hsa -CCCAUUGGCAUAAACCCGUAGAUCCGAUCUUGUGGUGAAGUGGACCGCACAAGCUCGCUUCUAUGGGUCUGUGUCAGUGUG----- miRbase UCSC ENSEMBL 21:17911409-17911489(+) -39.6 ..((((((((((.(((((((((..(((.((((((.((........)))))))).)))..))))))))).))))))))))..
ptr -CCCAUUGGCAUAAACCCGUAGAUCCGAUCUUGUGGUGAAGUGGACCGCACAAGCUCGCUUCUAUGGGUCUGUGUCAGUGUG----- miRbase UCSC ENSEMBL 21:16639004-16639084(+) -39.6 ..((((((((((.(((((((((..(((.((((((.((........)))))))).)))..))))))))).))))))))))..
ggo -CCCAUUGGCAUAAACCCGUAGAUCCGAUCUUGUGGUGAAGUGGACCGCACAAGCUCGCUUCUAUGGGUCUGUGUCAGUGUG----- miRbase -39.6 ..((((((((((.(((((((((..(((.((((((.((........)))))))).)))..))))))))).))))))))))..
ppy -CCCAUUGGCAUAAACCCGUAGAUCCGAUCUUGUGGUAAAGUGGACCGCACAAGCUCGCUUCUAUGGGUCUGUGUCAGUGUG----- miRbase UCSC ENSEMBL 21:16252606-16252686(+) -38.7 ..((((((((((.(((((((((..(((.((((((((.......))))))..)).)))..))))))))).))))))))))..
mml -CCCAUUGGCAUAAACCCGUAGAUCCGAUCUUGUGGUGAAGUGGACCGCACAAGCUCGCUUCUAUGGGUCUGUGUCAGUGUG----- miRbase UCSC ENSEMBL 3:30363532-30363612(-) -39.6 ..((((((((((.(((((((((..(((.((((((.((........)))))))).)))..))))))))).))))))))))..
cja -CCCAUUGGCAUAAACCCGUAGAUCCGAUCUUGUGGUGAAGUGGACCGCACAAGCUCGCUUCUAUGGGUCUGUGUCAGUGUG----- ENSEMBL Contig147:2499381-2499462(+) -39.6 ..((((((((((.(((((((((..(((.((((((.((........)))))))).)))..))))))))).))))))))))..
tsy ---CAUUGGCAUAAACCCGUAGAUCCGAUCUUGUGGUGAACUGGACCGCACAAGCUCGCUUCUAUGGGUCUGUGUCAGUGUG----- ENSEMBL scaffold_43:41614-41693(+) -39.3 ((((((((((.(((((((((..(((.((((((.((........)))))))).)))..))))))))).))))))))))..
mmr -CCCAUUGGCAUAAACCCGUAGAUCCGAUCUUGUGGUAAAGUGGACCGCACAAGCUCGCUUCUAUGGGUCUGUGUCAGUG------- ENSEMBL scaffold_3475:114332-114411(+) -38.1 ..((((((((((.(((((((((..(((.((((((((.......))))))..)).)))..))))))))).))))))))))
oga -CCCAUUGGCAUAAACCCGUAGAUCCGAUCUUGUGGUGAAGUGGACCGCACAAGCUCGCUUCUAUGGGUCUGUGUCAGUGUG----- ENSEMBL GeneScaffold_5588:743670-743751(+) -39.6 ..((((((((((.(((((((((..(((.((((((.((........)))))))).)))..))))))))).))))))))))..
tbe -----UUGGCAUAAACCCGUAGAUCCGAUCUUGUGGUGAAGUGGACCGCACAAGCUCGCUUCUAUGGGUCUGUGUCAGUGUG----- ENSEMBL GeneScaffold_2862:84618-84695(-) -35.3 ((((((((.(((((((((..(((.((((((.((........)))))))).)))..))))))))).))))))))....
cpo -----UUGGCAUAAACCCGUAGAUCCGAUCUUGUGGUAAAGUGGACGGCACAAGCUCGCUUCUAUGGGUCUGUGUCAAUGUG----- UCSC ENSEMBL scaffold_34:6525100-6525177(-) -34.22 ((((((((.(((((((((..(((.((((((.............)))))).)))..))))))))).))))))))....
