hsa ---------------------CUUUCUACACAGGUUGGGAUCGGUUGCAAUGCU-GUGUUUC--UGUAUGGUAUUGCACUUGUCCCGGCCUGUUGAGUUUGG------------------ miRbase UCSC ENSEMBL 13:92003568-92003645(+) -36.2 ..(((...((((((((((((.(((.(((((((((((......)))))))))))))).)))))))))))).))).....
ptr ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
ggo ---------------------CUUUCUACACAGGUUGGGAUCGGUUGCAAUGCU-GUGUUUC--UGUAUGGUAUUGCACUUGUCCCGGCCUGUUGAGUUUGG------------------ ENSEMBL 13:74443311-74443389(+) -36.2 ..(((...((((((((((((.(((.(((((((((((......)))))))))))))).)))))))))))).))).....
ppy ---------------------CUUUCUACACAGGUUGGGAUCAGUUGCAAUGCU-GUGUUUC--UGUAUGGUAUUGCACUUGUCCCGGCCUGUUGAGUUUGG------------------ UCSC ENSEMBL 13:93460739-93460817(+) -36.2 ..(((...((((((((((((.(((.(((((((((((......)))))))))))))).)))))))))))).))).....
mml ---------------------CUUUCUACACAGGUUGGGAUCGGUUGCAAUGCU-GUGUUUC--UGUAUGGUAUUGCACUUGUCCCGGCCUGUUGAGUUUGG------------------ miRbase -36.2 ..(((...((((((((((((.(((.(((((((((((......)))))))))))))).)))))))))))).))).....
cja ---------------------CUUUCUACACAGGUUGGGAUCGGUUGCAAUGCU-GUGUUUC--UGUAUGGUAUUGCACUUGUCCCGGCCUGUUGAGUUUGG------------------ ENSEMBL Contig45:6266173-6266251(+) -36.2 ..(((...((((((((((((.(((.(((((((((((......)))))))))))))).)))))))))))).))).....
tsy ---------------------CUUUCUACACAGGUUGGGAUCGGUUGCAAUGCU-GUGUUUC--UGUAUGGUAUUGCACUUGUCCCGGCCUGUUGAGUUUGG------------------ ENSEMBL scaffold_642:93875-93953(+) -36.2 ..(((...((((((((((((.(((.(((((((((((......)))))))))))))).)))))))))))).))).....
mmr ---------------------CUUUCUACACAGGUUGGGAUCGGUUGCAAUGCU-GUGUUUC--UGUAUGGUAUUGCACUUGUCCCGGCCUGUUGAGUUUGG------------------ ENSEMBL scaffold_4070:81709-81787(+) -36.2 ..(((...((((((((((((.(((.(((((((((((......)))))))))))))).)))))))))))).))).....
oga ---------------------CUUUCUACACAGGUUGGGAUCGGUUGCAAUGCU-GUGUUUC--UGUAUGGUAUUGCACUUGUCCCGGCCUGUUGAGUUUGG------------------ ENSEMBL GeneScaffold_5369:528733-528811(+) -36.2 ..(((...((((((((((((.(((.(((((((((((......)))))))))))))).)))))))))))).))).....
tbe ---------------------CUUUCUACACAGGUUGGGAUCGGUUGCAAUGCU-GUGUUUU--UGUAUGGUAUUGCACUUGUCCCGGCCUGUUGAGUUUGG------------------ ENSEMBL GeneScaffold_5511:4834-4912(+) -36.2 ..(((...((((((((((((.(((.(((((((((((......)))))))))))))).)))))))))))).))).....
cpo ---------------------CUUUCUACACAGGUUGGGAUCGGUUGCAAUGCU-GUGUUUC--UGUAUGGUAUUGCACUUGUCCCGGCCUGUUGAGUUUGG------------------ UCSC ENSEMBL scaffold_5:32028692-32028770(-) -36.2 ..(((...((((((((((((.(((.(((((((((((......)))))))))))))).)))))))))))).))).....
