hsa ---------AGGAUUCUGCUCAUGCCAGGGUGAGGUAGUAAGUUGUAUUGUUGUG--GGGUAGGGAUAUUAGG--CCCCAAUUAGAAGAUAACUAUACAACUUACUACUUUCCCUGGUGUGUGGCAUAUUCA-------------------- miRbase UCSC ENSEMBL X:53583184-53583302(-) -57.0 .((((..((((((((((((((.(((((((((((((((((.((((((((((...........)))))).........)))).))))))))))))))))))))))))))).)))).)))). ptr ---------AGGAUUCUGCUCAUGCCAGGGUGAGGUAGUAAGUUGUAUUGUUGUG--GGGUAGGGAUAUUAGG--CCCCAAUUAGAAGAUAACUAUACAACUUACUACUUUCCCUGGUGUGUGGCAUAUUCA-------------------- miRbase UCSC ENSEMBL X:53983535-53983653(-) -57.0 .((((..((((((((((((((.(((((((((((((((((.((((((((((...........)))))).........)))).))))))))))))))))))))))))))).)))).)))). ggo -----------------------------GUGAGGUAGUAAGUUGUAUUGUUGUG--GGGUAGGGAUAUUAGG--CCCCAAUUAGAAGAUAACUAUACAACUUACUACUUUCC--------------------------------------- miRbase -31.4 ..(((((((((((((((((.((((((((((...........)))))).........)))).))))))))))))))))).. ppy -----------------------------GUGAGGUAGUAAGUUGUAUUGUUGUG--GGGUAGGGAUAUUAGG--CCCCAAUUAGAAGAUAACUAUACAACUUACUACUUUCC--------------------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL X:53953964-53954043(-) -31.4 ..(((((((((((((((((.((((((((((...........)))))).........)))).))))))))))))))))).. mml -----------------------------GUGAGGUAGUAAGUUGUAUUGUUGUG--GGGUAGGGAUAUUAGG--CCCCAAUUAGAAGAUAACUAUACAACUUACUACUUUCC--------------------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL X:51872188-51872267(-) -31.4 ..(((((((((((((((((.((((((((((...........)))))).........)))).))))))))))))))))).. cja ---------AGGAUUCUGCUCAUGCCAGGGUGAGGUAGUAAGUUGUAUUGUUGUG--GGGUAGGGAUAUUAGG--CCCCAAUUAGAAGAUAACUAUACAACUUACUACUUUCCCUGGUGUGUGGCAUAUUCA-------------------- ENSEMBL Contig454:712839-712958(-) -57.0 .((((..((((((((((((((.(((((((((((((((((.((((((((((...........)))))).........)))).))))))))))))))))))))))))))).)))).)))). tsy ---------------CUGCUCAUGCCGGGGUGAGGUAGUAAGUUGUAUUGUUGUG--GGGUAGGGAUAUUAGG--CCCCAAUUAGAAGAUAACUAUACAACUUACUACUUUCCCUGGUAUGUGGCAU------------------------- ENSEMBL GeneScaffold_1005:29616-29724(-) -54.9 .((((((((((((((.(((((((((((((((((.((((((((((...........)))))).........)))).))))))))))))))))))))))))))).)))). mmr -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- oga ---------------------AUGCCGGGGUGAGGUAGUAAGUUGUAUUGUUGUG--GGGUAGGGAUAUUAGA--CCCCAAUUAGAAGAUAACUAUACAACUUACUACUUUCCCUGGUGUG------------------------------- ENSEMBL GeneScaffold_632:64325-64421(-) -46.2 (((((((((.(((((((((((((((((.((((((((((...........)))))).........)))).)))))))))))))))))))))))))). tbe ---------------CUGCUCAUGCUGGGGUGAGGUAGUAAGUUGUAUUGUUGUG--GGGUUGGGAUUGUAGA--CCCCAAUUAGAAGAUAACUAUACAACUUACUACUUUCCCUGGUGUGUGGCAU------------------------- ENSEMBL GeneScaffold_6071:46244-46352(-) -52.7 .(((((((((..(((.(((((((((((((((((.(((((((((((.........))))))).........)))).))))))))))))))))))))..))))).)))). cpo ---------------------------GGGUGAGGUAGUAAGUUGUAUUGUUGUG--GGGUAAGGAUUUAAGG--CCCCAUUAAGAAGAUAACUAUACGACUUACUACUUUCCCUGGUGU-------------------------------- UCSC ENSEMBL scaffold_139:1795147-1795236(+) -37.2 (((.(((((((((((((((((.((((((((((...........))))))).........))).))))))))))))))))))))...... dor ---------------------------GGGUGAGGUAGUAAGUUGUAUUGUUGUG--GGGUAGGGAUUUUAGG--CCCCAAUAAGAAGAUAACUAUACAACUUACUACUUUCCUUGGUAUGUUGCAU------------------------- ENSEMBL GeneScaffold_820:25662-25758(-) -34.3 (((.(((((((((((((((((.((((((((((...........)))))).........)))).))))))))))))))))))))............. mmu ---------------CUGCACAUGCUGGGGUGAGGUAGUAAGUUGUAUUGUUGUG--GGGUAGGGAUUUUAGG--CCCCAGUAAGAAGAUAACUAUACAACUUACUACUUUCCUUGGUGUGUGGCAU------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL X:148347757-148347864(+) -50.1 .(((((((((..(((.(((((((((((((((((.((((((((((...........)))))).........)))).))))))))))))))))))))..)))))).))). rno ---------------CUGCACAUGCUGGGGUGAGGUAGUAAGUUGUAUUGUUGUG--GGGUAGGGAUUUUAGG--CCCCAAUAAGAAGAUAACUAUACAACUUACUACUUUCCCUGGUGUGUGGCAU------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL X:41377546-41377653(+) -52.0 .(((((((((..