dor -----UUGGCAUAAACCCGUAGAUCCGAUCUUGUGGUGAGGUGAACCUCACAAGCUCGCUUCUAUGGGUCUGUGUCAGUGUG----- ENSEMBL scaffold_3940:65480-65557(+) -39.1 ((((((((.(((((((((..(((.(((((...((((....))))))))).)))..))))))))).))))))))....
mmu ---------CAUAAACCCGUAGAUCCGAUCUUGUGGUGAAGUGGACCGCGCAAGCUCGUUUCUAUGGGUCUGUG------------- miRbase UCSC ENSEMBL 16:77599181-77599245(+) -29.1 ((((.(((((((((..(((.((((((.((........)))))))).)))..))))))))).))))
rno -CCCAUUGGCAUAAACCCGUAGAUCCGAUCUUGUGGUGAAGUGGACCGCACAAGCUCGUUUCUAUGGGUCUGUGGCAGUGUG----- miRbase UCSC ENSEMBL 11:16397544-16397624(+) -38.7 ..(((((.((((.(((((((((..(((.((((((.((........)))))))).)))..))))))))).)))).)))))..
str -CCCAUUGGCAUAAACCCGUAGAUCCGAUCUUGUGGUGAAAUGGACCGCACAAGCUCGCUUCUAUGGGUCUGUGUCAGUGUG----- ENSEMBL scaffold_143154:4746-4827(+) -39.6 ..((((((((((.(((((((((..(((.((((((.((........)))))))).)))..))))))))).))))))))))..
opr ---------------------------------------------------------------------------------------
ocu -CCCAUUGGCAUAAACCCGUAGAUCCGAUCUUGUGGUGAAGUGGACCGCACAAGCUCGCUUCUAUGGGUCUGUGUCAGUGUG----- ENSEMBL scaffold_7:49080655-49080736(+) -39.6 ..((((((((((.(((((((((..(((.((((((.((........)))))))).)))..))))))))).))))))))))..
bta -CCCAUUGGCAUAAACCCGUAGAUCCGAUCUUGUGGUGAAGUGGACCGCACAAGCUCGCUUCUAUGGGUCUGUGUCAGUGUG----- miRbase UCSC ENSEMBL 1:20136963-20137043(-) -39.6 ..((((((((((.(((((((((..(((.((((((.((........)))))))).)))..))))))))).))))))))))..
ttr ---------------------------------------------------------------------------------------
vpa -CCCAUUGGCAUAAACCCGUAGAUCCGAUCUUGUGGUGAAGUGGACCGCACAAGCUCGCUUCUAUGGGUCUGUGUCAGUGUG----- ENSEMBL GeneScaffold_3300:2899368-2899449(+) -39.6 ..((((((((((.(((((((((..(((.((((((.((........)))))))).)))..))))))))).))))))))))..
ssc --CCAUUGGCAUAAACCCGUAGAUCCGAUCUUGUGGUGAAGUGGACCGCACAAGCUCGCUUCUAUGGGUCUGUGUCAGUGUG----- miRbase ENSEMBL 13:130664295-130664374(+) -39.6 .((((((((((.(((((((((..(((.((((((.((........)))))))).)))..))))))))).))))))))))..
cfa -CCCAUUGGCAUAAACCCGUAGAUCCGAUCUUGUGGUGAAGUGGACGGCACAAGCUCGCUUCUAUGGGUCUGUGUCAGUGUG----- UCSC ENSEMBL 31:16268317-16268398(+) -41.2 ..((((((((((.(((((((((..(((.((((((.((.......)).)))))).)))..))))))))).))))))))))..
fca ---------------------------------------------------------------------------------------
eca ----GUUGCCACAAACCCGUAGAUCCGAACUUGUGGUGA--UAGUCCACACAAGCUUGUGUCUAUAGGUAUGUGUCUGUUAGGCAAU UCSC ENSEMBL 7:29549411-29549492(-) -27.9 (((((((((.(((..((((..(((.((((((.((......)))))))).)))..))))..))).)))........))))))
