hsa --------CCGCACUCUCUCCAUUACACUACC--CUGCCUCUUCUCCAUGAGAGGCAGCGGGGUGUAGUGGAUAGAGCACGGGU--------- miRbase UCSC ENSEMBL 3:10436173-10436246(-)             -44.5       (((..((((.(((((((((((.(((((((((((......))))))))).))))))))))))).))))..)))..       
ptr --------CCGCACUCUCUCCAUUACACUACC--CUGCCUCUUCUCCAUGAGAGGCAGCGGGGUGUAGUGGAUAGAGCACGGG---------- miRbase UCSC ENSEMBL 3:10688972-10689044(-)             -44.5        (((..((((.(((((((((((.(((((((((((......))))))))).))))))))))))).))))..))).       
ggo --------CCGCACUCUCUCCAUUACACUACC--CUGCCUCUUCUCCAUGAGAGGCAGCGGGGUGUAGUGGAUAGAGCACGGGU---------              ENSEMBL 3:10739199-10739273(-)             -44.5       (((..((((.(((((((((((.(((((((((((......))))))))).))))))))))))).))))..)))..       
ppy --------CCGCACUCUCUCCAUUACACUACC--CUGCCUCUUCUCCAUGAGAGGCAGCGGGGUGUAGUGGAUAGAGCACGGGU--------- miRbase UCSC ENSEMBL 3:59523163-59523236(+)             -44.5       (((..((((.(((((((((((.(((((((((((......))))))))).))))))))))))).))))..)))..       
mml --------CCGCACUCUCUCCAUUACACUACC--CUGCCUCUUCUCCAUGAGAGGCAGCGGGGUGUAGUGGAUAGAGCACGGGU--------- miRbase UCSC ENSEMBL 2:50630819-50630892(+)             -44.5       (((..((((.(((((((((((.(((((((((((......))))))))).))))))))))))).))))..)))..       
cja --------CCGCACUCUCUCCAUUACACUACC--CUGCCUCUUCUCCAUGAGAGGCAGUGGGGUGUAGUGGAUAGAGCACGGGU---------              ENSEMBL Contig13:13655568-13655642(-)      -44.5       (((..((((.(((((((((((.(((((((((((......))))))))).))))))))))))).))))..)))..       
tsy --------CCGCACUCUCUCCAUUACACUACC--CUGCCUCUUCUCCAUGAGAGGCAGCGGGGUGUAGUGGAUAGAGCACGGGU---------              ENSEMBL scaffold_154920:1764-1838(+)       -44.5       (((..((((.(((((((((((.(((((((((((......))))))))).))))))))))))).))))..)))..       
mmr --------CCGCACUCUCUCCAUUACACUACC--CUGCCUCUUCUCCAUGAGAGGCAGCGGGGUGUAGUGGAUAGAGCACGGGU---------              ENSEMBL GeneScaffold_4747:493171-493245(-) -44.5       (((..((((.(((((((((((.(((((((((((......))))))))).))))))))))))).))))..)))..       
oga ---------------------------------------------------------------------------------------------                      
tbe --------CCGCACUCUCUCCAUUACACUACC--CUGCCUCUUCUCUAUGAGAGGCAGCGGGGUGUAGUGGAUAGAGCACGGGU---------              ENSEMBL scaffold_93232:1428-1502(-)        -44.5       (((..((((.(((((((((((.(((((((((((......))))))))).))))))))))))).))))..)))..       
cpo ----------GCACUCUCUCCACUACAAUGCC--UUGCCUCUUCUCCAGGAAAGGCAGCAGGGUAUAGUGGACAGAGCAC-------------         UCSC ENSEMBL scaffold_87:429430-429498(+)       -27.8          ...((((.(((((((...((((((((((.(((....))).)))))...)))))))))))).))))...          
dor ---------------------------------------------------------------------------------------------                      
mmu ---------------------------------------------------------------------------------------------                      
rno ---------------------------------------------------------------------------------------------                      
str ---------------------------------------------------------------------------------------------                      
opr --------CCGCACUCUCUCCAUUACACUACC--CUGCCUCUUGUCCACGAGAGGCAGCGGGGUGUAGUGGAUAGAGCACGGGU---------              ENSEMBL GeneScaffold_3205:128725-128799(-) -47.6       (((..((((.(((((((((((.((((((((((((....)))))))))).))))))))))))).))))..)))..       
ocu --------CCGCACUCUCUCCAUUACACUACC--CUGCCUCUUCUCCAUGAGAGGCAGCGGGGUGUAGUGGAUAGAGCACGGGU---------              ENSEMBL scaffold_663:60269-60343(+)        -44.5       (((..((((.(((((((((((.(((((((((((......))))))))).))))))))))))).))))..)))..       
bta --------CCGCGCUCUCUCCAUUACACUACC--CUGCCUCUUCUCCACGAGAGGCAGCGGGGUGUAGUGGAUAGAGCACGGGU--------- miRbase UCSC ENSEMBL 22:55829275-55829348(-)            -49.4       (((.(((((.(((((((((((.(((((((((((......))))))))).))))))))))))).))))).)))..       
