hsa ---------------UGGCCGAUUUUGGCACUAGCACAUUUUUGCUUG-UGUCUCUCCGCUCUGAGCAAUCAUGUGCAGUGCC-AAUAUGGGAAA-------------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 7:129414532-129414609(-) -34.4 ...((.((.((((((((.((((((..(((((((((......)))...))))))..)))))))))))))).)).))...
ptr ---------------UGGCCGAUUUUGGCACUAGCACAUUUUUGCUUG-UGUCUCUCCGCUCUGAGCAAUCAUGUGCAGUGCC-AAUAUGGGAAA-------------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 7:130195362-130195439(-) -34.4 ...((.((.((((((((.((((((..(((((((((......)))...))))))..)))))))))))))).)).))...
ggo ---------------UGGCCGAUUUUGGCACUAGCACAUUUUUGCUUG-UGUCUCUCCGCUCUGAGCAAUCAUGUGCAGUGCC-AAUAUGGGAAA-------------------------------- miRbase -34.4 ...((.((.((((((((.((((((..(((((((((......)))...))))))..)))))))))))))).)).))...
ppy ---------------UGGCCGAUUUUGGCACUAGCACAUUUUUGCUUG-UGUCUCUCCGCUCUGAGCAAUCAUGUGCAGUGCC-AAUAUGGGAAA-------------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 7:126690695-126690772(-) -34.4 ...((.((.((((((((.((((((..(((((((((......)))...))))))..)))))))))))))).)).))...
mml ---------------UGGCCGAUUUUGGCACUAGCACAUUUUUGCUUG-UGUCUCUCCGCUCUGAGCAAUCAUGUGCAGUGCC-AAUAUGGGAAA-------------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 3:167133802-167133879(-) -34.4 ...((.((.((((((((.((((((..(((((((((......)))...))))))..)))))))))))))).)).))...
cja ---------------UGGCCGAUUUUGGCACUAGCACAUUUUUGCUUU---UCUCUCCGCUCUGAGCAAUCAUGUGCAGUGCC-AAUAUGGGAAA-------------------------------- ENSEMBL Contig399:685353-685429(-) -32.62 ...((.((.((((((((.((((((..((((((.............))))))..)))))))))))))).)).))...
tsy ---------------UGGCCGAUUUUGGCACUAGCACAUUUUUGCUUG-UGUCUCUCCGCUCUGAGCAAUCAUGUGCAGUGCC-AAUAUGGGA---------------------------------- ENSEMBL scaffold_227141:3279-3355(+) -34.4 ...((.((.((((((((.((((((..(((((((((......)))...))))))..)))))))))))))).)).)).
mmr ---------------UGGCCGAUUUUGGCACUAGCACAUUUUUGCUUG-UGUCUCUCCGCUCUGAGCAAUCAUGUGCAGUGCC-AAUAUGGGAAA-------------------------------- ENSEMBL GeneScaffold_995:127862-127940(-) -34.4 ...((.((.((((((((.((((((..(((((((((......)))...))))))..)))))))))))))).)).))...
oga ---------------UGGCCGAUUUUGGCACUAGCACAUUUUUGCUUG-UGUCUCUCCGCUCUGAGCAAUCAUGUGCAGUGCC-AAUAUGGGAAA-------------------------------- ENSEMBL GeneScaffold_3052:311477-311555(-) -34.4 ...((.((.((((((((.((((((..(((((((((......)))...))))))..)))))))))))))).)).))...
tbe -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
cpo ---------------UGGCCGAUUUUGGCACUAGCACAUUUUUGCUUG-UGUCUCUCUGCUCUGAGCAAUCAUGUGCAGUGCC-AAUAUGGGAAA-------------------------------- UCSC ENSEMBL scaffold_11:50142178-50142256(-) -33.4 ...((.((.((((((((.((((((..((((((..((......))...))))))..)))))))))))))).)).))...