mlu -CCCAUUGGCAUAAACCCGUAGAUCCGAUCUUGUGGUGAAGUGGACCGCACAAGCUCGCUUCUAUGGGUCUGUGUCAGUGUG----- ENSEMBL scaffold_173910:57665-57746(+) -39.6 ..((((((((((.(((((((((..(((.((((((.((........)))))))).)))..))))))))).))))))))))..
pva -CCCAUUGGCAUAAACCCGUAGAUCCGAUCUUGUGGUGAAGUGGACCGCACAAGCUCGCUUCUAUGGGUCUGUGUCAGUGUG----- ENSEMBL scaffold_3092:21870-21951(+) -39.6 ..((((((((((.(((((((((..(((.((((((.((........)))))))).)))..))))))))).))))))))))..
eeu -CCCAUUGGCAUAAACCCGUAGAUCCGAUCUUGUGGUGAAGUGGACGGCACAAGCUCGCUUCUAUGGGUCUGUGUCAGUGUG----- ENSEMBL scaffold_341065:36819-36900(-) -41.2 ..((((((((((.(((((((((..(((.((((((.((.......)).)))))).)))..))))))))).))))))))))..
sar -CCCAUUGGCAUAAACCCGUAGAUCCGAUCUUGUGGUAAAGUGGACAGCACAAGCUCGCUUCUAUGGGUCUGUGUCAGUGUG----- ENSEMBL scaffold_247634:5056-5137(-) -38.22 ..((((((((((.(((((((((..(((.((((((.............)))))).)))..))))))))).))))))))))..
cho -CCCAUUGGCAUAAACCCGUAGAUCCGAUCUUGUGGUGAAGUGAACCGCACAAGCUCGCUUCUAUGGGUCCGUGUCAGUG------- ENSEMBL scaffold_3684:26464-26543(+) -37.4 ..(((((((((..(((((((((..(((.((((((.((........)))))))).)))..)))))))))..)))))))))
ete ---------------------------------------------------------------------------------------
laf -CCCAUUGGCAUAAACCCGUAGAUCCGAUCUUGUGGUGAAGUGAACCGCACAAGCUCGCUUCUAUGGGUCUGUGUCAGUGUG----- ENSEMBL scaffold_13:39383943-39384024(-) -39.6 ..((((((((((.(((((((((..(((.((((((.((........)))))))).)))..))))))))).))))))))))..
pca -CCCACUGGCAUAAACCCGUAGAUCCGAUCUUGUGGUAAAGUGGACGGCACAAGCUCGCUUCUAUGGGUCUGUGUGAGUG------- ENSEMBL scaffold_12582:9733-9812(+) -36.72 ..((((.(((((.(((((((((..(((.((((((.............)))))).)))..))))))))).))))).))))
meu ------UGGUACAAACCCGUAGAUCCGAUCUUGUGGUGAAAUUGACUUCACAAGCUCGCCUCUUUGGGUCUGUGUCAGUGU------ ENSEMBL Scaffold54173:11113-11188(-) -27.7 ((..(((.(((((.(((..(((.(((((((...........))))))).)))..))).))))).)))..))....
mdo ---------------------------------------------------------------------------------------
oan ---------------------------------------------------------------------------------------
gga -CCAAUUGGCAUAAACCCGUAGAUCCGAUCUUGUGUUGAAAUGCACUGCACAAGCUCGCUUCUAUGGGUCUGUGUCAGUAUG----- miRbase UCSC ENSEMBL 1:102424333-102424413(+) -37.8 ...(((((((((.(((((((((..(((.(((((((...........))))))).)))..))))))))).)))))))))...
mga ----AUUGGCAUAAACCCGUAGAUCCGAUCUUGUGUUGAAACGCACUGCACAAGCUCGCUUCUAUGGGUCUGUGUCAGU-------- UCSC ENSEMBL 1:106116211-106116286(+) -36.8 (((((((((.(((((((((..(((.(((((((...........))))))).)))..))))))))).)))))))))
tgu ----AUUGGCAUAAACCCGUAGAUCCGAUCUUGUGUUGAAACGCACUGCACAAGCUCGCUUCUAUGGGUCUGUGUCAGUGUG----- ENSEMBL 1:109661968-109662046(+) -37.5 (((((((((.(((((((((..(((.(((((((...........))))))).)))..))))))))).)))))))))...
