hsa ---------------UCU--CUUUGGUUAUCUAGCUGUA-UGAGUG-CCACAGAG--CCGUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGUAGAAA------------ UCSC ENSEMBL 15:89911261-89911329(+) -30.0 (((((((((((((((((((.(((((..((......))..))))).)))))))))))).)))).)))..
ptr -----------------------------------------------------------------------------------------------------
ggo ---------------UCU--CUUUGGUUAUCUAGCUGUA-UGAGUG-CCACAGAG--CCGUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGUAGAAA------------ ENSEMBL 15:69334107-69334175(+) -30.0 (((((((((((((((((((.(((((..((......))..))))).)))))))))))).)))).)))..
ppy ---------------UCU--CUUUGGUUAUCUAGCUGUA-UGAGUG-CCACAGAG--CCGUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGUAGAAA------------ UCSC ENSEMBL 15:86027150-86027218(+) -30.0 (((((((((((((((((((.(((((..((......))..))))).)))))))))))).)))).)))..
mml ---------------UAU--CUUUGGUUAUCUAGCUGUA-UGAGUG-GUGUGGAG--UCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGUAAAAA------------ UCSC ENSEMBL 1:135024769-135024837(-) -27.3 ((..(((((((((((((((.((((((.((.......)))))))).)))))))))))))))..))....
cja -------------GUUAU--CUUUGGUUAUCUAGCUGUA-UGAGUG-UAUUGG----UCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGUAAAAA------------ ENSEMBL Contig4:16299032-16299100(+) -27.9 .(((..(((((((((((((((.((((((..........)))))).)))))))))))))))..)))...
tsy -----------------------------------------------------------------------------------------------------
mmr ---------------UCU--CUUUGGUUAUCUAGCUGUA-UGAGUG-CCACAGAG--CCGUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGUAGAAA------------ ENSEMBL GeneScaffold_4686:21949-22017(+) -30.0 (((((((((((((((((((.(((((..((......))..))))).)))))))))))).)))).)))..
oga -------------GUUAU--CUUUGGUUAUCUAGCUGUA-UGAGUG-UAUUGG----UCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGUAAAAA------------ ENSEMBL GeneScaffold_561:307384-307452(-) -27.9 .(((..(((((((((((((((.((((((..........)))))).)))))))))))))))..)))...
tbe ---------------UCU--CUUUGGUUAUCUAGCUGUA-UGAGUG-CCACAGAG--CCGUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGUAGAAA------------ ENSEMBL GeneScaffold_2779:13451-13519(+) -30.0 (((((((((((((((((((.(((((..((......))..))))).)))))))))))).)))).)))..
cpo ---------------UCU--CUUUGGUUAUCUAGCUGUA-UGAGUG-CCACAGAG--CCGUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGUAGAAA------------ UCSC ENSEMBL scaffold_10:34662919-34662987(-) -30.0 (((((((((((((((((((.(((((..((......))..))))).)))))))))))).)))).)))..
dor -------------GUUAU--CUUUGGUUAUCUAGCUGUA-UGAGUG-UAUUGG----UCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGUAAAAA------------ ENSEMBL scaffold_9279:7543-7611(+) -27.9 .(((..(((((((((((((((.((((((..........)))))).)))))))))))))))..)))...
mmu ---------------UCU--CUUUGGUUAUCUAGCUGUA-UGAGUG-CCACAGAG--CCGUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGUAGAAA------------ UCSC ENSEMBL 7:86650163-86650231(+) -30.0 (((((((((((((((((((.(((((..((......))..))))).)))))))))))).)))).)))..
rno ---------------UCU--CUUUGGUUAUCUAGCUGUA-UGAGUG-CCACAGAG--CCGUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGUAGAAA------------ UCSC ENSEMBL 1:135254146-135254214(+) -30.0 (((((((((((((((((((.(((((..((......))..))))).)))))))))))).)))).)))..
str ---------------UCU--CUUUGGUUAUCUAGCUGUA-UGAGUG-CCACAGAG--CCGUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGUAGAAA------------ ENSEMBL scaffold_10093:3454-3522(+) -30.0 (((((((((((((((((((.(((((..((......))..))))).)))))))))))).)))).)))..