ttr ---------------------------------------------------------------------------------------------                      
vpa ---------------------------------------------------------------------------------------------                      
ssc CACUCGGCCCGCGCUCUCUCCAUUACACUACC--CUGCCUCUUCUCCACGAGAGGCAGCGGGGUGUAGUGGAUAGAGCACGG----------- miRbase      ENSEMBL 13:55826401-55826480(-)            -48.4    ........(((.(((((.(((((((((((.(((((((((((......))))))))).))))))))))))).))))).)))    
cfa --------CCGCGCUCUCUCCAUUACACUACC--CUGCCUCUUCUCCAUGAGAGGCAGCGGGGUGUAGUGGAUAGAGCACGGGU--------- miRbase UCSC ENSEMBL 20:10971467-10971540(+)            -49.3       (((.(((((.(((((((((((.(((((((((((......))))))))).))))))))))))).))))).)))..       
fca --------CCGCGCUCUCUCCAUUACACUACC--CUGCCUCUUCUCCAUGAGAGGCAGCGGGGUGUAGUGGAUAGAGCACGGGU---------              ENSEMBL GeneScaffold_2582:453871-453945(-) -49.3       (((.(((((.(((((((((((.(((((((((((......))))))))).))))))))))))).))))).)))..       
eca --------CCGCGCUCUCUCCAUUACACUACC--CUGCCUCUUCUCCAUGAGAGGCAGCGGGGUGUAGUGGAUAGAGCACGGGU--------- miRbase UCSC ENSEMBL 16:6595298-6595371(+)              -49.3       (((.(((((.(((((((((((.(((((((((((......))))))))).))))))))))))).))))).)))..       
mlu -------------CUCUCUCCAUUACACUACC--CUGCCUCUUCUCCAUGAGAGGCAGUGGGGUGUAGUGGAUAGAGCACGGGU---------              ENSEMBL GeneScaffold_3712:79635-79704(-)   -38.9          ((((.(((((((((((.(((((((((((......))))))))).))))))))))))).)))).......         
pva -------------CUCUCUCCAUUACACUACC--CUGCCUCUUCUCUGUGAGAGGCAGUGGGGUGUAGUGGAGAGAGCAUGGGU---------              ENSEMBL GeneScaffold_1308:310364-310433(-) -45.1          ((((((((((((((((.(((((((((((......))))))))).)))))))))))))))))).......         
eeu ---------------------------------------------------------------------------------------------                      
sar ---------------------------------------------------------------------------------------------                      
cho ---------------------------------------------------------------------------------------------                      
ete ---------------------------------------------------------------------------------------------                      
laf --------CCGCACUCUCUCCAUUACACUACC--CUGCCUCUUCUCCACGAGAGGCAGCGGGGUGUAGUGGAUAGAGCACGGGU---------              ENSEMBL scaffold_12:36604426-36604500(+)   -44.6       (((..((((.(((((((((((.(((((((((((......))))))))).))))))))))))).))))..)))..       
pca ---------------------------------------------------------------------------------------------                      
meu ------GAUUUUGGGCAAGUCAGUUCACCACUGUCUGCCUAAGCUUCCUGAGAGGCAGCGUGGUGUAGUGGAUAGAGUGCUGGACUCGGAGUC              ENSEMBL GeneScaffold_1366:25901-25988(+)   -28.84 (((((((((....(((((.((((((...((((((.((....))...)))))).)))))).............))))).)))))))))
mdo ------GAUUUUGGGCAAGUCAGUUCACCACUGUCUGCCUAAGCUUCCUGAGAGGCAGCGUGGUGUAGUGGAUAGAGUGCUGGACUCGGAGUC miRbase UCSC ENSEMBL 4:183165423-183165509(+)           -28.84 (((((((((....(((((.((((((...((((((.((....))...)))))).)))))).............))))).)))))))))
oan ---------------------------------------------------------------------------------------------                      
gga ---------------------------------------------------------------------------------------------                      
mga ---------------------------------------------------------------------------------------------                      
tgu ---------------------------------------------------------------------------------------------                      
aca ---------------------------------------------------------------------------------------------                      
xtr ---------------------------------------------------------------------------------------------                      
dre ---------------------------------------------------------------------------------------------                      
gac ---------------------------------------------------------------------------------------------                      
ola ---------------------------------------------------------------------------------------------                      
tru ---------------------------------------------------------------------------------------------                      
tni ---------------------------------------------------------------------------------------------                      
cin ---------------------------------------------------------------------------------------------                      
csa ---------------------------------------------------------------------------------------------                      
dme ---------------------------------------------------------------------------------------------                      
cel ---------------------------------------------------------------------------------------------                      
                   *    ** * **   *    *****    *    ** ******   *** ******* ****                
                   *    ** * *** **   ******   **    ********* * *********** ****  * *           
                 ********* *********  *************  ********* ********************* **          
                 *******************  ************** **********************************          
              ** *******************  ************** **********************************          
            **** *******************  **************************************************         
            **** *******************  **************************************************         
            **** *******************  **************************************************         
            **** *******************  **************************************************         
            ************************  **************************************************         
            ************************  **************************************************         
            ************************  **************************************************         
            ************************  **************************************************         
            ************************  **************************************************         
            ************************  **************************************************         
            ************************  **************************************************         
            ************************  **************************************************         
            ************************  **************************************************         
            ************************  **************************************************         
          * ************************  **************************************************         
          ***************************************************************************************
    *********************************************************************************************