aca ----AUUGGCAUAAACCCGUAGAUCCGAUCUUGUGGUGAAGUAUAAUGCACAAGCUCGCUUCUAUGGGUCUGUGUC----------- UCSC ENSEMBL scaffold_477:351985-352057(-) -31.4 ...((((((.(((((((((..(((.((((((((........)).)))))).)))..))))))))).))))))
xtr ---------CAUAAACCCGUAGAUCCGAUCUUGUGGUGAAUUCCUUUGCUCAAGCUCGUUUCUAUGGGUCUGUGUCA---------- UCSC ENSEMBL scaffold_475:668724-668792(+) -29.1 ((((.(((((((((..(((.((((.((..((....))..)))))).)))..))))))))).))))...
dre ACCACUUGUCACAAACCCGUAGAUCCGAUCUUGUGGCGUAAUCGGCAACCCAAGCUCGAUUCUGUGGGUCUCUGUCACUGUGGU--- UCSC ENSEMBL 21:34458493-34458577(+) -30.1 (((((..((.(((.(((((((((..(((.((((((.((....)).))...)))).)))..)))))))))...))).)).)))))
gac -CCAUUUGGCACAAACCCGUAGAUCCGAUCUUGUGGCAAAUCUGACAGCACAAGCUCGCCUCUGUGGGUCUUUGUCAUUGUGGU--- UCSC ENSEMBL groupVII:12385895-12385978(+) -30.2 ((((.(((((...(((((((((..(((.((((((.((....))....)))))).)))..)))))))))...)))))..)))).
ola -CCAUUUGGCACAAACCCGUAGAUCCGAUCUUGUGGAAAAUCUGACGGCACAAGCUCGCCUCUGUGGGUCUCUGUCAGUGUGGU--- UCSC ENSEMBL 14:1151207-1151290(-) -30.02 ((((((((((...(((((((((..(((.((((((.............)))))).)))..)))))))))...)))))).)))).
tru ------UGCCACAAACCCGUAGAUCCGAACUUGUGGUGA--CUGGCCGCACAAGCUCGUAUCUAUAGGUAUGUGUCCGCCAGGCAA- UCSC ENSEMBL scaffold_6:2072094-2072172(+) -27.6 (((((((.(((..(((((.(((.((((((.((......)))))))).))).)))))..))).)))........)))).
tni ------UGCCACAAACCCGUAGAUCCGAACUUGUGGUGA--CUGGCCGCACAAGCUCGUAUCUAUAGGUAUGUGUCCGCU------- UCSC ENSEMBL 7:5619627-5619699(-) -27.2 .((((((.(((..(((((.(((.((((((.((......)))))))).))).)))))..))).))))...)).
cin ---------------------------------------------------------------------------------------
csa ---------------------------------------------------------------------------------------
dme ---------------------------------------------------------------------------------------
cel ---------------------------------------------------------------------------------------
* **************** ****** * ****** * *** * *** **
** **************** ****** * * ******** *** * *** * **
** ** **************** ****** * * * ******** *** * *** * ****
** ** ************************* * * ********** *** ************
** ** ************************* ** * *********** ****************
** ** ************************* ** ** *********** ***************** *
****** ************************* ** * ** *********** ********************
*********************************** * ** ********************************
*********************************** * *** *********************************
*********************************** ***** ********************************* *
*********************************** ***** ***********************************
*********************************** ***** ***********************************
************************************ ***** ***********************************
* ****************************************** ***********************************
** ******************************************************************************
** ******************************************************************************
*********************************************************************************
*********************************************************************************
*********************************************************************************
*********************************************************************************
*********************************************************************************
*********************************************************************************
*********************************************************************************
*********************************************************************************
*********************************************************************************
*********************************************************************************
*********************************************************************************
*********************************************************************************
*********************************************************************************
*********************************************************************************
*********************************************************************************
*********************************************************************************
*********************************************************************************
*********************************************************************************
**********************************************************************************
**********************************************************************************
***********************************************************************************
*************************************************************************************
***************************************************************************************