dor ---------------------CUUUCUACACAGGUUGGGAUCAGUUGCAAUGCU-GUGUUUC--UGUGUGGUAUUGCACUUGUCCCGGCCUGUUGAGUUUGG------------------ ENSEMBL scaffold_13652:23248-23326(+) -34.8 ..(((...((((((((((((.(((.(((((((..((......))..)))))))))).)))))))))))).))).....
mmu ---------------------CUUUCUACACAGGUUGGGAUUUGUCGCAAUGCU-GUGUUUCUCUGUAUGGUAUUGCACUUGUCCCGGCCUGUUGAGUUUGG------------------ miRbase UCSC ENSEMBL 14:115443649-115443728(+) -35.3 ..(((...((((((((((((..((.(((((((((((........)))))))))))))..)))))))))))).))).....
rno ---------------------CUUUCUACACAGGUUGGGAUUUGUCGCAAUGCU-GUGUUUC--UGUAUAGUAUUGCACUUGUCCCGGCCUGUUGAGUUUGG------------------ miRbase UCSC ENSEMBL 15:99854442-99854519(+) -36.8 ..(((...((((((((((((..((.(((((((((((......)))))))))))))..)))))))))))).))).....
str ---------------------CUUUCUACACAGGUUGGGAUCGGUUGCAAUGCU-GUGUUUC--UGUAUGGUAUUGCACUUGUCCCGGCCUGUUGAGUUUGG------------------ ENSEMBL GeneScaffold_5709:129286-129364(+) -36.2 ..(((...((((((((((((.(((.(((((((((((......)))))))))))))).)))))))))))).))).....
opr ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
ocu ---------------------CUUUCUACACAGGUUGGGAUCAGUUGCAAUGCU-GUGUUUC--UGUAUGGUAUUGCACUUGUCCCGGCCUGUUGAGUUUGG------------------ ENSEMBL scaffold_9:44489462-44489540(+) -36.2 ..(((...((((((((((((.(((.(((((((((((......)))))))))))))).)))))))))))).))).....
bta ---------------------CUUUCUACACAGGUUGGGAUCGGUUGCAAUGCU-GUGUUUC--UGUAUGGUAUUGCACUUGUCCCGGCCUGUUGAGUUUGG------------------ UCSC ENSEMBL 12:64665803-64665881(+) -36.2 ..(((...((((((((((((.(((.(((((((((((......)))))))))))))).)))))))))))).))).....
ttr ---------------------CUUUCUACACAGGUUGGGAUCGGUUGCAAUGCU-GUGUUUC--UGUAUGGUAUUGCACUUGUCCCGGCCUGUUGAGUUUGG------------------ ENSEMBL GeneScaffold_3582:187591-187669(+) -36.2 ..(((...((((((((((((.(((.(((((((((((......)))))))))))))).)))))))))))).))).....
vpa ---------------------CUUUCUACACAGGUUGGGAUCGGUUGCAAUGCU-GUGUUUC--UGUAUGGUAUUGCACUUGUCCCGGCCUGUUGAGUUUGG------------------ ENSEMBL scaffold_680:539862-539940(+) -36.2 ..(((...((((((((((((.(((.(((((((((((......)))))))))))))).)))))))))))).))).....
ssc ---------------------CUUUCUACACAGGUUGGGAUCGGUUGCAAUGCU-GUGUUUC--UGUAUGGUAUUGCACUUGUCCCGGCCUGUUGAGUUUGGUG---------------- miRbase ENSEMBL 11:60973160-60973239(+) -36.2 ..(((...((((((((((((.(((.(((((((((((......)))))))))))))).)))))))))))).))).......
cfa -------------------------------AGGUUGGGAUCGGUUGCAAUGCU-GUGUUUC--UGUAUGGUAUUGCACUUGUCCCGGCCUGU--------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 22:45427213-45427271(+) -31.5 ((((((((((.(((.(((((((((((......)))))))))))))).))))))))))..
