hsa -GUUCUGUUAUUUGCAGUCAGUAACAAAGAUUCAUCCUUGUGUCCAU-CAUGCAACAAGGAGAAUCUUUGUCACUUAGUGUAAUUAAUAGCUGGAC-- miRbase UCSC ENSEMBL 21:37093013-37093106(+) -32.9 ...((((((.(((((...(((.((((((((((.(((((((((.......)).))))))))))))))))).)))...))))).))))))...... ptr --UUCUGUUAUUUGCAGUCAGUAACAAAGAUUCAUCCUUGUGUCCAU-CAUGCAACAAGGAGAAUCUUUGUCACUCAGUGUAAUUAAUAGCUGGAC-- miRbase UCSC ENSEMBL 21:35467656-35467748(+) -32.9 ..((((((.(((((...(((.((((((((((.(((((((((.......)).))))))))))))))))).)))...))))).))))))...... ggo -GUUCUGUUAUUUGCAGUCAGUAACAAAGAUUCAUCCUUGUGUCCAU-CAUGCAACAAGGAGAAUCUUUGUCACUUAGUGUAAUUAAUAGCUGGAC-- ENSEMBL 21:24213272-24213366(+) -32.9 ...((((((.(((((...(((.((((((((((.(((((((((.......)).))))))))))))))))).)))...))))).))))))...... ppy -GUUCUGUUAUUUGCAGUCAGUAACAAAGAUUCAUCCUUGUGUCCAU-CACGCAGCAAGGAGAAUCUUUGUCACUUAGUGUAAUUAAUAGCUGGAC-- miRbase UCSC ENSEMBL 21:36758495-36758588(+) -33.0 ...((((((.(((((...(((.((((((((((.(((((((((.......))).)))))))))))))))).)))...))))).))))))...... mml -GUUCUGUUAUUUGCAAUCAGUAACAAAGAUUCAUCCUUGUGUCCAU-CAUGCAGCAAGGAGAAUCUUUGUCACUUAGUGUAAUUAAUAGCUGGAC-- miRbase UCSC ENSEMBL 3:10856064-10856157(-) -34.0 ...((((((.(((((...(((.((((((((((.(((((((((.......))).)))))))))))))))).)))...))))).))))))...... cja -GUUCUGUUAUUUGCAGUCAGUAACAAAGAUUCAUCCUUGUGUCCAU-CAUGCAGCAAGGAGAAUCUUUGUCACUUAGUGUAAUUAAUAGCUGGAC-- ENSEMBL Contig167:2261500-2261594(-) -32.9 ...((((((.(((((...(((.((((((((((.(((((((((.......))).)))))))))))))))).)))...))))).))))))...... tsy -GUUCUAUUAUUUGCAGUCAGUAACAAAGAUUCAUCCCUGUGUCUAU-CAUGUAACAAAGAGAAUCUUUGUUACUUAGUGUAAUUAAUAG-------- ENSEMBL scaffold_26728:4290-4378(+) -28.1 ...((((((.(((((...((((((((((((((.((..(((............)))..))))))))))))))))...))))).)))))) mmr --UUCUAUUACUUGCAGUCAGUAACAAAGAUUCAUCCUUGUGUCCAU-GAUGCAGCAAGGAGAAUCUUUGUCACUUGGUGUAAUUAAUAGCUGGAC-- ENSEMBL GeneScaffold_4165:226328-226421(+) -33.2 ..((((((.(((((.(((((.((((((((((.(((((((((.......))).)))))))))))))))).)).)))))))).))))))...... oga ---UCUAUUAUUUGCAGUCAGUAACAAAGAUUCAUCCUUGUGUCCAU-CGUGCAACCAGGAGAAUCUUUGUCACUCAGUGUGAUUAAUAGCCGGAC-- ENSEMBL scaffold_106436:4358-4450(+) -28.0 .((((((.(((((...(((.((((((((((.((((..(((.......)))...)))))))))))))).)))...))))).))))))...... tbe --UUCUAUUAUUUGCGGUCAGUAACAAAGAUUCAUCCUUGUGUCCAU-CAUGCAACAAGGAGAAUCUUUGUCACUUAAUGUAAAUAAUAGCUG----- ENSEMBL scaffold_10932:128645-128735(+) -36.5 ..((((((((((((...(((.((((((((((.(((((((((.......)).))))))))))))))))).)))...))))))))))))... cpo --UUCUAUUAUUUGCAGUCAGUAACAAAGAUUCAUUCUUGUGUCAAU-CACACAACAAGGAGAAUCUUUGUCACUUCAUGUAAUUAAUAGCUG----- UCSC ENSEMBL scaffold_146:392805-392895(-) -30.9 ..((((((.(((((...(((.((((((((((.(((((((............))))))))))))))))).)))...))))).))))))... dor -----UAUUAUUUGCAGUCAGUAACAAAGAUUCAUCCUUGUGUCAAU-CAUACAACAAGGGGGGUCUUUGUCACUCAGUGUAACUAAUAGC------- ENSEMBL scaffold_1921:98872-98957(+) -28.0 (((((.(((((...(((.((((((((((.(((((((............))))))))))))))))).)))...))))).))))).. mmu GGUCCUAUUAUUUGCAAUCAGUAACAAAGAUUCAUCCUUGUGUCAAU-CAUACAACACGGAGAGUCUUUGUCACUCAGUGUAAUUAAUAGCCUUCACC miRbase UCSC ENSEMBL 16:93369965-93370061(+) -31.4 ((..((((((.(((((...(((.((((((((((.(((((((((.....))))))...))))))))))))).)))...))))).))))))))...... rno -GUCCUAUUAUUUGCAGUCAGUAACAAAGAUUCAUCCUUGUGUCGAU-CAUACAGCACGGAGAGUCUUUGUCACUCAGUGUAAUUAAUAGCCUUCACC miRbase UCSC ENSEMBL 11:33538466-33538561(+) -29.0 ...((((((.(((((...(((.((((((((((.(((((((((.....))))))...))))))))))))).)))...))))).))))))........ str ---UCUGUUAGUUGCAGUCAGUAACAGAGAUUCAUCCUUGUGUCGAU-CACGCAACAAGGGGAAUCGCUGUCACUUCCUGUAAUUAAU---------- ENSEMBL scaffold_143482:13314-13398(+) -35.3 ...(((((((((((..(((.((((.(((((.(((((((..((....))..)))))))))))).)))).)))..))))))))))) opr --UUCUAUUAUUUGCAGUCAGUAACAAAGAUUCAGCCUUGUGUCCCUUCAUGCAACAAGGAGAAUCUUUGUCACUUAGUGUAAUUAAUAGCUG----- ENSEMBL scaffold_10839:41602-41693(+) -30.4 ..((((((.(((((...(((.((((((((((..((((((((........)).)))))).)))))))))).)))...))))).))))))