dor ---------------UGGCCAAUUUUGGCACUAGCACAUUUUUGCUUG-UGUCUC--CGCUCUGAGCAAUCAUGUGCAGUGCC-AAUAUGGGAAA-------------------------------- ENSEMBL scaffold_44916:4458-4534(+) -32.9 ...(((...((((((((.((((((..(((((((((....)))...))))))..))))))))))))))..)))....
mmu CCAGUACCAUCUGCUUGGCCGAUUUUGGCACUAGCACAUUUUUGCUUG-UGUCUCUCCGCUGUGAGCAAUCAUGUGUAGUGCC-AAUAUGGGAAAAGCGGGCUGCUGC------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 6:30119446-30119551(-) -47.1 .(((((...(((((((..((.((.(((((((((.(((((..(((((((((......)))...))))))..)))))))))))))).)).))..))))))).))))).
rno CCAGUACCAUCUGCUUGGCCGAUUUUGGCACUAGCACAUUUUUGCUUG-UGUCUCUCCGCUCUGAGCAAUCAUGUGCAGUGCC-AAUAUGGGAAAAGCGGGCUGCUGC------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 4:57074891-57074996(-) -49.1 .(((((...(((((((..((.((.((((((((.((((((..(((((((((......)))...))))))..)))))))))))))).)).))..))))))).))))).
str ---------------UGGCCGAUUUUGGCACUAGCACAUUUUUGCUUG-UGUCUCUCCGCUCUGAGCAAUCAUGUGCAGUGCC-AAUAUGGGAAA-------------------------------- ENSEMBL GeneScaffold_5392:35527-35605(-) -34.4 ...((.((.((((((((.((((((..(((((((((......)))...))))))..)))))))))))))).)).))...
opr ---------------UGGCCGACUUUGGCACUAGCACAUUUUUGCUUG-UGUCUCUCCGCUCUGAGCAAUCAUGUGCAGUGCC-AAUAUGGGA---------------------------------- ENSEMBL scaffold_1670:128158-128234(-) -32.4 ...(((...((((((((.((((((..(((((((((......)))...))))))..))))))))))))))..)))..
ocu ---------------UGGCCGAUUUUGGCACUAGCACAUUUUUGCUUG-UGUCUCUCCGCUCUGAGCAAUCAUGUGCAGUGCC-AAUAUGGGAAA-------------------------------- ENSEMBL scaffold_22:34942373-34942451(-) -34.4 ...((.((.((((((((.((((((..(((((((((......)))...))))))..)))))))))))))).)).))...
bta CCACUACCGUCUGCUUGGCCGACUUUGGCACUAGCACAUUUUUGCUUG-UGUCUCUCCGCUCUGAGCAAUCAUGUGCAGUGCC-AAUAUGGGAAAAGCAGGAUGC---------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 4:96835689-96835791(-) -43.2 .......(((((((((..((....((((((((.((((((..(((((((((......)))...))))))..))))))))))))))....))..))))).)))).
ttr ---------------UGGCCGAUUUUGGCACUAGCACAUUUUUGCUUG-UGUCUCUCCGCUCUGAGCAAUCAUGUGCAGUGCC-AAUAUGGGA---------------------------------- ENSEMBL GeneScaffold_2149:527887-527963(-) -34.4 ...((.((.((((((((.((((((..(((((((((......)))...))))))..)))))))))))))).)).)).
vpa ----UACCAUCUGCUUGGCCGAUUUUGGCACUAGCACAUUUUUUGCUUGUGUCUCUCCGCUCUGAGCAAUCAUGUGCAGUGCCCAAUAUGGGAAAAGC----------------------------- ENSEMBL GeneScaffold_2208:587427-587521(-) -34.7 ........((((..((.((.((((((((.((((((...(((((((((......)))...))))))..)))))))))).)))).)).))..))))
ssc -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
cfa ----------CUGCUUGGCCGAUUUUGGCACUAGCACAUUUUUGCUUG-UGUCUCUCCGCUCUGAGCAAUCAUGUGCAGUGCC-AAUAUGGGAAAAGCGGG-------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 14:10022615-10022703(+) -44.6 ((((((..((.((.((((((((.((((((..(((((((((......)))...))))))..)))))))))))))).)).))..)))))).