opr ---------------UAU--CUUUGGUUAUCUAGCUGUA-UGAGUG-GUGUGAAG--UCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGUAAAAA------------ ENSEMBL scaffold_142601:438-506(-) -27.3 ((..(((((((((((((((.((((((.((.......)))))))).)))))))))))))))..))....
ocu ---------------UAU--CUUUGGUUAUCUAGCUGUA-UGAGUG-GUGUGGAG--UCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGUAAAAA------------ ENSEMBL scaffold_0:16432104-16432172(+) -27.3 ((..(((((((((((((((.((((((.((.......)))))))).)))))))))))))))..))....
bta -----------------U--CUUUGGUUAUCUAGCUGUA-UGAGUG-CCACAGAG--CCGUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGUAGAAAUG---------- UCSC ENSEMBL 21:20602267-20602335(+) -28.4 ..(((((((((((((((.(((((..((......))..))))).)))))))))))))))..........
ttr ---------------UCU--CUUUGGUUAUCUAGCUGUA-UGAGUG-CCACAGAG--CCGUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGUAGAAA------------ ENSEMBL GeneScaffold_1606:323217-323285(+) -30.0 (((((((((((((((((((.(((((..((......))..))))).)))))))))))).)))).)))..
vpa -----------------------------------------------------------------------------------------------------
ssc ---------------UCU--CUUUGGUUAUCUAGCUGUA-UGAGUG-CCACAGAG--CCGUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGUAGAAA------------ ENSEMBL 7:60349139-60349207(+) -30.0 (((((((((((((((((((.(((((..((......))..))))).)))))))))))).)))).)))..
cfa ---------------UAU--CUUUGGUUAUCUAGCUGUA-UGAGUG-GUGUGGAG--UCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGUAAAAA------------ UCSC ENSEMBL 7:44477954-44478022(+) -27.3 ((..(((((((((((((((.((((((.((.......)))))))).)))))))))))))))..))....
fca -------------GUUAU--CUUUGGUUAUCUAGCUGUA-UGAGUG-UAUUGG----UCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGUAAAAA------------ ENSEMBL scaffold_182285:693-761(-) -27.9 .(((..(((((((((((((((.((((((..........)))))).)))))))))))))))..)))...
eca ---------------UAU--CUUUGGUUAUCUAGCUGUA-UGAGUG-GUGUGGAG--UCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGUAAAAA------------ UCSC ENSEMBL 5:41824846-41824914(+) -27.3 ((..(((((((((((((((.((((((.((.......)))))))).)))))))))))))))..))....
mlu -------------GUUAU--CUUUGGUUAUCUAGCUGUA-UGAGUG-UAUUGG----UCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGUAAAAA------------ ENSEMBL GeneScaffold_4131:424290-424358(-) -27.9 .(((..(((((((((((((((.((((((..........)))))).)))))))))))))))..)))...
pva ---------------UCU--CUUUGGUUAUCUAGCUGUA-UGAGUG-CCACAGAG--CCGUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGUAGAAA------------ ENSEMBL GeneScaffold_1849:219441-219509(+) -30.0 (((((((((((((((((((.(((((..((......))..))))).)))))))))))).)))).)))..
eeu -------------GUUAU--CUUUGGUUAUCUAGCUGUA-UGAGUG-UAUUGG----UCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGUAAAAA------------ ENSEMBL scaffold_358364:32097-32165(+) -27.9 .(((..(((((((((((((((.((((((..........)))))).)))))))))))))))..)))...
sar -------------GUUAU--CUUUGGUUAUCUAGCUGUA-UGAGUG-UAUUGG----UCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGUAAAAA------------ ENSEMBL scaffold_251606:122311-122379(-) -27.9 .(((..(((((((((((((((.((((((..........)))))).)))))))))))))))..)))...
cho -------------GUUAU--CUUUGGUUAUCUAGCUGUA-UGAGUG-UAUUGG----UCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGUAAAAA------------ ENSEMBL scaffold_1169:41875-41943(+) -27.9 .(((..(((((((((((((((.((((((..........)))))).)))))))))))))))..)))...