... ocu --UUCUAUUAUUUGCAGUCAGUAACAAAGAUUCAGCCUUGGGUCUGU-CACGCAACAAGGAGAAUCUUUGUCACUUAGUGUAAUUAAUAGCUG----- ENSEMBL scaffold_104:2484469-2484559(+) -28.8 ..((((((.(((((...(((.((((((((((..(((((....((.....)).))))).)))))))))).)))...))))).))))))... bta -------------------------------------------------------------------------------------------------- ttr -------UUAUUUGCAGUCAGUAACAAAGAUUCGUCCUUGUGUCCAU-CAAGCAACAAGGAGAAUCUUUGUCACUUAGUGUAAUUAAUAGCU------ ENSEMBL scaffold_106527:104149-104233(+) -28.2 (((.(((((...(((.((((((((((.(((((((((.......)).))))))))))))))))).)))...))))).)))..... vpa --UUCUAUUAUUUGCAGUCAGUAACAAAGAUUCAUCCUUGUGUCCAU-CAAGCAACAAGGAUAAUCUUUGUCACUUAGUGUAAUUAAUAGC------- ENSEMBL scaffold_387:710432-710520(+) -31.0 ..((((((.(((((...(((.(((((((((.((((((((((.......)).))))))))))))))))).)))...))))).)))))). ssc -------------------------------------------------------------------------------------------------- cfa --UUCUAUUAUUUGUACUCAGUAACAAAGAUUCAUCCUUGUGUCCGU-CAAGCAACAAGGAGAAUCUUUGUCACUUAGUGUAAUUAAUAGCUG----- miRbase UCSC ENSEMBL 31:33123625-33123714(+) -34.2 ..((((((.(((((((.(((.((((((((((.(((((((((.......)).))))))))))))))))).))).))))))).))))))... fca --UUCUAUUAUUUGCAGUCAGUAACAAAGAUUCAUCCUUGUGUCUGU-CAAGCAACAAGGAGAAUCUUUGUCACUUAGUGUAAUUAAUAGCUG----- ENSEMBL scaffold_165694:20599-20689(+) -34.0 ..((((((.(((((...(((.((((((((((.(((((((..((....))..))))))))))))))))).)))...))))).))))))... eca --UUCUAUUAUUUGCAAUCAGUAACAAAGAUUCAUCCUUGUGUCCAU-CAAGCAACAAGGAGAAUCUUUGUCACUUAGUGUAAUUAAUAGCUGCGC-- miRbase UCSC ENSEMBL 26:32100749-32100841(+) -34.2 ..((((((.(((((...(((.((((((((((.(((((((((.......)).))))))))))))))))).)))...))))).))))))...... mlu -------------------------------------------------------------------------------------------------- pva --UUCUAUUAUUUGCAGUCAGUAACAAAGAUUCAUCCUUGUGUCCAU-CAAGCAACAAGGAGAAUCUUUGUCACUUAGUGUAAUUAAUAGCUG----- ENSEMBL scaffold_515:338800-338890(+) -33.1 ..((((((.(((((...(((.((((((((((.(((((((((.......)).))))))))))))))))).)))...))))).))))))... eeu --UUCUAUUAUUUGCAGUCAGUAACAAAGAUUCACCCUUGUGUCAAU-AA-ACAGCAAGGGGAAUCUUUGUCACUUAGUGUAAUUAAUAGCUGGA--- ENSEMBL scaffold_343572:57488-57579(+) -35.4 ..((((((.(((((...(((.((((((((((.(((((((((......))).)))))))))))))))).)))...))))).))))))..... sar --UUCUAUUAUUUGCAGUCAGUAACAAAGAUUCAUCCUUGUGUCCAU-CAAGCAACAAGGAGAGUCUUUGUCACUUAGUGUAAUUAAUAGCUG----- ENSEMBL scaffold_262042:40440-40530(+) -33.1 ..((((((.(((((...(((.((((((((((.(((((((((.......)).))))))))))))))))).)))...))))).))))))... cho -------------------------------------------------------------------------------------------------- ete -----------UUGCAGUCAGUAACAAAGAUUCAUCCUUGUGUCCAU-CGAGCAGCAAGGAGAGUCUUUGUCACUUAGUGUAAUUAAUAGCUG----- ENSEMBL scaffold_269838:8344-8425(+) -27.2 (((((...(((.((((((((((.(((((((((.......))).)))))))))))))))).)))...))))).......... laf --UUCUAUUAUUUGCAGUCAGUAACAAAGAUUCAUCCUUGUGUCCAU-CAAGCAACAAGGAGAGUCUUUGUCACUUGAUGUAAUUAAUAGCUG----- ENSEMBL scaffold_13:20064803-20064893(-) -34.5 ..((((((.(((((.(((((.((((((((((.(((((((((.......)).))))))))))))))))).)).)))))))).))))))... pca -------------------------------------------------------------------------------------------------- meu -------------------------------------------------------------------------------------------------- mdo -------------------------------------------------------------------------------------------------- oan GUUUCUGUUUCUUGCAGUCAGUAACAAAGAUUCAUCCUUGUGUCCUG-UAAGCAACAGGGAGGGUCUUUGUCACUGAGUGCAAUUAAUGGUGGC---- miRbase UCSC ENSEMBL Ultra41:436687-436779(-) -41.0 ((..(((((..(((((.(((((.((((((((((.(((((((((.......)).))))))))))))))))).))))).)))))..)))))..)) gga -------------------------------------------------------------------------------------------------- mga ----------UUUGCAGUCAGUAACGAGGAUUCAUCCUUGUGUCCAG-CAAAUAACAGGGAGAAUCUUUGUUACUAUGU------------------- UCSC ENSEMBL 1:114005431-114005499(-) -27.9 ...(((...((((((((((((((.