fca ---------------UGGCCGAUUUUGGCACUAGCACAUUUUUGCUUG-UGUCUCUCCGCUCUGAGCAAUCAUGUGCAGUGCC-AAUAUGGGAAA-------------------------------- ENSEMBL GeneScaffold_1006:261538-261616(-) -34.4 ...((.((.((((((((.((((((..(((((((((......)))...))))))..)))))))))))))).)).))...
eca ---------------UGGCCGAUUUUGGCACUAGCACAUUUUUGCUUG-UGUCUCUCCGCUCUGAGCAAUCAUGUGCAGUGCC-AAUAUGGGAAA-------------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 4:84471772-84471849(-) -34.4 ...((.((.((((((((.((((((..(((((((((......)))...))))))..)))))))))))))).)).))...
mlu -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
pva ---------------UGGCCGAUUUUGGCACUAGCACAUUUUUGCUUG-UGUCUCUUCGCUCUGAGCAAUCAUGUGCAGUGCC-AAUAUGGGAAA-------------------------------- ENSEMBL GeneScaffold_801:166110-166188(-) -34.9 ...((.((.((((((((.((((((..(((((((((......)))...))))))..)))))))))))))).)).))...
eeu -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
sar ---------------UGGCCGAUUUUGGCACUAGCACAUUUUUGCUUG-UGUCUCUCCGCUCUGAGCAAUCAUGUGCAGUGCC-AAGAUGGGAAA-------------------------------- ENSEMBL scaffold_85843:894-972(+) -37.8 ...((.(((((((((((.((((((..(((((((((......)))...))))))..))))))))))))))))).))...
cho -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
ete ---------------UGGCCGAUUUUGGCACUAGCACAUUUUUGCUUG-UGUCUCUCCGCUCUGAGCAAUCAUGUGCAGUGCC-AAUAUGGGA---------------------------------- ENSEMBL GeneScaffold_1864:76349-76425(-) -34.4 ...((.((.((((((((.((((((..(((((((((......)))...))))))..)))))))))))))).)).)).
laf ---------------UGGCCGAUUUUGGCACUAGCACAUUUUUGCUUG-UGUCUCUCCGCUCUGAGCAAUCAUGUGCAGUGCC-AAUAUGGGA---------------------------------- ENSEMBL scaffold_5:99174115-99174191(-) -34.4 ...((.((.((((((((.((((((..(((((((((......)))...))))))..)))))))))))))).)).)).
pca ---------------UGGCCGAUUUUGGCACUAGCACAUUUUUGCUUG-UGUCUCUCCGCUCUGAGCAAUCAUGUGCAGUGCC-AAUAUGGGAAA-------------------------------- ENSEMBL scaffold_21780:25429-25507(+) -34.4 ...((.((.((((((((.((((((..(((((((((......)))...))))))..)))))))))))))).)).))...
meu ----------------------UUUUGGCACUAGCACAUUUUUGCUUC-UGUCUGUCUGCUCUGAGCAAUCAUGUGCAGUGCC-AAUAUGGGA---------------------------------- ENSEMBL Scaffold140915:3886-3955(+) -28.5 ..((((((((.((((((..((((((..((......))...))))))..)))))))))))))).......
mdo -----GAUGUCUGCUUGGCCCGUUUUGGCACUAGCACAUUUUUGCUUC-UGUCUCUCUGCUCUGAGCAAUCAUGUGUAGUGCC-AAUAUGGGAAAAGCAAGAUG----------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 8:189667847-189667943(-) -45.4 ...((((((((..(((((.(((((((((.(((((..((((((..((......))...))))))..)))))))))))))).)))))..)))).)))).
oan GUGGAGAUGUCUGCUUGGCCUCUUUUGGCACUAGCACAUUUUUGCUUUUGUCUCUCUGC-UCUGAGCAAUCAUGUGUAGUGCC-AAUAUGGGAAAAGCUGGAAUUGUCAGC---------------- miRbase UCSC ENSEMBL 10:4568763-4568871(-) -41.1 .....(((.(((((((..(((...(((((((((.(((((..((((((..((......))...))))))..))))))))))))))...)))..)))).)))...)))...