fca ---------------------CUUUCUACACAGGUUGGGAUCGGUUGCAAUGCU-GUGUUUC--UGUAUGGUAUUGCACUUGUCCCGGCCUGUUGAGUUUGG------------------ ENSEMBL scaffold_143765:1047-1125(+) -36.2 ..(((...((((((((((((.(((.(((((((((((......)))))))))))))).)))))))))))).))).....
eca ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
mlu ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
pva ---------------------CUUUCUACACAGGUUGGGAUCGGUUGCAAUGCU-GUGUUUC--UGUAUGGUAUUGCACUUGUCCCGGCCUGUUGAGUUUGG------------------ ENSEMBL scaffold_4231:108170-108248(+) -36.2 ..(((...((((((((((((.(((.(((((((((((......)))))))))))))).)))))))))))).))).....
eeu ---------------------CUUUCUACACAGGUUGGGAUCAGUUGCAAUGCU-GUGUUUC--UGUAUGGUAUUGCACUUGUCCCGGCCUGUUGAGUUUGG------------------ ENSEMBL scaffold_358553:4557-4635(+) -36.2 ..(((...((((((((((((.(((.(((((((((((......)))))))))))))).)))))))))))).))).....
sar ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
cho ---------------------CUUUCUACACAGGUUGGGAUCAGUUGCAAUGCU-GUGUUUA--UGUUUGGUAUUGCACUUGUCCCGGCCUGUUGAGUUUGG------------------ ENSEMBL scaffold_85492:16079-16157(+) -33.4 ..(((...((((((((((((.(((.(((((((((..........)))))))))))).)))))))))))).))).....
ete ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
laf ---------------------CUUUCUACACAGGUUGGGAUCAGUUGCAAUGCU-GUGUUUC--UAUAUGGUAUUGCACUUGUCCCGGCCUGUUGAGUUUGG------------------ ENSEMBL scaffold_11:14396447-14396525(-) -37.8 ..(((...((((((((((((.(((.((((((((((((....))))))))))))))).)))))))))))).))).....
pca ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
meu ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
mdo ---------------------CUUUCUACACAGGUUGGGAUCAGUUGCAAUGCU-GUGUCUG--UCUGUAGUAUUGCACUUGUCCCGGCCUGUUGAGUUUGG------------------ UCSC ENSEMBL 7:108468191-108468269(-) -34.0 ..(((...((((((((((((.(((.(((((((((..........)))))))))))).)))))))))))).))).....
oan AUCUGAGAAGGUUUUGCACUGAUUCCUCCAUGGGUGGGGAUUUGUUGCAUUACUUGUAGCUAUGUUUAGAGUAUUGCACUUGUCCCGGCCUGUGGAGGGAAGGAGGACUUGUCAUCAGGU miRbase UCSC ENSEMBL 6:8561691-8561810(+) -52.6 (((((((((((((((...((..(((((((((((((.(((((..((.(((.(((((..(((...)))..))))).)))))..))))).))))))))))))))).))))))).)).))))))
gga ---------------------CUUUCUACACAGGUUGGGAUCAGUUGCAAUGCU-GUGCGUU--UCUGUGGUAUUGCACUUGUCCCGGCCUGUUGAGGUUGG------------------ UCSC ENSEMBL 1:152248070-152248148(-) -35.2 ...(((..((((((((((((.(((.(((((((..((......))..)))))))))).))))))))))))..)))....
mga ---------------------CUUUCUACACAGGUUGGGAUCAGUUGCAAUGCU-GUGCGUU--UCUGUGGUAUUGCACUUGUCCCGGCCUGUUGAGGUUGG------------------ UCSC ENSEMBL 1:158418201-158418279(-) -35.2 ...(((..((((((((((((.(((.(((((((..((......))..)))))))))).))))))))))))..)))....
tgu ---------------------CUUUCUACACAGGUUGGGAUCAGUUGCAAUGCU-GUGUGUG--UCUGUGGUAUUGCACUUGUCCCGGCCUGUUGAGGUUGG------------------ ENSEMBL 1:43202367-43202445(-) -35.3 ...(((..((((((((((((.(((.(((((((..((......))..)))))))))).))))))))))))..)))....