(((((((............))))))))))))))))))))).))) tgu -------------------------------------------------------------------------------------------------- aca -------------------------------------------------------------------------------------------------- xtr -------------------------------------------------------------------------------------------------- dre -------------------------------------------------------------------------------------------------- gac -------------------------------------------------------------------------------------------------- ola -------------------------------------------------------------------------------------------------- tru -------------------------------------------------------------------------------------------------- tni -------------------------------------------------------------------------------------------------- cin -------------------------------------------------------------------------------------------------- csa -------------------------------------------------------------------------------------------------- dme -------------------------------------------------------------------------------------------------- cel -------------------------------------------------------------------------------------------------- *** ******** ***** * ** *** * * * ** *** *** * ***** ***************** ********* * ** ** * ******* *** ** * **** ** ***** ***************** ********* * * ** ** ** ** *********** ***** **** * * *** ***** *************************** * ** ** ** ***** *********** ************ ** ************************************* * ** ** ******** *********** ************** ** ************************************* ** ** ** ******** *********** *************** **** ************************************* ** ** *** ******** *********** *************** **** ************************************* ** ** **************************************** **** ************************************* ** ** **************************************** * **** **************************************** ** ****************************************** **** **************************************** ** ****************************************** ********************************************* ** ****************************************** ********************************************* ** ****************************************** ********************************************* ** ****************************************** ********************************************* ** ****************************************** ********************************************* ** ****************************************** ********************************************* ********************************************* ********************************************* ********************************************* ********************************************* ********************************************* ********************************************* ********************************************* ********************************************* ************************************************ ********************************************** ************************************************ ********************************************** ************************************************ ********************************************** ************************************************ ********************************************** ************************************************ ********************************************** ************************************************ ********************************************** ************************************************ *********************************************** ************************************************** **************************************************************************************************