gga -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
mga -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
tgu -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
aca -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
xtr ----------------GGCCUGCUUUGGCACUAGCACAUUUUUGCUUU-UGUACAUAUACUUUGAGCAAUUAUGUGUAGUGCC-AAUAUAGGA---------------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL scaffold_11:1014994-1015068(-) -35.0 ..((((..(((((((((.(((((..((((((..(((....)))...))))))..))))))))))))))..)))).
dre GCUGGGCGCUCUUCUUUGCCUGUUUUGGCACUAGCACAUUUUUGCUUU-UUUAUAUAUACCUUGAGCAAUUAUGUGUAGUGCC-AAUAUGGGACAAGACAGACAUGCUACUUAAAAAAAAAAUCAGC miRbase UCSC ENSEMBL 4:14885124-14885248(+) -41.42 ((((((((.(((((((..(((((.(((((((((.(((((..((((((...............))))))..)))))))))))))).)))))..)))).)))..))))...............))))
gac -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
ola --------------------CGUUUUGGCACUAGCACAUUUUUGCUUUUCUUUCUUGCUGUCUGAGCAAUCAUGUGUGGUGCC-AAUAUGGGA---------------------------------- UCSC ENSEMBL 6:16407514-16407586(-) -27.49 (((.(((((((((.(((((..((((((................))))))..)))))))))))))).)))...
tru -------------------CCAUUUUGGCACUAGCACAUUUUUG-UUUCGUUUCCUGCUGUUUGAGCAAUCAUGUGUAGUGCC-AAUAUGGGA---------------------------------- UCSC ENSEMBL scaffold_105:462258-462330(+) -28.4 ((((.(((((((((.(((((..(((((.((............)))))))..)))))))))))))).))))..
tni ---------------UUGCCCAUUUUGGCACUAGCACAUUUUUGCUUC-UGUAUAUAUACUUUGAGCAAUUAUGUGUAGUGCC-AAUAUAGGAGA-------------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 19:3385386-3385463(-) -31.3 ...((.((.(((((((((.(((((..((((((..(((....)))...))))))..)))))))))))))).)).))...
cin -----------------------UUUGGCACUUGCACAAUAUUGAUUC-GACGUAUCAAUUCUGGACAAGUGCCUAC-------------------------------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL scaffold_36:550854-550906(+) -20.9 ...((((((((..((..((((((.......))))))..))..))))))))...
csa -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
dme -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
cel -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
********* ***** * ** * ** *** *
********************* ** * ******** ***** ***** ** ** ***
********************* ** * * * ******** ***** ****** ***** ***
* ************************ * * * ******** ***** ****** *********
*** ************************* * * * ** ************** ****** *********
* *** ************************* * * * * ***************** ****** *********
***** ************************* *** * * ***************** ****** *********
***** ************************** ******* ****************** ****** *********
***** ************************** ********************************** *********
***** ************************** ********************************** *********
******************************** ********************************** ********* *
********************************* ********************************** ********* *
********************************* ********************************** ***********
********************************* ********************************** ***********
********************************* ********************************** ***********
********************************* ********************************** ***********
********************************* ********************************** ***********
********************************* ********************************** ***********
********************************* ********************************** ***********
********************************* ********************************** ***********
********************************* ********************************** ***********
********************************* ********************************** ***********
********************************* ********************************** ***********
********************************* ********************************** ***********
********************************* ********************************** ***********
********************************* ********************************** ***********
********************************* ********************************** ***********
********************************* ********************************** ***********
** *********************************** ********************************** *************
*************************************** ********************************** ************** *
*************************************** ********************************** ************** *
* *************************************** ********************************** ************** **
* ***** *************************************** ********************************** ************** *****
************************************************ ********************************** ********************* *
*********************************************************************************** *************************
*******************************************************************************************************************************