(((.(((((((((((((((((.((((((((((...........)))))).........)))).))))))))))))))))))))..)))))).))). str ---------------------------GGGUGAGGUAGUAAGUUGUAUUGUUGUG--GGGUAGGGAUUUUAGA--CCCCAAUAAGAAGAUAACUAUACAACUUACUACUUUCCCUGGUGUGUGGCAU------------------------- ENSEMBL GeneScaffold_467:184628-184724(-) -36.8 (((.(((((((((((((((((.((((((((((...........)))))).........)))).))))))))))))))))))))............. opr -------------------------------GAGGUAGUAGGUUGUGUGGUUUCA--GGG---CGGUGAUGUCGCCCC---UCAGCAGAUAACUAUACAGCCUACUGCCUUCCCUG------------------------------------ ENSEMBL scaffold_12764:4830-4907(+) -40.2 (((((((((((((((((((((((.(((.((((....))))))).....)).)))))))))))))))))))))..... ocu ---------------CUGCUCAUGCCGGGGUGAGGUAGUAAGUUGUAUUGUUGUG--GGGUAGGGAUUUUAGG--CCCCAAUAAGAAGAUAACUAUACAACUUACUACUUUCCCUGAUGUGUGGCAU------------------------- ENSEMBL scaffold_95:642041-642149(-) -48.1 .(((((((..(((((.(((((((((((((((((.((((((((((...........)))))).........)))).))))))))))))))))))))))..))).)))). bta ---------AGGACUCUGCUCAUGCUGGGGUGAGGUAGUAAGUUGUAUUGUUGUG--GGGUAGGGAUUUUAGG--CCCCAAUUUGAAGAUAACUAUACAACUUACUACUUUCCCUGGUGUGUAGCACAUUCA-------------------- miRbase UCSC ENSEMBL X:58737622-58737740(-) -53.0 .(((...(((((((((..(((.(((((((((((((((((.((((((((((...........)))))).........)))).))))))))))))))))))))..))))).))))..))). ttr --------------------CAUGCCGGGGUGAGGUAGUAAGUUGUAUUGUUGUG--GGGUAGGGAUUUUAAG--CCCCAAUUAGAAGAUAACUAUACAACUUACUACUUUCCCUGGUGUGUUGCAU------------------------- ENSEMBL GeneScaffold_393:78221-78324(-) -48.9 ((((((((((.(((((((((((((((((.((((((((((...........)))))).........)))).)))))))))))))))))))))))))))...... vpa ---------------------------GGGUGAGGUAGUAGAUUGUAUAGUUGUG--GGGUAGUGAUUUUA----CCCUGUUCAGGAGAUAACUAUACAAUCUAU----------------------------------------------- ENSEMBL scaffold_4276:43828-43900(-) -27.1 ..........((((((((((((((((((((((((.....))))))).........))))))))))))))))) ssc ---------------------------GGGUGAGGUAGUAAGUUGUAUUGUUGUG--GGGUAGGGAUUUUAGG--CCCCAAUUAGAAGAUAACUAUACAACUUACUACUUU----------------------------------------- miRbase ENSEMBL X:45719499-45719578(-) -31.3 ....(((((((((((((((((.((((((((((...........)))))).........)))).))))))))))))))))) cfa ------------------------------UGAGGUAGUAAGUUGUAUUGUUGUG--GGGUAGGGAUUUUAGG--CCCCAAUUAGAAGAUAACUAUACAACUUACUACUUUCCC-------------------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL X:45224013-45224092(-) -31.4 .(((((((((((((((((.((((((((((...........)))))).........)))).)))))))))))))))))... fca ---------------CUGCUCAUGCCGGGGUGAGGUAGUAAGUUGUAUUGUUGUG--GGGUAGGGAUUUUAGG--CCCCAAUUAGAAGAUAACUAUACAACUUACUACUUUCCCUGGUGUGUGGCAU------------------------- ENSEMBL GeneScaffold_583:45484-45592(-) -53.9 .((((((((((((((.(((((((((((((((((.((((((((((...........)))))).........)))).))))))))))))))))))))))))))).)))). eca ---------AGGAUUCUGCUCAUGCCAGGGUGAGGUAGUAAGUUGUAUUGUUGUG--GGGUAGGGAUUUUAGG--CCCCAAUUAGAAGAUAACUAUACAACUUACUACUUUCCCUGGUGUGUGGCAUAUUCA-------------------- miRbase UCSC ENSEMBL X:44776534-44776652(+) -57.0 .((((..((((((((((((((.(((((((((((((((((.((((((((((...........)))))).........)))).))))))))))))))))))))))))))).)))).)))). mlu ---------------CUGCUCAUGCCGGGGUGAGGUAGUAAGUUGUAUUGUUGUGUGGGGUAGGGAUUUAAGG--CCCCAAUA-GAAGAUAACUAUACAACUUACUACUUUCCCUGGUGUGUGGCAU------------------------- ENSEMBL GeneScaffold_503:258737-258846(-) -55.5 .((((((((((((((.(((((((((((((((((.(((((.((((((...........)))))).......))))).))))))))))))))))))))))))))).)))). pva ---------------------------GGGUGAGGUAGUAAGUUGUAUUGUUGUG--GGGUAGGGAUUUUAAG--CCCCAAUUAGAAGAUAACUAUACAACUUACUACUUUCCCUGGUGUGUGGCAU------------------------- ENSEMBL GeneScaffold_476:19653-19749(-) -37.0 (((.(((((((((((((((((.((((((((((...........)))))).........)))).))))))))))))))))))))............. eeu ---------------------------GGGUGAGGUAGUAAGUUGUAUUGUUGUG--GGGUAGGGAUUUUAGA--CCCCAAUUAGAAGAUAACUAUACAACUUACUACUUUCCCUGGUGUGUGGCAU------------------------- ENSEMBL GeneScaffold_1059:35151-35247(-) -36.8 (((.(((((((((((((((((.