ete -------------GUUAU--CUUUGGUUAUCUAGCUGUA-UGAGUG-UAUUGG----UCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGUAAAAA------------ ENSEMBL scaffold_309610:14471-14539(-) -27.9 .(((..(((((((((((((((.((((((..........)))))).)))))))))))))))..)))...
laf ---------------UCU--CUUUGGUUAUCUAGCUGUA-UGAGUG-CCACAGAG--CCGUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGUAGAAA------------ ENSEMBL scaffold_28:17592823-17592891(-) -30.0 (((((((((((((((((((.(((((..((......))..))))).)))))))))))).)))).)))..
pca ---------------UCU--CUUUGGUUAUCUAGCUGUA-UGAGUG-CCACAGAG--CCGUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGUAGAAA------------ ENSEMBL GeneScaffold_3708:136175-136243(+) -30.0 (((((((((((((((((((.(((((..((......))..))))).)))))))))))).)))).)))..
meu ---------------UAU--CUUUGGUUAUCUAGCUGUA-UGAGUG-GUGUCGAG--UCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGUAAAAA------------ ENSEMBL GeneScaffold_3701:16879-16947(-) -27.3 ((..(((((((((((((((.((((((.((.......)))))))).)))))))))))))))..))....
mdo ---------------UAU--CUUUGGUUAUCUAGCUGUA-UGAGUG-GUGUCGAG--UCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGUAAAAA------------ UCSC ENSEMBL 2:191328864-191328932(-) -27.3 ((..(((((((((((((((.((((((.((.......)))))))).)))))))))))))))..))....
oan -------------GUUAU--CUUUGGUUAUCUAGCUGUA-UGAGUG-UAUUGG----UCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGUAAGAA------------ UCSC ENSEMBL 1:6581934-6582002(+) -27.9 .(((..(((((((((((((((.((((((..........)))))).)))))))))))))))..)))...
gga -------------GUUAU--CUUUGGUUAUCUAGCUGUA-UGAGUG-UUUUGG----UCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGUAAAAA------------ UCSC ENSEMBL Z:59286326-59286394(+) -27.9 .(((..(((((((((((((((.((((((..........)))))).)))))))))))))))..)))...
mga -------------GUUAU--CUUUGGUUAUCUAGCUGUA-UGAGUG-UUUUGG----UCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGUAAAAA------------ UCSC ENSEMBL Un:2037581-2037649(-) -27.9 .(((..(((((((((((((((.((((((..........)))))).)))))))))))))))..)))...
tgu ---------UGUUUCUGU--CUUUGGUUAUCUAGCUGUA-UGAGUG-UUGUGGAG--CCAUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAG------------------ ENSEMBL 10:12969777-12969845(-) -27.8 ..........(((((((((((((((.(((((..(((....)))..))))).)))))))))))))))..
aca ----------GUUUCUGU--CUUUGGUUAUCUAGCUGUA-UGAGUG-UAAUCGAC--CCAUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGUAGA-------------- UCSC ENSEMBL scaffold_895:351516-351587(-) -31.3 ...((((..(((((((((((((((.(((((..((.....))...))))).)))))))))))))))..))))
xtr -------------GUUAU--CUUUGGUUAUCUAGCUGUA-UGAGUG-UUGUCAAU--CCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGUAAA-------------- UCSC ENSEMBL scaffold_427:12042-12110(+) -27.7 .(((..(((((((((((((((.((((((............)))))).)))))))))))))))..))).
dre ---------------UAU--CUUUGGUUAUCUAGCUGUA-UGAGUG-UGCUGG----CCGUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGUAAGAGCC---------- UCSC ENSEMBL 10:41575971-41576039(-) -27.6 ((..(((((((((((((((.(((((..((....))..))))).)))))))))))))))..))......
gac -------UCUGUUUCUGU--CUUUGGUUAUCUAGCUGUA-UGAGUU-UUAAAUGC--CUGUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGUAGA-------------- UCSC ENSEMBL groupXIX:14637612-14637686(-) -29.7 ......((((..(((((((((((((((.(((((((.......))...))))).)))))))))))))))..))))