aca ---------------------CUUUCUACACAGGUUGGGAUUGGUUGCAAUGCU-GUCUAUGUGUAUGUGGUAUUGCACUUGUCCCGGCCUGUUGAGGUUGG------------------ UCSC ENSEMBL scaffold_82:3901635-3901715(-) -34.7 ...(((..((((((((((((.(((.(((((((((..((....))..)))))))))))).))))))))))))..)))....
xtr ---------------------CUUUCUGUAUAGGUUGGGAUUGGUUGCAAUGCU-GUACUAUU-UAUGUAGUAUUGCACUUGUCCCGGCCUGUUUAGGAUG------------------- miRbase UCSC ENSEMBL scaffold_740:85155-85232(-) -36.0 ..(((((.((((((((((((.(((.(((((((((((.......)))))))))))))).)))))))))))).)))))..
dre ---------------UGGUCCCUUUCUGCGCAGGUUGGGAUUGGUAGCAAUGCU-GUGUGUU--UUGAAGGUAUUGCACUUGUCCCGGCCUGUAAAGGAUUGU----------------- miRbase UCSC ENSEMBL 8:45338547-45338631(+) -36.9 .....(((((....((((((((((((.(((.((((((((............))))))))))).))))))))))))))))).....
gac -------------------------------AGGUUGGGAGAGGUAGCAAUGCU-CUGUACACAUG--UGGUAUUGCACUUGUCCCGGCCUGUUGAGGACAUG----------------- UCSC ENSEMBL groupXVI:9148123-9148192(+) -30.0 (((((((((.((((.((((((((.((....))...)))))))))))).)))))))))............
ola -------------------------------AGGUUGGGAGAGGUGGCAAUGCU-CUGUGCUUGGGG-UGGUAUUGCACUUGUCCCGGCCUGUUGAGGACA------------------- UCSC ENSEMBL 21:25693114-25693182(-) -30.2 (((((((((.(((((.(((((((((........)).)))))))))))).)))))))))..........
tru -------------------------------AGGUUGGGAGAGGUAGCAAUGCU-CAGAGAUUAUG--CGGUAUUGCACUUGUCCCGGCCUGUGGAGGAAGGA----------------- UCSC ENSEMBL scaffold_103:231885-231954(-) -30.7 (((((((((.((((.((((((((((.......)).)))))))))))).)))))))))............
tni -------------------------------AGGUUGGGAGAGGUAGCAAUGCU-CGGAGUUCAUG--UGGUAUUGCACUUGUCCCGGCCUGUGGAGGAAGAA----------------- UCSC ENSEMBL 2:12892725-12892794(+) -29.8 (((((((((.((((.((((((((((.......)).)))))))))))).)))))))))............
cin ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
csa ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
dme ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
cel ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
*** **** ** *** * ** ***********************
********* ** ******** * *********************** **
********* ** ******** * * *********************** **
********* ** ******** ** * * *********************** ***
********** ** ******** *** * * ************************* ***
** ** ********** ** ******** *** * * * ***************************** **
****** ** ********** ** ******** **** * * * ***************************** ***
****** ************* *********** **** * * * ***************************** ***
******************** *********** **** * * * ***************************** ****
******************** *********** **** * *** ***************************** ****
********************* *********** **** * *** ***************************** ****
********************* *********** ****** *** ***************************** ****
********************* *********** ****** **************************************
********************************* ****** **************************************
********************************* ******* **************************************
********************************* ******* **************************************
********************************* ******* **************************************
********************************* ******* **************************************
********************************* ******* **************************************
********************************* ******* **************************************
********************************* ******* **************************************
********************************* ******* **************************************
********************************* ******* **************************************
********************************* ******* **************************************
********************************* ******* **************************************
********************************* ******* **************************************
********************************* ******* **************************************
********************************* ******* **************************************
********************************* ******* **************************************
********************************* ******* **************************************
********************************* ******* **************************************
********************************* ******** **************************************
********************************* ******** **************************************
********************************* ******** **************************************
********************************* ***********************************************
********************************* ************************************************
************************************************************************************************************************