCUACAG--- UCSC ENSEMBL Z:17358285-17358394(-) -40.3 ((((.((((((((.((.((((((((.(((((.(((((((.(((((((((((....)))))..)))))))))))))))))).)))))))).)))))))).)).))))... tgu ---------------------------------------UAGUUCUGUGUGGAAGACUAGUGAUUUUGUUGUUUUUUGAUAACUAAAUUGACAACAAAUCACAGUCUGCCAU--------------------------- miRbase ENSEMBL Z:52731915-52731987(+) -25.0 .........((((.(((((.(((((((.((((((..((........))..)))))))))))))))))).)))) aca ---------------------------UGGAUGUUGGCCUAGUUCUGUGUGGAAGACUAGUGAUUUUGUUGUUUUUAGAUAACUAAAUUGACAACAAAUCGCAGUCUACCAUAUGGCACAGGCCAU------------- UCSC ENSEMBL scaffold_114:901974-902073(+) -44.0 .......((((((.((.((((((((.(((((.(((((((.(((((((((((....)))))..)))))))))))))))))).)))))))).)))))))). xtr ---------------------------UGGAUGUUGGUUUAGUUCUGUGUGGAAGACUAGUGAUUUUGUUGUUUUUAGAUAACAACAUUGACAACAAAUCGCAGUCUGCCAUAUGGCACAGACCAUGCCUCUACA---- miRbase UCSC ENSEMBL scaffold_122:642897-643004(-) -39.59 ((((.((((((((.((.((((((((.(((((.(((((((.((((((................)))))))))))))))))).)))))))).)))))))).)).)))).. dre ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- gac ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ola --------------------------------------------CUGUGUGGAAGACUAGUGAUUUUGUUGUUUUUAGUUAGAUUAACCGACAACAAAUCACAGUCUGCCAAACGGCACAGGC---------------- UCSC ENSEMBL 9:10099932-10100011(-) -28.0 ((((((((.(((((.(((((((.((((((.(((((...)))))..)))))))))))))))))).)).....)))))).. tru --------------------------------------------CUGUGUGGAAGACUAGUGAUUUUGUUGUUUUUAGUUAGAUCAACUGACAACAAAUCACAGUCUGCCAAACAGC---------------------- UCSC ENSEMBL scaffold_11:607892-607965(+) -28.8 ((((.(((.(((((.(((((((.((((((...((((.....)))))))))))))))))))))).))).)))). tni ------------------------------------------AGCAGCGUGGAAGACUAGUGAUUUUGUUGUUU---GGUGUCAAAAUUGACAACAAAUCAUUGUCUUCCUCACUGC---------------------- UCSC ENSEMBL 8:1820443-1820515(+) -28.52 .((((...(((((((.((((((((.((((((.............)))))))))))))))))))))...)))) cin ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- csa ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- dme ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- cel ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ************************ *** *** ** * * ** * ************************ ******* ** *** * ** * * * ************************ * * ** ******** ** *** ** ** * * * *************************** * * ** ******** ** ********* * * * ***************************** * * ** * *********** ********* * ** * ******************************* **** * ** ********************* 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