((((((((((...........)))))).........)))).))))))))))))))))))))............. sar ---------------------------GGGUGAGGUAGUAAGUUGUAUUGUUGUG--GGGUAGGGAUUUUAGA--CCCCAAUUAGAAGAUAACUAUACAACUUACUACUUUCCCUGGUGU-------------------------------- ENSEMBL GeneScaffold_848:74847-74936(-) -36.8 (((.(((((((((((((((((.((((((((((...........)))))).........)))).))))))))))))))))))))...... cho ---------------CUGCUCAUGCCGGGGUGAGGUAGUAAGUUGUAUUGUUGUG--GGGUAGGGAAUUUAGG--CCCCAAUUAGCAGAUAACUAUACAACUUACUACUUUCCCUGAUAUG------------------------------- ENSEMBL GeneScaffold_991:29003-29105(-) -42.6 .....((((.(((((.(((((((((((((((((.((((((((((...........)))))).........)))).)))))))))))))))))))))).)))) ete ------------------------CCAAGGUGAGGUAGUAAGUUGUAUUGUUGUG--GGGUAGGGAUUUUAGG--CCCCAAUUAGAAGAUAACUAUACAACCUACUACUUUCCUUGGCAUGUGGCA-------------------------- ENSEMBL GeneScaffold_998:24166-24264(-) -37.3 ((((((.(((((((((.(((((((.((((((((((...........)))))).........)))).))))))).)))))))))))))))......... laf ---------------CUGCUCAUGCCGGAGUGAGGUAGUAAGUUGUAUUGUUGUG--GGGUAGGGAUUUUAGG--CCCCAAUUAGAAGAUAACUAUACAACCUACUACUUUCCCUGGUGUGUGGCAU------------------------- ENSEMBL scaffold_85:1927474-1927582(-) -42.5 .((((((((((((...(((((((((.(((((((.((((((((((...........)))))).........)))).))))))).)))))))))..)))))))).)))). pca ---------------------------GGGUGAGGUAGUAAGUUGUAUUGUUGCU--GGGUAGAGAUUUUAGG--CCCCAAUUAGAAGAUAACUAUACAACCUACUACUUUCCCUGGUGUGUGGCAU------------------------- ENSEMBL GeneScaffold_934:44196-44292(-) -29.0 (((.(((((((((.(((((((.((((((((((...........))))........)).)))).))))))).))))))))))))............. meu -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- mdo -----------------------------GUGAGGUAGUAGAUUGUAUAGUUGUG--GGGUAGUGAUUUUA----CCCUGUUCAGGAGAUAACUAUACAAUCUAU----------------------------------------------- UCSC ENSEMBL 6:256412486-256412556(-) -27.1 ........((((((((((((((((((((((((.....))))))).........))))))))))))))))) oan UCGUAAGCUGUCAGUGUGCCCAUGCUGGGAUGAGGUAGUAAGUUGUAUUGUUGUG--GGGUAGGGAUUUCUUUUGCCCCAAUUAGC-GAUAACUAUACAAUUUACUACUUUCCCCAGUGUGUGGAACGAUCACUGGGUCCUAGUGUAACCGA miRbase UCSC ENSEMBL Ultra403:71661-71809(-) -59.1 (((...((((((((((..(((((((((((..(((((((((((((((((.((((((((((((((.....))))))))))........)))).))))))))))))))))).))))))))).))......))))))....)))).....))) gga -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- mga -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- tgu -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- aca ---------------------------GGGUGAGGUAGUAAGUUGUAUUGUUGUG--GGGUAGGGAUUUGUGC--CCCAAAUCAGA-GAUAACUAUACAACUUACUACUUUCCCU------------------------------------- UCSC ENSEMBL scaffold_481:462121-462204(+) -38.7 (((.(((((((((((((((((.(((((((((((........))))))).........)))).)))))))))))))))))))). xtr --------------UCUGCCCUCUUCAGGAUGAGGUAGUAAGUUGUAUUGUUGUG--GGG----GUUUUUAUUUCCCCAAAUUAGGAGAUAACUAUACAGCUUACUGCCUUCCCUGCAGCAUGGUAAU------------------------ miRbase UCSC ENSEMBL scaffold_507:538440-538547(-) -45.1 ..((((..((.((((..(((((((((((((((((.((((((((((........))))))..........)))).))))))))))))))))).)))).))...)))).. dre -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- gac -------------------------------GAGGUAGUAAGUUGUGUUGUUGUU--GGG-AUCAUGAUUGUGCACCCUGUUCAGGAGAUAACUAUACAACUUACUGCCUUCC--------------------------------------- UCSC ENSEMBL groupXII:10902277-10902356(+) -31.9 (((((((((((((((((.(((((((((..(((....)))..))).........)))))).))))))))))))))))).. ola -------------------------------GAGGUAGUAAGUUGUGUUGUUGUU--GGGGAUCAAGUAUGUGCACCCCGCUCAGGAGAUAACUAUACAACUUACUGCCUUCC--------------------------------------- UCSC ENSEMBL 7:11992939-11993019(+) -33.7 (((((((((((((((((.((((((((((..((......))..))))........)))))).))))))))))))))))).. tru -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- tni -------------------------------GAGGUAGUAAGUUGUGUUGUUGUU--GGGGAUCAAGAUUGUGCACCCUGUCAAGGAGAUAACUAUACAACUUACUGCCUUCC--------------------------------------- UCSC ENSEMBL 9:3596440-3596520(+) -32.0 (((((((((((((((((.((((((((((..((......))..))))