ola ----------GUUUUUGU--CUUUGGUUAUCUAGCUGUA-UGAGUG-UUAAAUAC--CUGUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGUAGA-------------- UCSC ENSEMBL 6:17135438-17135509(+) -28.1 ...((((..(((((((((((((((.(((((((((...))))...))))).)))))))))))))))..))))
tru ----AGCUGUGUUUCUGU--CUUUGGUUAUCUAGCUGUA-UGAGUG-UUAAAUAC--CUGUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGUAGA-------------- UCSC ENSEMBL scaffold_302:60369-60446(+) -30.7 .........((((..(((((((((((((((.(((((((((...))))...))))).)))))))))))))))..))))
tni ----AGCUGUGUUUCUGU--CUUUGGUUAUCUAGCUGUA-UGAGUG-UUAAAUAC--CUGUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGUAGA-------------- UCSC ENSEMBL 13:5474097-5474174(+) -30.7 .........((((..(((((((((((((((.(((((((((...))))...))))).)))))))))))))))..))))
cin -----------------------------------------------------------------------------------------------------
csa -----------------------------------------------------------------------------------------------------
dme -UGAAGCUGACUUGCCAUUGCUUUGGCGCUUUAGCUGUA-UGAUAGAUUUAAACU--ACUUCAUAAAGCUAGAUUACCAAAGCAUUGGCUUCUGCAGGUCA miRbase UCSC ENSEMBL 2L:16698554-16698650(+) -36.1 .((..(((....((((.((((((((...(((((((.((((((((.......)))..))))).)))))))...)))))))).)))).....))).)).
cel UAGUAGACAUUCUCCGAU--CUUUGGUGAUUCAGCUUCAAUGAUUGGCUACAGGUUUCUUUCAUAAAGCUAGGUUACCAAAGCUCGGCGUCUUGAUCUAC- miRbase UCSC ENSEMBL I:9332937-9333034(+) -34.7 ..(((((((....((((.((((((((((..(((((..((((..(((.....)))....)))).)))))..)))))))))).)))).....)).)))))
* ****** * **** * *** ************ * *** **
* ******* ** ******** *** ** ************** *** **
* ******************* ****** ************************
* * ******************* ****** *************************
* * ******************* ****** *************************
* * ******************* ****** * ************************* *
* * ******************* ****** * ************************* *
* * ******************* ****** * * ************************* *
* * ******************* ****** * * ************************* *
* * ******************* ****** * * ************************* **
* * ******************* ****** * * ************************* ***
* * ******************* ****** * * ************************* ***
* * ******************* ****** * * ************************* ***
* * ******************* ****** * * ************************* ***
* * ******************* ****** * * ************************* ***
* * ******************* ****** * * ************************* ***
* * ******************* ****** ** * ************************* ***
* * ******************* ****** ** * ************************* ***
* * ******************* ****** ** * ************************* ***
* * ******************* ****** ** * ************************* ***
* * ******************* ****** ** ** ************************* ***
*** ******************* ****** * *** ** ************************* ***
*** ******************* ****** * *** **************************** ***
*** ******************* ****** * ****** ********************************
*** ******************* ****** * ****** ********************************
*** ******************* ****** * ****** ********************************
*** ******************* ****** * ****** ********************************
*** ******************* ****** ******** ********************************
*** ******************* ****** ******** ********************************
*** ******************* ****** ******** ********************************
***** ******************* ****** ******** ********************************
***** ******************* ****** ******** ********************************
***** ******************* ****** ******** ********************************
***** ******************* ****** ******** ********************************
***** ******************* ****** ******** ********************************
***** ******************* ****** ******** ********************************
****** ******************* ****** ******** ********************************
******* ******************* ****** ******** ********************************
******** ******************* ****** ******** ********************************
********* ******************* ****** ******** ********************************
** * ********* ******************* ****** ******** ********************************
************** ******************* ****** ******** *********************************
* ************** ******************* ****** ******** ********************************** ** *
*****************************************************************************************************