........)))))).))))))))))))))))).. cin -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- csa -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- dme -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- cel -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ********* **** * *** *** *** * *********** ** ********* **** * **** *** *** * * ************ ** ********* ***** * ***** *** *** * ** ************** **** * ** *************** ******* *** * ** * *** * ** *************** **** * **** ************************ *** * *** ** *** * ** *************** **** * **** ************************* ***** *** ** *** * ** *************** **** * **** ************************* ****** *** *** *** * * ** ******************** * **** ************************** ****** *** *** ***** * ** *************************** ************************** ********** *** ******* ** *************************** ************************** ********** *** ******* ****************************** **************************** ********** **** ******* ****************************** **************************** **************** ******* ****************************** * **************************** **************** ******* ********************************* **************************** **************** ******* ********************************* * **************************** **************** ***************************************** * * **************************** **************** ******************************************* ** **************************** **************** *********************************************** * * **************************** **************** *********************************************** * * **************************** **************** *********************************************** *** **************************** **************** *************************************************** * **************************** **************** **************************************************** ***** **************************** **************** **************************************************** *** ***** **************************** **************** **************************************************** **** ***** **************************** **************** **************************************************** **** ****** **************************** **************** **************************************************** **** *********************************** **************** **************************************************** **************************************** **************** **************************************************** **************************************** **************** **************************************************** **************************************** **************** **************************************************** **************************************** **************** **************************************************** **************************************** **************** **************************************************** ***************************************** **************** **************************************************** * ***************************************** **************** **************************************************** *** **** ***************************************** **************** ********************************************************* ********************************************** **************** ********************************************************* ********************************************** *************************************************************************** ********************************************** *************************************************************************** ********************************************************************************************************************************************************